More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2180 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_001230  ATP-dependent protease La Type II  66.92 
 
 
786 aa  1110  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1328  peptidase S16 lon domain-containing protein  70.09 
 
 
805 aa  1181  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.047879 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3391  ATP-dependent protease, putative  68.04 
 
 
806 aa  1159  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1250  peptidase S16, lon domain-containing protein  69.84 
 
 
805 aa  1180  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0840  putative Lon protease  65.61 
 
 
777 aa  1052  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1159  ATP-dependent protease, putative  69.29 
 
 
805 aa  1172  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1294  peptidase S16, lon domain-containing protein  69.96 
 
 
805 aa  1179  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.506125  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2079  peptidase S16, lon domain-containing protein  54.42 
 
 
802 aa  912  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2406  ATP-dependent protease, putative  67.97 
 
 
791 aa  1121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1160  ATP-dependent protease, putative  69.29 
 
 
805 aa  1173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2181  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  72.9 
 
 
795 aa  1244  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1976  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  76.4 
 
 
800 aa  1289  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.51631e-05  normal  0.8017 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2463  peptidase S16 lon domain-containing protein  84.2 
 
 
816 aa  1415  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572002  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3060  peptidase S16, lon domain protein  69.96 
 
 
805 aa  1179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0329616  hitchhiker  0.000400818 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1230  peptidase S16, lon domain-containing protein  69.41 
 
 
805 aa  1173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.813888  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3103  peptidase S16, lon-like protein  68.03 
 
 
810 aa  1108  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0263  hypothetical protein  67.68 
 
 
786 aa  1136  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05096  ATP-dependent protease  66.79 
 
 
786 aa  1105  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2719  peptidase S16, lon domain-containing protein  69.95 
 
 
810 aa  1178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.220264  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2180  putative ATP-dependent protease La-relatedprotein  100 
 
 
807 aa  1675  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0831  ATP-dependent protease, putative  39.9 
 
 
811 aa  632  1e-180  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.726223  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0259  peptidase S16 lon domain protein  41.18 
 
 
832 aa  621  1e-176  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2088  peptidase S16 lon domain protein  41.01 
 
 
803 aa  617  1e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2123  peptidase S16 lon domain protein  39.73 
 
 
809 aa  615  1e-174  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00311978 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0853  ATP-dependent protease, putative  40.77 
 
 
844 aa  608  1e-172  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.105216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1517  peptidase S16, lon domain-containing protein  39.67 
 
 
813 aa  607  1e-172  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.30513  normal  0.334171 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0298  ATP-dependent protease, putative  39.29 
 
 
799 aa  590  1e-167  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00242114 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1717  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.88 
 
 
801 aa  590  1e-167  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0787  ATP-dependent protease  38.69 
 
 
861 aa  588  1e-166  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.202315  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1920  peptidase S16 lon domain protein  38.2 
 
 
808 aa  582  1e-165  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1929  ATP-dependent protease, putative  39.15 
 
 
803 aa  584  1e-165  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.355621  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0177  peptidase S16 lon domain protein  39.41 
 
 
818 aa  578  1e-163  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.16877  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2107  peptidase S16 lon domain-containing protein  38.32 
 
 
806 aa  569  1e-161  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.801534  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3006  ATP-dependent protease-like protein  37.82 
 
 
815 aa  562  1e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0740  peptidase S16 lon domain-containing protein  36.55 
 
 
843 aa  565  1e-159  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.493577 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1417  peptidase S16 lon domain protein  39.32 
 
 
819 aa  557  1e-157  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.185581  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2449  peptidase S16 lon domain protein  39.22 
 
 
809 aa  546  1e-154  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.849825  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2430  ATP-dependent protease, putative  37.05 
 
 
798 aa  547  1e-154  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0823  peptidase S16 lon domain protein  37.91 
 
 
813 aa  542  1e-153  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.112551  normal  0.517782 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1543  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.78 
 
 
865 aa  535  1e-150  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3051  peptidase S16 lon domain protein  36.39 
 
 
825 aa  534  1e-150  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1447  ATP-dependent protease, putative  36.83 
 
 
806 aa  535  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2793  ATP-dependent protease, putative  35.79 
 
 
814 aa  530  1e-149  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.281078  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1773  peptidase S16, lon-like protein  36.06 
 
 
814 aa  526  1e-148  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1519  peptidase S16, lon-like protein  36.42 
 
 
787 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5216  putative ATP-dependent protease  35.04 
 
 
817 aa  518  1e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0128241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2746  peptidase S16, lon-like  36.46 
 
 
811 aa  516  1e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  1.35674e-05  normal  0.815417 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60550  putative ATP-dependent protease  34.92 
 
 
817 aa  517  1e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000190138  normal  0.722449 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0981  peptidase S16 lon domain protein  34.05 
 
 
831 aa  513  1e-144  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  1.65888e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1322  hypothetical protein  36.75 
 
 
951 aa  510  1e-143  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1056  peptidase S16, lon-like  36.2 
 
 
975 aa  507  1e-142  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4585  ATP-dependent protease, putative  35 
 
