More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1534 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1534  carbonate dehydratase  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.223898  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5701  carbonate dehydratase  77.93 
 
 		 219 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.182609 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5945  carbonate dehydratase  77.93 
 
 		 223 aa  365  1e-100  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.255507 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2146  Carbonate dehydratase  76.06 
 
 		 219 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0370  carbonic anhydrase  77.36 
 
 		 219 aa  354  5e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00293  carbonic anhydrase  76.89 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3286  carbonate dehydratase  76.89 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0364  carbonic anhydrase  76.89 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.390414  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0412  carbonic anhydrase  76.89 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00297  hypothetical protein  76.89 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0404  carbonic anhydrase  76.89 
 
 		 219 aa  353  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3267  Carbonate dehydratase  76.42 
 
 		 219 aa  350  8e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2816  carbonate dehydratase  76.06 
 
 		 219 aa  350  1e-95  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4128  carbonate dehydratase  74.65 
 
 		 219 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.190844 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4779  carbonate dehydratase  74.65 
 
 		 219 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3388  carbonate dehydratase  74.65 
 
 		 219 aa  345  2e-94  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.731684  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3093  carbonate dehydratase  74.07 
 
 		 219 aa  344  6e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.327963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1199  carbonic anhydrases  75 
 
 		 234 aa  342  2e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3463  carbonic anhydrases  74.06 
 
 		 219 aa  340  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3426  carbonic anhydrases  73.58 
 
 		 219 aa  338  4e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2465  carbonic anhydrase  73.58 
 
 		 219 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.412017  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0384  carbonic anhydrases  73.58 
 
 		 219 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1244  carbonic anhydrases  73.58 
 
 		 219 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.858637  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3322  carbonic anhydrases  73.58 
 
 		 219 aa  337  7e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2731  carbonate dehydratase  67.14 
 
 		 219 aa  324  7e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.657946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6589  carbonate dehydratase  66.67 
 
 		 219 aa  323  1e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.022636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3235  carbonate dehydratase  66.35 
 
 		 220 aa  318  3e-86  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2091  carbonic anhydrase  68.25 
 
 		 211 aa  318  5e-86  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.515162  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7283  carbonate dehydratase  68.78 
 
 		 239 aa  315  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.798915  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37950  carbonate dehydratase  66.35 
 
 		 220 aa  315  3e-85  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000711609  normal  0.0248788 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3371  carbonate dehydratase  68.57 
 
 		 219 aa  311  3.9999999999999997e-84  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1173  Carbonate dehydratase  68.75 
 
 		 211 aa  307  8e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.465895  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5605  carbonic anhydrase  65.4 
 
 		 216 aa  302  2.0000000000000002e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0566  carbonate dehydratase  67.79 
 
 		 211 aa  302  3.0000000000000004e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0328456  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1256  carbonate dehydratase  63.33 
 
 		 211 aa  297  8e-80  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.471436  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5353  Carbonate dehydratase  62.38 
 
 		 211 aa  297  9e-80  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.599954 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1781  carbonate dehydratase  64.42 
 
 		 211 aa  291  7e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00326798 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0118  carbonate dehydratase  55.14 
 
 		 239 aa  246  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.176541 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0100  carbonate dehydratase  53.27 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0551844 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0115  carbonate dehydratase  53.27 
 
 		 239 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0114  carbonate dehydratase  52.8 
 
 		 239 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.900402  hitchhiker  0.000744084 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01240  carbonic anhydrase  52.56 
 
 		 242 aa  236  1e-61  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0288  carbonate dehydratase  52.05 
 
 		 246 aa  236  2e-61  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0176  carbonic anhydrase  52.09 
 
 		 242 aa  234  6e-61  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5255  carbonic anhydrase  51.6 
 
 		 221 aa  234  7e-61  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4475  carbonate dehydratase  52.11 
 
 		 242 aa  234  7e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0082  carbonic anhydrase  51.6 
 
 		 243 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2233  carbonate dehydratase  52.51 
 
 		 229 aa  226  2e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2617  carbonate dehydratase  51.47 
 
 		 230 aa  218  3.9999999999999997e-56  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0962521  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01060  carbonic anhydrase  47.71 
 
