32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2969 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2969  O-antigen and teichoic acid-like export protein  100 
 
 		 449 aa  892    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.369206  normal  0.787883 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0361  polysaccharide biosynthesis protein  21.65 
 
 		 482 aa  77.8  0.0000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3133  polysaccharide biosynthesis protein  28.32 
 
 		 507 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0165717  normal  0.444225 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2606  hypothetical protein  24.16 
 
 		 524 aa  72  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0166267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0588  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 		 410 aa  55.8  0.000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0284636  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 461 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 446 aa  50.4  0.00006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0959  polysaccharide biosynthesis protein  23.65 
 
 		 507 aa  50.1  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.463936  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0334  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 		 492 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.296717  normal  0.822596 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.97 
 
 		 435 aa  49.7  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2656  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 		 502 aa  49.3  0.0001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.123268  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  26.88 
 
 		 461 aa  48.1  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2377  polysaccharide biosynthesis protein  24.26 
 
 		 486 aa  47.8  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.319736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01400  exopolysaccharide xanthan biosynthesis protein GumJ  28.8 
 
 		 497 aa  47.8  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3104  virulence factor MVIN-like  31.88 
 
 		 627 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0311  hypothetical protein  23.05 
 
 		 488 aa  47  0.0007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.23799 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4090  membrane protein  23.2 
 
 		 481 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5012  putative polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 		 499 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1531  GumJ protein  27.72 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.107996  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1475  polysaccharide biosynthesis protein  27.72 
 
 		 510 aa  45.8  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.005815  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2653  polysaccharide biosynthesis protein  23.03 
 
 		 480 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.18747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4214  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5795  membrane protein putative virulence factor-like protein  26.14 
 
 		 535 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.401085  normal  0.0760131 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 		 495 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  22.55 
 
 		 488 aa  44.7  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2295  integral membrane protein MviN  31.4 
 
 		 533 aa  44.7  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3995  polysaccharide biosynthesis protein  24.14 
 
 		 497 aa  43.9  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.495687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4239  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 		 493 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0962  virulence factor MviN family protein  22.61 
 
 		 511 aa  43.5  0.007  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2636  integral membrane protein MviN  24.71 
 
 		 512 aa  43.5  0.007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1961  polysaccharide biosynthesis protein  23.28 
 
 		 431 aa  43.5  0.009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0629938 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  27.13 
 
 		 514 aa  43.1  0.009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>