More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0093 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009052  Sbal_2912  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
699 aa  645  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1296  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
699 aa  649  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0087  flagellar biosynthesis protein FlhA  88.6 
 
 
693 aa  1253  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0364653 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3033  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.07 
 
 
700 aa  669  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3052  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.48 
 
 
700 aa  644  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0382146 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1375  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.29 
 
 
699 aa  646  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.361202  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3054  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.57 
 
 
699 aa  643  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.921062  normal  0.080885 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3668  flagellar biosynthesis protein FlhA  81.24 
 
 
693 aa  1084  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1340  flagellar biosynthesis protein FlhA  50 
 
 
699 aa  640  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0243  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.95 
 
 
698 aa  783  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0111317 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0093  flagellar biosynthesis protein FlhA  100 
 
 
693 aa  1392  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0702  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.09 
 
 
697 aa  786  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.628209  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3391  type III secretion FHIPEP protein  58.13 
 
 
697 aa  786  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0241  lateral flagellar export/assembly protein LfhA  57.98 
 
 
697 aa  786  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1632  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.11 
 
 
699 aa  638  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0163  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.27 
 
 
696 aa  751  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6779  type III secretion FHIPEP protein  54.99 
 
 
696 aa  734  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.702443  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4644  type III secretion FHIPEP protein  54.69 
 
 
696 aa  716  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.207433  normal  0.243836 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1363  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
699 aa  649  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.960302 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04963  flagellar biosynthesis pathway, component FlhA  63.13 
 
 
696 aa  830  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3988  flagellar biosynthesis protein FlhA  81.92 
 
 
697 aa  1121  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0211  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.33 
 
 
696 aa  758  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3670  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.48 
 
 
709 aa  652  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1978  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.16 
 
 
724 aa  640  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3597  type III secretion FHIPEP protein  54.39 
 
 
695 aa  732  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.69729  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2283  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.78 
 
 
699 aa  639  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.740103 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3485  flagellar biosynthesis protein FlhA  81.96 
 
 
693 aa  1126  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2808  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.23 
 
 
715 aa  642  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.18652  normal  0.0746951 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4426  flagellar biosynthesis protein FlhA  58.35 
 
 
698 aa  793  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.47767 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1523  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.4 
 
 
748 aa  635  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.403932  normal  0.346987 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1356  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.71 
 
 
699 aa  647  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.212501 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3430  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.79 
 
 
705 aa  687  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3875  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.8 
 
 
707 aa  659  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.547904  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45680  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.8 
 
 
707 aa  659  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.589215 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2922  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
699 aa  645  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.268541  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0622  flagellar biosynthesis protein FlhA  57.95 
 
 
698 aa  786  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03147  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.24 
 
 
699 aa  653  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0744  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.71 
 
 
697 aa  648  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1172  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.21 
 
 
703 aa  661  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.167459 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2293  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.93 
 
 
697 aa  641  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1451  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
699 aa  645  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1560  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.67 
 
 
709 aa  652  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.253962 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0982  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.13 
 
 
706 aa  636  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.121658 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1335  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.1 
 
 
697 aa  661  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2562  flagellar biosynthesis protein FlhA  50 
 
 
699 aa  648  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1516  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.71 
 
 
700 aa  644  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002829  flagellar biosynthesis protein FlhA  51.17 
 
 
710 aa  649  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.192005  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4344  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.4 
 
 
709 aa  637  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.265021 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001176  flagellar biosynthesis protein FlhA  62.7 
 
 
696 aa  810  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02873  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.83 
 
 
699 aa  645  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.656306  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1976  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.17 
 
 
709 aa  632  1e-180  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0869734  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1196  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.43 
 
 
699 aa  629  1e-179  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3440  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.72 
 
 
709 aa  626  1e-178  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.520758 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1380  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.7 
 
 
699 aa  626  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.329367 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3213  flagellar biosynthesis protein FlhA  49.85 
 
 
699 aa  627  1e-178  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1865  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.31 
 
 
702 aa  627  1e-178  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.443827  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2158  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.46 
 
 
690 aa  619  1e-176  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1657  flagellar biosynthesis protein FlhA  50.15 
 
 
697 aa  620  1e-176  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0357682  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3378  type III secretion FHIPEP protein  54.78 
 
 
579 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0259  FHIPEP family type III secretion protein  54.8 
 
 
579 aa  616  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0263  protein FhiA  54.45 
 
 
579 aa  614  1e-174  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0274  type III secretion protein, FHIPEP family  54.45 
 
 
579 aa  614  1e-174  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.807219 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00228  hypothetical protein  54.72 
 
 
570 aa  612  1e-174  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2167  flagellar biosynthesis protein FlhA  47.14 
 
 
755 aa  606  1e-172  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3913  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.74 
 
 
709 aa  603  1e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.11934  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.35 
 
 
692 aa  594  1e-168  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1749  flagellar biosynthesis protein FlhA  48.64 
 
 
692 aa  595  1e-168  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1393  flagellar biosynthesis FlhA transmembrane protein  46.84 
 
 
696 aa  589  1e-167  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.203699  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00961  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
684 aa  583  1e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.21205  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06205  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.67 
 
 
684 aa  583  1e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.127059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0599  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.44 
 
 
699 aa  574  1e-162  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5616  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.25 
 
 
693 aa  573  1e-162  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.114145  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4067  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.17 
 
 
708 aa  572  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.67458  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4179  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.17 
 
 
708 aa  572  1e-161  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1945  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.64 
 
 
690 aa  570  1e-161  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4413  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.77 
 
 
693 aa  564  1e-159  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.402008  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3093  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.87 
 
 
694 aa  560  1e-158  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.753258  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3820  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.87 
 
 
694 aa  561  1e-158  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.136206 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1863  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.41 
 
 
693 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707218  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3699  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.69 
 
 
695 aa  558  1e-157  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0172867 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1548  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.99 
 
 
698 aa  556  1e-157  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1520  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.89 
 
 
698 aa  557  1e-157  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2015  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.44 
 
 
695 aa  552  1e-156  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.372336  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3707  flagellar biosynthesis protein FlhA  42.9 
 
 
693 aa  554  1e-156  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.306788  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2976  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.99 
 
 
692 aa  551  1e-155  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27910  flagellar biosynthesis protein  44.36 
 
 
694 aa  550  1e-155  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00371527  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0931  flagellar biosynthesis protein FlhA  43.21 
 
 
697 aa  551  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3803  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.39 
 
 
700 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1246  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.6 
 
 
692 aa  545  1e-153  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.932165  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0176  flagellar biosynthesis protein FlhA  46.06 
 
 
700 aa  539  1e-152  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0117653  normal  0.17502 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3169  flagellar biosynthesis protein FlhA  45.1 
 
 
700 aa  540  1e-152  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3924  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.95 
 
 
700 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.932271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1761  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.99 
 
 
692 aa  536  1e-151  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.98256  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1696  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.95 
 
 
700 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3843  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.95 
 
 
700 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0131  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.8 
 
 
700 aa  536  1e-151  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0740  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.43 
 
 
694 aa  536  1e-151  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3422  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.95 
 
 
700 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.545221  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0062  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.95 
 
 
700 aa  537  1e-151  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2846  flagellar biosynthesis protein FlhA  44.95 
 
 
700 aa  537  1e-151  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>