113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2861 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  100 
 
 
116 aa  239  6e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  62.28 
 
 
118 aa  150  7e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  62.07 
 
 
114 aa  147  6e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3374  protein of unknown function DUF485  64.21 
 
 
119 aa  130  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6315  membrane protein-like protein  56.86 
 
 
109 aa  130  7.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.421326  normal  0.32672 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  64.89 
 
 
138 aa  127  3e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  56.19 
 
 
122 aa  128  3e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  54.72 
 
 
110 aa  128  3e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  59.18 
 
 
105 aa  125  2.0000000000000002e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3816  hypothetical protein  62.5 
 
 
121 aa  125  2.0000000000000002e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00911141 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  59.79 
 
 
126 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4507  hypothetical protein  56.36 
 
 
122 aa  124  5e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  58.33 
 
 
115 aa  123  7e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  57.89 
 
 
105 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  57.89 
 
 
105 aa  122  1e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  61.86 
 
 
116 aa  122  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  58.76 
 
 
126 aa  122  2e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5017  hypothetical protein  56.36 
 
 
122 aa  121  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000206604 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  53.92 
 
 
133 aa  119  9.999999999999999e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1074  protein of unknown function DUF485  55.88 
 
 
112 aa  115  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.111715  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  61.22 
 
 
136 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  52.63 
 
 
110 aa  113  8.999999999999998e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1813  protein of unknown function DUF485  51.85 
 
 
115 aa  112  2.0000000000000002e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  52.58 
 
 
114 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3658  protein of unknown function DUF485  53 
 
 
111 aa  108  3e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.285838  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  50.98 
 
 
124 aa  105  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0695  protein of unknown function DUF485  63.44 
 
 
118 aa  105  3e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0348  hypothetical protein  53.33 
 
 
120 aa  103  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.614159  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  50 
 
 
132 aa  99.8  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5173  protein of unknown function DUF485  47.52 
 
 
139 aa  73.6  0.0000000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2995  protein of unknown function DUF485  34.02 
 
 
148 aa  62.8  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.987637  normal  0.33193 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  34.02 
 
 
102 aa  60.1  0.000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  32.32 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  32.32 
 
 
102 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  32.32 
 
 
102 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  32.26 
 
 
102 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  33.33 
 
 
101 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  32.98 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  29.29 
 
 
102 aa  53.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  30.53 
 
 
102 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  29.7 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  29.47 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  30.53 
 
 
103 aa  51.2  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  29.79 
 
 
102 aa  51.6  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  31.25 
 
 
102 aa  51.2  0.000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  25.74 
 
 
104 aa  51.2  0.000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  30.85 
 
 
101 aa  50.8  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  29.47 
 
 
102 aa  50.4  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  29.47 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  29.47 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  27.37 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  29.47 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  29.47 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  29.47 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  27.37 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  30 
 
 
103 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  28.42 
 
 
103 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  30.34 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  30.34 
 
 
102 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  27.78 
 
 
103 aa  49.3  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  29.47 
 
 
103 aa  48.9  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  28.72 
 
 
102 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  28.42 
 
 
103 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  26.88 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  26.88 
 
 
102 aa  48.1  0.00004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  30.43 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  27.72 
 
 
101 aa  47.8  0.00005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  26.73 
 
 
107 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  28.72 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  26.32 
 
 
104 aa  46.6  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  29.67 
 
 
102 aa  46.6  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  23.71 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  26.73 
 
 
107 aa  46.6  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  31.11 
 
 
102 aa  45.8  0.0002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  26.37 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  22.77 
 
 
103 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  20.83 
 
 
104 aa  45.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  28.95 
 
 
101 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  21.78 
 
 
103 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  26.26 
 
 
113 aa  43.9  0.0006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  26.26 
 
 
113 aa  43.9  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  26.26 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  26.26 
 
 
113 aa  43.9  0.0006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  29.67 
 
 
102 aa  43.9  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  26.26 
 
 
113 aa  43.9  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  26.26 
 
 
113 aa  43.9  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  26.88 
 
 
102 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5645  hypothetical protein  26.89 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0407513  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0969  hypothetical protein  29.9 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5956  hypothetical protein  28.57 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03253  hypothetical protein  28.09 
 
 
105 aa  42.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  27.93 
 
 
142 aa  42.4  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  25.81 
 
 
113 aa  42.7  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  27.17 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3676  hypothetical protein  28.32 
 
 
128 aa  42  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.637378 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  21.21 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  21.21 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  26.61 
 
 
113 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  21.21 
 
 
104 aa  41.2  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>