137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1334 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_1334  hypothetical protein  100 
 
 		 103 aa  211  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.628342  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1742  hypothetical protein  98.06 
 
 		 103 aa  209  7.999999999999999e-54  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3977  hypothetical protein  98.06 
 
 		 103 aa  209  1e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399436  normal  0.691653 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1292  hypothetical protein  95.15 
 
 		 103 aa  204  2e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1623  hypothetical protein  89.32 
 
 		 103 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3757  hypothetical protein  88.35 
 
 		 103 aa  193  6e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.100372  normal  0.0931684 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1607  hypothetical protein  86.41 
 
 		 103 aa  188  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.66445  normal  0.337405 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1890  hypothetical protein  75.73 
 
 		 103 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22340  hypothetical protein  74.76 
 
 		 103 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000829166 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_35040  hypothetical protein  63.73 
 
 		 104 aa  139  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.344498  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3836  hypothetical protein  61.17 
 
 		 103 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.408019  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3948  hypothetical protein  61.17 
 
 		 103 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.913691 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3922  hypothetical protein  61.17 
 
 		 103 aa  132  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0296  hypothetical protein  61.17 
 
 		 103 aa  129  1.0000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.624817  hitchhiker  0.00012934 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  62.14 
 
 		 103 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  60.19 
 
 		 103 aa  128  3e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  58.82 
 
 		 104 aa  124  5e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1578  protein of unknown function DUF485  52 
 
 		 104 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0630294  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0275  hypothetical protein  60.78 
 
 		 104 aa  111  3e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.279354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  50 
 
 		 102 aa  110  8.000000000000001e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1455  hypothetical protein  49.51 
 
 		 104 aa  105  2e-22  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603682  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3261  protein of unknown function DUF485  61.17 
 
 		 103 aa  104  4e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2953  hypothetical protein  53.26 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.091358 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3490  protein of unknown function DUF485  46.6 
 
 		 142 aa  101  4e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3376  protein of unknown function DUF485  59.22 
 
 		 103 aa  100  5e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202403  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4212  hypothetical protein  43.56 
 
 		 102 aa  98.2  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.227984  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2624  protein of unknown function DUF485  49.48 
 
 		 101 aa  97.8  4e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.845578 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25240  DUF485 family protein  44.9 
 
 		 109 aa  95.5  2e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.97063  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  48.42 
 
 		 104 aa  95.1  3e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3286  hypothetical protein  44.55 
 
 		 105 aa  95.1  3e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4784  protein of unknown function DUF485  46.74 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5209  protein of unknown function DUF485  46.74 
 
 		 102 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4011  hypothetical protein  42.57 
 
 		 106 aa  94.4  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0555  protein of unknown function DUF485  42.72 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.365765  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2432  hypothetical protein  43 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.30839  normal  0.492052 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0374  hypothetical protein  40 
 
 		 101 aa  90.9  5e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2866  acetate permease  40.2 
 
 		 666 aa  90.9  5e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0150163 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5782  hypothetical protein  38.61 
 
 		 101 aa  90.9  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.228793 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3781  hypothetical protein  46.15 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0534  hypothetical protein  41.58 
 
 		 102 aa  87  8e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0427  hypothetical protein  42.72 
 
 		 102 aa  86.3  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.0000000502052  hitchhiker  0.000888363 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0484  hypothetical protein  40.59 
 
 		 117 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2500  hypothetical protein  45 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000156501 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3878  hypothetical protein  39.81 
 
 		 102 aa  82.8  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.280009  normal  0.825542 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5872  hypothetical protein  40.86 
 
 		 101 aa  83.2  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4961  hypothetical protein  41.11 
 
 		 120 aa  82.8  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.249965  normal  0.222464 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0888  protein of unknown function DUF485  41.05 
 
 		 102 aa  82  0.000000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3141  hypothetical protein  38.83 
 
 		 102 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5645  hypothetical protein  38.95 
 
 		 120 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0407513  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6217  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1117  hypothetical protein  39.22 
 
 		 101 aa  79  0.00000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.130739  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0448  protein of unknown function DUF485  38 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0149641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0464  protein of unknown function DUF485  38 
 
 		 102 aa  79  0.00000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.946355 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2261  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0105984  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2875  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0959  hypothetical protein  35.92 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.567303 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03253  hypothetical protein  37.25 
 
 		 105 aa  76.6  0.0000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  42.39 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2886  hypothetical protein  39.6 
 
 		 101 aa  75.9  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.696327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  42.39 
 
 		 128 aa  75.9  0.0000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2792  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.14797  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  42.39 
 
 		 128 aa  76.3  0.0000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2930  hypothetical protein  40.59 
 
 		 101 aa  75.5  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.462047  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5956  hypothetical protein  37.86 
 
 		 102 aa  75.1  0.0000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1981  hypothetical protein  34.95 
 
 		 102 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  40.62 
 
 		 102 aa  73.9  0.0000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3230  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0638  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0206  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1387  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.586783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0454  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0474  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.585175  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2813  hypothetical protein  40.22 
 
 		 101 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5597  hypothetical protein  42.42 
 
 		 123 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.514691  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7092  hypothetical protein  55.22 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2796  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  70.9  0.000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00736684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3676  hypothetical protein  35.79 
 
 		 128 aa  69.7  0.00000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.637378 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3159  protein of unknown function DUF485  39.13 
 
 		 99 aa  69.3  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0397  hypothetical protein  39.13 
 
 		 101 aa  68.2  0.00000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1541  protein of unknown function DUF485  44.33 
 
 		 104 aa  64.7  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000112878  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4563  hypothetical protein  38.37 
 
 		 116 aa  63.9  0.0000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.973146  normal  0.560314 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0005  hypothetical protein  43.33 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.205658  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1020  protein of unknown function DUF485  33.33 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.104425  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2140  hypothetical protein  34.88 
 
 		 138 aa  61.6  0.000000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533174  normal  0.34536 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>