More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_0050 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_0050  sialic acid biosynthesis protein NeuD  100 
 
 
214 aa  431  1e-120  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0168  putative acetyltransferase  69.63 
 
 
214 aa  314  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0255  putative acetyltransferase  69.63 
 
 
214 aa  314  7e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001799  putative acetyltransferase  53.74 
 
 
217 aa  251  7e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3101  sialic acid biosynthesis protein NeuD  53 
 
 
206 aa  214  1e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1581  sialic acid biosynthesis protein NeuD  48.04 
 
 
212 aa  200  1e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.295514  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4087  carbonic anhydrase  42 
 
 
212 aa  157  8e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0366  acetyltransferase  31.78 
 
 
220 aa  134  1e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0359  hexapeptide transferase family protein  36.55 
 
 
213 aa  130  2e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2395  hexapeptide transferase family protein  39.42 
 
 
212 aa  129  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.471135 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0701  carbonic anhydrase  34.29 
 
 
221 aa  126  2e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  5.13916e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0632  sugar O-acyltransferase, sialic acid O-acetyltransferase NeuD family  34.01 
 
 
211 aa  124  1e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2642  hexapaptide repeat-containing transferase  31.07 
 
 
214 aa  105  4e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0449  general glycosylation pathway protein  31.03 
 
 
196 aa  105  4e-22  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14091  hypothetical protein  34.54 
 
 
197 aa  102  3e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.742426  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2304  hypothetical protein  30.61 
 
 
203 aa  102  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3020  hexapeptide transferase family protein  32.2 
 
 
371 aa  102  4e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3388  YvfD  33.67 
 
 
210 aa  101  7e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.163166  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1973  hexapeptide transferase family protein  30.1 
 
 
209 aa  100  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0293  carbonic anhydrase  33.33 
 
 
214 aa  97.4  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.436969  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1460  hexapaptide repeat-containing transferase  30.93 
 
 
218 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1700  Serine acetyltransferase-like protein  29.41 
 
 
211 aa  94.4  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12993  putative acetyltransferase  33.5 
 
 
204 aa  92.8  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1210  diguanylate cyclase  31.13 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0594  acetyl transferase  31.11 
 
 
191 aa  92  6e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0951  general glycosylation pathway protein  30.5 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0715  transferase hexapeptide repeat containing protein  31.96 
 
 
197 aa  90.5  2e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1344  hexapaptide repeat-containing transferase  33.49 
 
 
226 aa  89.7  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.966213 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1128  hexapaptide repeat-containing transferase  30.48 
 
 
223 aa  89.7  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0314  hexapaptide repeat-containing transferase  31.1 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.328072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2333  hexapaptide repeat-containing transferase  29.76 
 
 
220 aa  87.4  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1212  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  28.12 
 
 
203 aa  85.9  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4004  pilin glycosylation protein  28.43 
 
 
211 aa  85.5  5e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0791  hypothetical protein  32.32 
 
 
202 aa  85.1  8e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16960  transferase hexapeptide repeat protein  38.05 
 
 
209 aa  83.2  3e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3630  hexapeptide repeat-containing protein acetyltransferase  30.93 
 
 
196 aa  83.2  3e-15  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.655904 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2125  hexapaptide repeat-containing transferase  30.41 
 
 
210 aa  82.4  5e-15  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0400816  normal  0.032978 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3128  hexapaptide repeat-containing transferase  30 
 
 
211 aa  82  6e-15  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0286028  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0820  hypothetical protein  31.84 
 
 
202 aa  82  6e-15  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3872  hexapaptide repeat-containing transferase  29.35 
 
 
210 aa  81.6  7e-15  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1458  hexapaptide repeat-containing transferase  29.9 
 
 
205 aa  80.9  1e-14  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01111  hypothetical protein  28.8 
 
 
198 aa  81.3  1e-14  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.238768 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2647  putative acetyltransferase  28.78 
 
 
213 aa  80.5  2e-14  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30060  Trimeric LpxA-like family protein  36.94 
 
 
209 aa  80.5  2e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219117  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0526  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.43 
 
 
209 aa  79.3  3e-14  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0027  hexapaptide repeat-containing transferase  30.21 
 
 
217 aa  78.2  8e-14  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4746  transferase hexapeptide repeat containing protein  28.12 
 
 
181 aa  78.2  9e-14  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00152727  normal  0.0166501 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2813  biotin/lipoyl attachment domain-containing protein  29.85 
 