 
811 aa  508  1e-142  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.560792  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.45 
 
 
805 aa  509  1e-142  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3069  ATP-dependent protease, putative  35.18 
 
 
813 aa  506  1e-142  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4259  ATP-dependent protease, putative  35 
 
 
811 aa  509  1e-142  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2433  ATP-dependent protease, putative  35.04 
 
 
821 aa  508  1e-142  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0708  peptidase S16, lon domain protein  35.59 
 
 
819 aa  509  1e-142  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0020  ATP-dependent protease, putative  35.81 
 
 
823 aa  504  1e-141  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.140592  normal  0.225222 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1359  peptidase S16, lon domain-containing protein  36.19 
 
 
807 aa  504  1e-141  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4869  ATP-dependent protease, putative  34.89 
 
 
812 aa  503  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0720  peptidase S16, lon domain protein  35.2 
 
 
819 aa  505  1e-141  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.59212e-16 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40850  ATP-dependent protease  35.52 
 
 
806 aa  501  1e-140  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.887392  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0802  peptidase S16, lon-like protein  35.11 
 
 
801 aa  502  1e-140  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01670  putative ATP-dependent protease  36.65 
 
 
798 aa  501  1e-140  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1200  ATP-dependent protease-like protein  35.3 
 
 
829 aa  497  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  2.80038e-07  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2347  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.88 
 
 
805 aa  499  1e-139  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4505  ATP-dependent protease  35.38 
 
 
812 aa  493  1e-138  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.552319  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0711  ATP-dependent protease-like protein  35.29 
 
 
812 aa  493  1e-138  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.807483  normal  0.0469717 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0680  ATP-dependent protease, putative  35.29 
 
 
812 aa  493  1e-138  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0697551  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03380  peptidase S16 lon domain protein  34.98 
 
 
810 aa  494  1e-138  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1020  ATP-dependent protease  34.3 
 
 
803 aa  489  1e-137  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0712  peptidase S16 lon domain-containing protein  35.17 
 
 
812 aa  491  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0968919  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1724  putative ATP-dependent protease LA  36.18 
 
 
802 aa  490  1e-137  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2264  putative ATP-dependent protease  34.36 
 
 
827 aa  487  1e-136  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.412132 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0925  ATP-dependent protease  34.42 
 
 
786 aa  483  1e-135  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.819231  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1297  peptidase S16, lon domain-containing protein  35.82 
 
 
786 aa  483  1e-135  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  6.25582e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2309  peptidase S16 lon domain protein  34.63 
 
 
817 aa  481  1e-134  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3407  peptidase S16 lon domain protein  34.41 
 
 
806 aa  477  1e-133  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.025789  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0312  peptidase S16 lon domain protein  33.42 
 
 
873 aa  478  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.345035 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0950  peptidase S16 lon domain-containing protein  34.84 
 
 
794 aa  470  1e-131  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0928  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.58 
 
 
794 aa  468  1e-130  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00182033  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1567  peptidase S16, lon-like  34.91 
 
 
795 aa  469  1e-130  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.617903  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0319  peptidase S16, lon domain-containing protein  34.79 
 
 
783 aa  465  1e-129  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2600  ATP-dependent protease, putative  35.86 
 
 
784 aa  464  1e-129  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.863094  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1607  peptidase S16, lon domain-containing protein  33.5 
 
 
815 aa  459  1e-127  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1662  peptidase S16 lon domain-containing protein  32.8 
 
 
788 aa  456  1e-127  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2007  ATP-dependent protease, putative  32.71 
 
 
829 aa  443  1e-123  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.303021  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1270  peptidase S16, lon domain-containing protein  32.25 
 
 
806 aa  419  1e-115  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.347497  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0590  ATP-dependent protease, putative  31.4 
 
 
811 aa  414  1e-114  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0118699 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3315  putative ATP-dependent protease La, putative  32.92 
 
 
806 aa  407  1e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0955  ATP-dependent protease, putative  33.04 
 
 
797 aa  408  1e-112  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.099615  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2626  ATP-dependent protease, putative  33.25 
 
 
803 aa  404  1e-111  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  2.39913e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2798  peptidase S16 lon domain protein  31.72 
 
 
811 aa  402  1e-110  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00224654  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0676  putative ATP-dependent protease LA, putative  32.17 
 
 
810 aa  400  1e-110  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1288  peptidase S16 lon domain protein  32.51 
 
 
811 aa  383  1e-105  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1037  peptidase S16 lon domain protein  29.83 
 
 
774 aa  378  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.350098  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3583  ATP-dependent protease-like  41.05 
 
 
660 aa  375  1e-102  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1399  peptidase S16, lon domain-containing protein  37.89 
 
 
810 aa  366  1e-100  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.69789e-05  hitchhiker  0.00375305 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2053  putative ATP-dependent protease La, putative  32.33 
 
 
817 aa  356  9e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0284052  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0220  peptidase S16 lon domain-containing protein  30.04 
 
 
790 aa  344  3e-93  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.229141  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>