31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2737 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007951  Bxe_A2737  hypothetical protein  100 
 
 
124 aa  249  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.394683  normal  0.0713641 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3273  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2486  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.424644  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2623  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.310407 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2636  hypothetical protein  29.41 
 
 
102 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.236815  normal  0.0699685 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3742  hypothetical protein  36.78 
 
 
104 aa  47.4  0.00006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00462503  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0913  protein of unknown function DUF485  34.48 
 
 
103 aa  47  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.660786  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0684  hypothetical protein  34.48 
 
 
103 aa  45.8  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2786  protein of unknown function DUF485  30.23 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.991067  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2563  hypothetical protein  30.23 
 
 
128 aa  44.7  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3924  protein of unknown function DUF485  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03900  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.414489  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03940  conserved inner membrane protein involved in acetate transport  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.421971  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4587  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4530  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3959  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.406896 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4623  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4312  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5573  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  43.5  0.0009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3168  protein of unknown function DUF485  35.44 
 
 
114 aa  43.5  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0533569  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3376  protein of unknown function DUF485  32.53 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.202403  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0218  protein of unknown function DUF485  29 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3261  protein of unknown function DUF485  32.18 
 
 
103 aa  42.7  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2495  protein of unknown function DUF485  29.07 
 
 
128 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.501583 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0636  hypothetical protein  29.35 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0431531  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4669  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.489248  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4534  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4527  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4618  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.852789  normal  0.286158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4620  hypothetical protein  37.68 
 
 
104 aa  40.8  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2130  hypothetical protein  33.33 
 
 
110 aa  40.4  0.007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.733046  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>