 		 248 aa  215  2.9999999999999998e-55  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4860  Carbonate dehydratase  52.53 
 
 		 202 aa  215  4e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0883553 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2827  carbonate dehydratase  50.23 
 
 		 251 aa  212  3.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0831803 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4610  carbonate dehydratase  48.34 
 
 		 230 aa  210  1e-53  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0533139 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3054  Carbonate dehydratase  50.47 
 
 		 258 aa  209  2e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2945  Carbonate dehydratase  49.76 
 
 		 235 aa  208  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1553  carbonate dehydratase  49.03 
 
 		 225 aa  204  8e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0438519  normal  0.0234257 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0408  Carbonate dehydratase  50.5 
 
 		 231 aa  202  4e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0665661 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4013  carbonate dehydratase  45.54 
 
 		 218 aa  199  1.9999999999999998e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1923  Carbonic anhydrase protein  43.91 
 
 		 234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.764692  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1176  carbonate dehydratase  51.49 
 
 		 234 aa  198  5e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.532221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4166  Carbonate dehydratase  47.03 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4126  Carbonate dehydratase  47.03 
 
 		 267 aa  198  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2571  Carbonate dehydratase  41.38 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02854  carbonic anhydrase  44.78 
 
 		 217 aa  191  7e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4953  Carbonate dehydratase  46.53 
 
 		 278 aa  189  2e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2165  carbonic anhydrase  45.05 
 
 		 224 aa  186  2e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.207765 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0612  carbonate dehydratase  46.46 
 
 		 227 aa  184  1.0000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1447  carbonate dehydratase  45.03 
 
 		 272 aa  179  2.9999999999999997e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.131229 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3284  Carbonate dehydratase  41.09 
 
 		 227 aa  176  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3608  Carbonate dehydratase  43.84 
 
 		 284 aa  176  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.418746  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1895  hypothetical protein  38.61 
 
 		 356 aa  168  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0748  Carbonate dehydratase  39.9 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.942941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00785  carbonic anhydrase  46.2 
 
 		 182 aa  163  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203446  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1505  carbonic anhydrase  39.51 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1736  carbonic anhydrase  39.11 
 
 		 222 aa  157  1e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.680655  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0288  carbonic anhydrase  39.22 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.104413  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0262  carbonic anhydrase  39.22 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0235  carbonic anhydrase  39.22 
 
 		 211 aa  156  2e-37  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2116  carbonate dehydratase  38.46 
 
 		 213 aa  153  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0336  carbonate dehydratase  39.02 
 
 		 214 aa  152  5e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.256297  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1765  Carbonate dehydratase  37.44 
 
 		 207 aa  151  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0012  carbonate dehydratase  36.76 
 
 		 210 aa  151  5.9999999999999996e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13920  Carbonate dehydratase  38.22 
 
 		 200 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000593664  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1380  carbonate dehydratase  37.68 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.173014  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0162  carbonate dehydratase  38.73 
 
 		 225 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0391  Carbonate dehydratase  37.5 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.377586 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1507  Carbonate dehydratase  36.97 
 
 		 216 aa  141  7e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00649241  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5185  carbonic anhydrase  36.59 
 
 		 225 aa  140  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.239383 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3756  carbonate dehydratase  38.94 
 
 		 230 aa  135  4e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.622574 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6793  Carbonate dehydratase  34.72 
 
 		 749 aa  135  5e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.286615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1679  Carbonate dehydratase  36.96 
 
 		 754 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0161033  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2037  Carbonate dehydratase  33.33 
 
 		 233 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2078  carbonic anhydrase  35.19 
 
 		 244 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.00878543  normal  0.182367 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0555  Carbonate dehydratase  34.85 
 
 		 210 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000138152  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5007  carbonate dehydratase  35.98 
 
 		 230 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.574845  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3245  carbonate dehydratase  38.32 
 
 		 877 aa  132  3.9999999999999996e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.457937 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5682  Carbonate dehydratase  39.41 
 
 		 739 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.555807  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1268  Carbonate dehydratase  40 
 
 		 211 aa  131  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.7207  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2901  Carbonate dehydratase  37.89 
 
 		 787 aa  129  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0652695 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2660  Carbonate dehydratase  35.61 
 
 		 213 aa  128  8.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000276342  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>