207 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0020 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0020  DSBA oxidoreductase  100 
 
 		 211 aa  420  1e-117  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0024  DSBA oxidoreductase  84.54 
 
 		 211 aa  358  3e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6638  DsbA oxidoreductase  48.29 
 
 		 231 aa  181  6e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2508  DSBA oxidoreductase  42.08 
 
 		 225 aa  156  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00396553  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3550  DSBA oxidoreductase  45.1 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.916573  normal  0.901837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0641  DSBA oxidoreductase  41.31 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.109842 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2073  DSBA oxidoreductase  42.72 
 
 		 256 aa  151  8e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.232317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1717  DSBA oxidoreductase  40.38 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2174  DSBA oxidoreductase  40.98 
 
 		 209 aa  148  6e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0132146  hitchhiker  0.0000045366 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0258  DSBA oxidoreductase  40.58 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.494343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3082  DSBA oxidoreductase  39.22 
 
 		 216 aa  144  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.275459  normal  0.192023 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2694  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.268772 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1261  DSBA oxidoreductase  39.44 
 
 		 235 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.432726  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5431  DSBA oxidoreductase  40.85 
 
 		 213 aa  143  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.144454 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1398  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.928742 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0177  DSBA oxidoreductase  39.22 
 
 		 236 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2594  DSBA oxidoreductase  39.9 
 
 		 212 aa  141  6e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0704  DSBA oxidoreductase  38.46 
 
 		 235 aa  141  9e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1916  DSBA oxidoreductase  39.41 
 
 		 223 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.093015  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3756  DSBA oxidoreductase  39.91 
 
 		 221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.734213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1732  DSBA oxidoreductase  39.41 
 
 		 223 aa  139  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.474005 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01724  polyketide synthase  40.69 
 
 		 213 aa  138  7e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5000  DSBA oxidoreductase  36.23 
 
 		 233 aa  137  8.999999999999999e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.324442  normal  0.0420894 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2969  DSBA oxidoreductase  37.38 
 
 		 231 aa  137  1e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0234378  hitchhiker  0.0000221384 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2718  DSBA oxidoreductase  33.49 
 
 		 209 aa  137  1e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0752849  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0246  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  37.2 
 
 		 243 aa  136  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1488  DSBA oxidoreductase  34.78 
 
 		 234 aa  136  2e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0767657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5014  FrnE protein  37.2 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0127936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2369  polyketide biosynthesis associated protein  36.28 
 
 		 223 aa  135  3.0000000000000003e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1639  DSBA oxidoreductase  43.78 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0762303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1347  DSBA oxidoreductase  35.15 
 
 		 233 aa  135  3.0000000000000003e-31  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1557  putative DSBA oxidoreductase  35.85 
 
 		 222 aa  135  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.455666  normal  0.262117 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3441  DSBA oxidoreductase  41.63 
 
 		 215 aa  135  5e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.486771  normal  0.667437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0308  FrnE protein  36.71 
 
 		 243 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00686429  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0567  DSBA oxidoreductase  37.02 
 
 		 244 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1441  DSBA oxidoreductase  41.97 
 
 		 214 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0402577 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4389  DSBA oxidoreductase  38.5 
 
 		 221 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0887682  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3639  DSBA oxidoreductase  37.86 
 
 		 224 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0249  protein disulfide isomerase (S-S rearrangase)  36.71 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0768855  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2852  polyketide biosynthesis associated protein  41.97 
 
 		 214 aa  132  3e-30  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.456513  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03790  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  38.57 
 
 		 230 aa  132  3e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.288103  normal  0.160551 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5468  hypothetical protein  39.44 
 
 		 221 aa  132  3e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0301  protein disulfide isomerase  36.71 
 
 		 243 aa  132  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0252  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 243 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4882  DSBA oxidoreductase  42.03 
 
 		 229 aa  131  6e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1267  frnE protein  39.71 
 
 		 223 aa  131  6.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.454512  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0329  protein disulfide isomerase  36.23 
 
