More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0170 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  653  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  1.5318e-08  hitchhiker  3.10582e-11 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0156  elongation factor Tu  93.91 
 
 
394 aa  732  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  3.13949e-06  decreased coverage  5.1786e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0144  elongation factor Tu  94.16 
 
 
394 aa  734  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  1.95175e-06  normal  0.039031 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3476  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  7.12008e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3461  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  decreased coverage  0.000474832  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3824  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.195129  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  1.63409e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3748  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  3.73215e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4172  elongation factor Tu  90.86 
 
 
394 aa  701  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  7.6716e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009037  Sbal_4468  elongation factor Tu  90.86 
 
 
394 aa  701  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  78.79 
 
 
396 aa  659  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  1.35478e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  78.79 
 
 
396 aa  659  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  2.52436e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  78.73 
 
 
396 aa  653  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  1.50336e-07  hitchhiker  1.30036e-06 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  76.31 
 
 
402 aa  639  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2774  elongation factor Tu  87.56 
 
 
394 aa  688  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  4.37207e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2723  elongation factor Tu  87.56 
 
 
394 aa  688  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  4.08037e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3923  elongation factor Tu  78.28 
 
 
397 aa  646  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.375909  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3911  elongation factor Tu  78.28 
 
 
397 aa  646  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0156728  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3773  elongation factor Tu  91.12 
 
 
394 aa  717  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  1.80335e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3761  elongation factor Tu  91.12 
 
 
394 aa  717  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  7.88214e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3756  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  1.75435e-06  decreased coverage  0.00120864 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0190  elongation factor Tu  87.31 
 
 
394 aa  689  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  2.35247e-06  normal  0.27842 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1922  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  9.51262e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1906  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  3.03162e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3321  elongation factor Tu  77.47 
 
 
396 aa  648  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4356  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  2.2952e-06  normal  0.868504 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03570  elongation factor Tu  86.01 
 
 
394 aa  676  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  2.18481e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3437  elongation factor Tu  84.73 
 
 
394 aa  665  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  unclonable  1.12361e-06  hitchhiker  0.000128836 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0211  elongation factor Tu  90.82 
 
 
394 aa  709  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  4.53651e-06  unclonable  9.37964e-06 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0199  elongation factor Tu  90.82 
 
 
394 aa  709  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  5.63397e-08  hitchhiker  0.000127621 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  75.7 
 
 
396 aa  634  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  75.7 
 
 
396 aa  634  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3642  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  2.47554e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4388  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  3.6113e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  90.36 
 
 
394 aa  739  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.14684e-06  hitchhiker  3.34083e-08 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3641  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0331259  normal  0.385019 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0201  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  651  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.590081  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  77.22 
 
 
396 aa  644  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  77.47 
 
 
396 aa  642  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  77.47 
 
 
396 aa  643  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3715  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214032  normal  0.317653 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4478  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00401398  decreased coverage  9.87453e-15 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3186  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  4.68547e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3171  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  658  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  4.06645e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3750  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.624959  normal  0.15097 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4475  elongation factor Tu  86.29 
 
 
394 aa  681  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000136907  hitchhiker  0.00081274 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3647  elongation factor Tu  78.54 
 
 
396 aa  651  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  90.36 
 
 
394 aa  739  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  2.02802e-06  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4468  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  682  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  7.22056e-15  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4045  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  682  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  2.76048e-05  hitchhiker  0.00334828 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4704  elongation factor Tu  95.94 
 
 
394 aa  742  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  3.92421e-07  hitchhiker  3.9393e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0198  elongation factor Tu  90.86 
 
 
394 aa  701  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  3.78702e-07  unclonable  1.27922e-05 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0186  elongation factor Tu  90.61 
 
 
394 aa  699  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.52251e-05  hitchhiker  0.000684703 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0182  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  799  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  3.66988e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0170  elongation factor Tu  100 
 
 
394 aa  799  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  2.10333e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4548  elongation factor Tu  89.09 
 
 
394 aa  696  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  3.12961e-08  normal  0.015065 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0270  elongation factor Tu  88.58 
 
 
394 aa  694  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  2.76369e-08  normal  0.0281528 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4319  elongation factor Tu  98.22 
 
 
394 aa  786  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  2.3337e-07  unclonable  1.08013e-10 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  657  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  8.14669e-07  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4519  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  683  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  3.4313e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4692  elongation factor Tu  95.94 
 
 
394 aa  742  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  2.01844e-07  unclonable  3.72179e-08 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  78.99 
 
 
396 aa  655  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  4.5907e-07  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0374  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  681  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00309992  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0332  elongation factor Tu  86.77 
 
 
394 aa  684  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.000132948  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0278  elongation factor Tu  88.32 
 
 
394 aa  694  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  4.12884e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3620  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  681  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  3.72822e-05  hitchhiker  0.00440714 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4428  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  682  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  3.75004e-09  hitchhiker  9.74336e-06 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3674  elongation factor Tu  88.32 
 
 
394 aa  694  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  2.19951e-08  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2803  elongation factor Tu  86.77 
 
 
394 aa  684  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  1.8967e-08  normal  0.0748006 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0335  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  643  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  3.34885e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0319  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  643  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  4.67982e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  78.99 
 
 
396 aa  655  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  1.51927e-06  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3808  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  681  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  1.7346e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4213  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  682  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  7.91099e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3535  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  681  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000296499  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0194  elongation factor Tu  90.86 
 
 
394 aa  701  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  8.23717e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0182  elongation factor Tu  90.86 
 
 
394 aa  701  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  5.14209e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0835  elongation factor Tu  80.05 
 
 
397 aa  655  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.010413  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0822  elongation factor Tu  80.05 
 
 
400 aa  655  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0296542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4278  elongation factor Tu  78.33 
 
 
407 aa  651  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  2.89642e-06  unclonable  6.40465e-12 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  79.49 
 
 
396 aa  660  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2043  elongation factor Tu  81.47 
 
 
396 aa  636  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  6.75899e-07  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1860  elongation factor Tu  81.47 
 
 
396 aa  637  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  1.59791e-08  hitchhiker  0.00222583 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  656  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  656  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  79.49 
 
 
396 aa  660  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0048  elongation factor Tu  76.77 
 
 
396 aa  642  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  2.6192e-12  decreased coverage  9.37064e-25 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00233  elongation factor Tu  86.22 
 
 
394 aa  661  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00054  elongation factor Tu  86.22 
 
 
394 aa  661  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1870  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  643  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  decreased coverage  8.16391e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1856  elongation factor Tu  77.53 
 
 
397 aa  643  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000358768  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  79.24 
 
 
396 aa  657  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3864  elongation factor Tu  77.27 
 
 
396 aa  647  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3874  elongation factor Tu  77.27 
 
 
396 aa  647  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3918  elongation factor Tu  88.32 
 
 
394 aa  694  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  7.13111e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3867  elongation factor Tu  86.77 
 
 
394 aa  684  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  6.62451e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0035  elongation factor Tu  77.02 
 
 
396 aa  647  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  7.75684e-07  hitchhiker  1.48389e-10 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3713  elongation factor Tu  86.55 
 
 
394 aa  681  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  9.94167e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  76.81 
 
 
402 aa  644  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  1.07296e-06 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>