36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_2841 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
102 aa  207  5e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  95.1 
 
 
102 aa  197  3e-50  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  60.78 
 
 
103 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  62.75 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  62.75 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  64.65 
 
 
102 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  60.78 
 
 
103 aa  137  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  60.78 
 
 
102 aa  135  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  60.78 
 
 
102 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  59.8 
 
 
102 aa  134  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  59.8 
 
 
102 aa  133  6.0000000000000005e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  60.78 
 
 
102 aa  133  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  48.98 
 
 
102 aa  106  1e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  40.59 
 
 
107 aa  85.5  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  40.59 
 
 
107 aa  85.1  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  30.61 
 
 
115 aa  52.8  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  30 
 
 
114 aa  52.8  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  27.96 
 
 
118 aa  50.4  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  27.08 
 
 
126 aa  49.7  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  28.57 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 
113 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  28.12 
 
 
122 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  32.14 
 
 
99 aa  48.9  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  26.26 
 
 
124 aa  47.4  0.00006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  26.04 
 
 
126 aa  47.4  0.00006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  31.11 
 
 
114 aa  47.4  0.00006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  28.72 
 
 
116 aa  47.4  0.00008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  29.29 
 
 
133 aa  47  0.00009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  30.49 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  31.11 
 
 
110 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  32.22 
 
 
109 aa  43.9  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  27.08 
 
 
119 aa  42.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  29.17 
 
 
102 aa  42  0.003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  26.67 
 
 
132 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  30.84 
 
 
102 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  29.67 
 
 
136 aa  40.4  0.009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>