 		 243 aa  131  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00387004  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1398  DSBA oxidoreductase  37.98 
 
 		 237 aa  130  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394424  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2136  DSBA oxidoreductase  34.74 
 
 		 213 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.883465  normal  0.0421817 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1057  DSBA oxidoreductase  40.69 
 
 		 235 aa  130  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0941  DSBA oxidoreductase  37.5 
 
 		 240 aa  129  2.0000000000000002e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.203124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1700  DSBA oxidoreductase  37.86 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1502  DSBA oxidoreductase  40.1 
 
 		 214 aa  129  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0283596 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0515  DSBA oxidoreductase  34.26 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.727593  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0577  frnE protein, putative  38.12 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0543  dsba oxidoreductase  38.12 
 
 		 224 aa  127  1.0000000000000001e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0363  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2493  dithiol-disulfide isomerase  31.43 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0846  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 243 aa  126  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.96876  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0818  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 243 aa  126  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.115857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1200  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 237 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0301  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 214 aa  125  5e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.220851  normal  0.256868 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18220  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  38.94 
 
 		 218 aa  125  6e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2316  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 221 aa  124  7e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.132325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1148  DSBA oxidoreductase  35.5 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0721  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 244 aa  124  9e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.874736  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3389  DSBA oxidoreductase  38.57 
 
 		 235 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.354876  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0738  DSBA oxidoreductase  38.16 
 
 		 244 aa  123  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.122622 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2541  DSBA oxidoreductase  37.74 
 
 		 247 aa  122  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1034  DSBA oxidoreductase  36.76 
 
 		 215 aa  120  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3936  DSBA oxidoreductase  36.62 
 
 		 270 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.763999  hitchhiker  0.00370443 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4753  DSBA oxidoreductase  35.75 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.803331  normal  0.448098 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1564  DsbA oxidoreductase  36.59 
 
 		 212 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0406976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2795  DSBA oxidoreductase  36.41 
 
 		 207 aa  118  7e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4436  DSBA oxidoreductase  35.48 
 
 		 239 aa  117  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.106658  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0261  DSBA oxidoreductase  35.19 
 
 		 213 aa  116  1.9999999999999998e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0132035 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01056  probable DSBA oxidoreductase  34.31 
 
 		 211 aa  116  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01681  hypothetical protein  36.89 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.793044 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22550  predicted dithiol-disulfide isomerase involved in polyketide biosynthesis  39.38 
 
 		 227 aa  115  5e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3751  DSBA oxidoreductase  30.37 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.395106  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1278  DSBA oxidoreductase  34.54 
 
 		 222 aa  115  6e-25  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000336164  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0326  DSBA oxidoreductase  38.12 
 
 		 237 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0550  polyketide biosynthesis associated protein  33.49 
 
 		 233 aa  114  1.0000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.682486  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0622  DSBA oxidoreductase  32.12 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2368  DSBA oxidoreductase  37.81 
 
 		 203 aa  113  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.919583  normal  0.0250813 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1922  DSBA oxidoreductase  34.17 
 
 		 218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.65395  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1542  DSBA oxidoreductase  38.43 
 
 		 224 aa  113  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.208286 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0210  DSBA oxidoreductase  34.8 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1083  DSBA oxidoreductase  33.66 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.979731  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2832  DSBA oxidoreductase  32.38 
 
 		 213 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.84064  normal  0.0678708 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3914  DSBA oxidoreductase  33.17 
 
 		 215 aa  112  5e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.216529 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2343  DSBA oxidoreductase  33.82 
 
 		 234 aa  112  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.590857  normal  0.036783 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3424  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 226 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4898  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3265  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 		 226 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.22208 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4435  DSBA oxidoreductase  33.02 
 
 		 226 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.639129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0967  DSBA oxidoreductase  38.54 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.431519  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4177  2-hydroxychromene-2-carboxylate isomerase family protein  32.68 
 
 		 215 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.743231  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6909  DSBA oxidoreductase  32.55 
 
 		 226 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1583  DSBA oxidoreductase  38.14 
 
 		 210 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>