85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_6315 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  100 
 
 
109 aa  226  9e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  76.24 
 
 
110 aa  167  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  65.66 
 
 
114 aa  137  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  65.26 
 
 
119 aa  134  4e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  64.52 
 
 
122 aa  130  3.9999999999999996e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  56.86 
 
 
116 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  64.52 
 
 
122 aa  127  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  55.77 
 
 
114 aa  123  1e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  53.7 
 
 
115 aa  120  4e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  58.33 
 
 
126 aa  120  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  59.14 
 
 
121 aa  120  7e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  52.38 
 
 
118 aa  120  7e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  56.25 
 
 
126 aa  118  1.9999999999999998e-26  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  56.84 
 
 
133 aa  118  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  55.79 
 
 
120 aa  115  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  55.21 
 
 
105 aa  114  6e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  55.21 
 
 
132 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  53.12 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  53.12 
 
 
105 aa  112  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  54.17 
 
 
122 aa  112  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  55.79 
 
 
116 aa  110  8.000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  53.12 
 
 
138 aa  110  9e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  44.76 
 
 
110 aa  107  6e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  57.29 
 
 
136 aa  106  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  48.48 
 
 
115 aa  106  1e-22  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  48.48 
 
 
112 aa  102  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  46.15 
 
 
124 aa  101  4e-21  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  50 
 
 
111 aa  98.2  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  44.21 
 
 
148 aa  88.2  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  57.61 
 
 
118 aa  87  7e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  52.17 
 
 
139 aa  77  0.00000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  34.29 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  29.79 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  29.79 
 
 
102 aa  52  0.000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  29.79 
 
 
102 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  29.35 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  28.57 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  28.71 
 
 
113 aa  48.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  30 
 
 
142 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  26.73 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  28.71 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  26.73 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  26.73 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  26.73 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  26.73 
 
 
113 aa  47.4  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  24.75 
 
 
103 aa  47.4  0.00007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  25.71 
 
 
113 aa  47  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  23.76 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  26.73 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 
113 aa  45.1  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  26.73 
 
 
103 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  25.71 
 
 
113 aa  44.7  0.0004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  30.48 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  26.73 
 
 
103 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  26.26 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  24.27 
 
 
104 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  24.27 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  32.22 
 
 
102 aa  43.9  0.0008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  29.29 
 
 
101 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  26.53 
 
 
102 aa  42.7  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  31.11 
 
 
102 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  24.75 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  24.75 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  24.75 
 
 
103 aa  42.7  0.002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  24.51 
 
 
104 aa  41.6  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  26.04 
 
 
117 aa  42  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  23.76 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  23.76 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3835  hypothetical protein  29.9 
 
 
112 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.349662 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  23.76 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  23.76 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  23.76 
 
 
104 aa  41.6  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  24.49 
 
 
102 aa  40.8  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  30.43 
 
 
107 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0969  hypothetical protein  29.9 
 
 
109 aa  40.4  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>