60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1396 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1398  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
102 aa  209  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000243201  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1396  protein of unknown function DUF485  100 
 
 
102 aa  209  7e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000614043  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1069  hypothetical protein  88.12 
 
 
102 aa  191  4e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0761318  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0740  hypothetical protein  85.15 
 
 
102 aa  187  5e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000389397  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2353  hypothetical protein  83.17 
 
 
102 aa  185  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0438817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2698  protein of unknown function DUF485  79.41 
 
 
103 aa  185  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.16421e-16 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1518  protein of unknown function DUF485  79.41 
 
 
103 aa  184  4e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.0000000119739  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1071  hypothetical protein  83.17 
 
 
102 aa  184  5e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  decreased coverage  0.000981467  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1419  hypothetical protein  81.19 
 
 
102 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000259671  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1372  protein of unknown function DUF485  63.73 
 
 
102 aa  142  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000366615 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2841  protein of unknown function DUF485  62.75 
 
 
102 aa  138  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.708674  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1339  hypothetical protein  59.8 
 
 
102 aa  133  9.999999999999999e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3287  hypothetical protein  56.44 
 
 
102 aa  131  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2857  protein of unknown function DUF485  50.51 
 
 
107 aa  111  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1423  protein of unknown function DUF485  50.51 
 
 
107 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1160  protein of unknown function DUF485  31.68 
 
 
115 aa  63.2  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.280766  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0070  protein of unknown function DUF485  26.73 
 
 
118 aa  53.9  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1719  protein of unknown function DUF485  30.85 
 
 
113 aa  53.9  0.0000008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1761  hypothetical protein  33.33 
 
 
99 aa  53.9  0.0000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.0988774 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0144  hypothetical protein  34.15 
 
 
104 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1968  protein of unknown function DUF485  30.77 
 
 
122 aa  52  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.611939  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0828  protein of unknown function DUF485  29.79 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13330  predicted membrane protein  30.21 
 
 
136 aa  50.8  0.000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.221279  normal  0.152082 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4126  protein of unknown function DUF485  28.09 
 
 
132 aa  49.7  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2861  hypothetical protein  27.37 
 
 
116 aa  50.1  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.147308  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  33.68 
 
 
105 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  30.1 
 
 
104 aa  49.3  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1395  protein of unknown function DUF485  24.75 
 
 
126 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000134862 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  35.48 
 
 
142 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03070  predicted membrane protein  26.88 
 
 
110 aa  48.1  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.876945  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1725  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.370617  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0532  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.207769  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5184  hypothetical protein  37.5 
 
 
88 aa  47.8  0.00005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.401693  normal  0.159857 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  31.68 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  31.68 
 
 
102 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1634  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1479  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  47  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1776  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.298522  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1517  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.768712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1489  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0531536  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1702  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1377  hypothetical protein  23.76 
 
 
126 aa  46.6  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1329  hypothetical protein  26.26 
 
 
113 aa  45.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392251  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  26.97 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1522  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.351322  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12110  predicted membrane protein  22.92 
 
 
114 aa  43.9  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.185749  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3673  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.12005  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1671  hypothetical protein  25 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5151  protein of unknown function DUF485  28.79 
 
 
125 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  25.26 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  29 
 
 
104 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  34.29 
 
 
101 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  29.9 
 
 
103 aa  42  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  23.91 
 
 
116 aa  40.8  0.006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  28.26 
 
 
102 aa  40.8  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4283  hypothetical protein  26.88 
 
 
105 aa  40.8  0.007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06900  predicted membrane protein  23.96 
 
 
124 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  31.37 
 
 
103 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4129  hypothetical protein  25.81 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.660738 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4054  hypothetical protein  25.81 
 
 
105 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.785898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>