 
365 aa  77.8  1e-13  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2227  hexapaptide repeat-containing transferase  30.57 
 
 
174 aa  76.6  2e-13  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1256  UDP-4-amino-sugar N-acetyltransferase  28.28 
 
 
204 aa  76.6  3e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5687  sugar O-acyltransferase, sialic acid O- acetyltransferase NeuD family  37.04 
 
 
210 aa  76.6  3e-13  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.780646 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1380  general glycosylation pathway protein  31.06 
 
 
192 aa  75.5  6e-13  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2725  putative acetyltransferase  34.92 
 
 
181 aa  73.6  2e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3476  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like  32.03 
 
 
269 aa  73.6  2e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4261  hexapaptide repeat-containing transferase  31.03 
 
 
227 aa  73.2  3e-12  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2576  acetyltransferase  30.94 
 
 
206 aa  72.8  4e-12  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.538596  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1140  general glycosylation pathway protein  29.27 
 
 
203 aa  70.9  1e-11  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.672363  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1915  bacterial transferase, hexapeptide repeat protein  29.84 
 
 
213 aa  70.5  2e-11  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00871959  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1588  hexapaptide repeat-containing transferase  33.67 
 
 
212 aa  70.1  2e-11  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1265  general glycosylation pathway protein  29.03 
 
 
203 aa  70.5  2e-11  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.333754  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7036  acetyltransferase  41.57 
 
 
218 aa  70.5  2e-11  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3841  putative acetyltransferase  31.25 
 
 
210 aa  69.3  4e-11  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5253  hexapeptide repeat-containing transferase  29.03 
 
 
210 aa  68.9  5e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0598  general glycosylation pathway protein  28.23 
 
 
203 aa  68.9  5e-11  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.707027  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00206  transferase hexapeptide repeat  27.67 
 
 
223 aa  69.3  5e-11  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.997583  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1999  hexapaptide repeat-containing transferase  29.95 
 
 
229 aa  67.4  1e-10  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.776075 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0546  hypothetical protein  28.57 
 
 
216 aa  68.2  1e-10  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.882481 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0637  putative acetyl transferase protein  31.11 
 
 
219 aa  67.4  1e-10  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.714613  normal  0.346317 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1574  putative serine O-acetyltransferase  36.11 
 
 
217 aa  67  2e-10  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1168  putative acetyl transferase protein  30.83 
 
 
217 aa  66.2  3e-10  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.606064  normal  0.7385 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4155  acetyltransferase  37.27 
 
 
210 aa  66.6  3e-10  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.603693 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0094  putative acetyltransferase  31.06 
 
 
210 aa  66.6  3e-10  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315578 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1159  neuD protein  27.41 
 
 
209 aa  66.2  4e-10  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1814  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2-carboxylate N-succinyltransferase  38.66 
 
 
232 aa  65.5  5e-10  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  8.25508e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001766  putative serine O-acetyltransferase  32.17 
 
 
212 aa  65.9  5e-10  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00483498  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0284  hexapaptide repeat-containing transferase  26.7 
 
 
226 aa  65.9  5e-10  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1487  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  36.94 
 
 
239 aa  65.1  9e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.187706  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1458  tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain-containing protein  36.94 
 
 
239 aa  65.1  9e-10  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.484512  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2592  UDP-3-O-(3-hydroxymyristoyl)-like protein  24.39 
 
 
218 aa  64.3  1e-09  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00124242 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3036  hexapeptide transferase family protein  27.33 
 
 
216 aa  63.5  2e-09  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.864375 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2808  hexapeptide transferase family protein  29.23 
 
 
216 aa  63.9  2e-09  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3702  acetyltransferase  31.36 
 
 
213 aa  63.2  3e-09  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1127  putative acetyl transferase protein  26.92 
 
 
220 aa  62.8  4e-09  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.037936  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4412  pilin glycosylation protein  25.77 
 
 
207 aa  62.4  5e-09  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2976  Tetrahydrodipicolinate succinyltransferase domain protein  27.57 
 
 
231 aa  62.4  5e-09  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1269  acetyltransferase  28.8 
 
 
296 aa  62  6e-09  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.83932  normal  0.337234 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0668  2,3,4,5-tetrahydropyridine-2,6-dicarboxylate N-succinyltransferase  36.04 
 
 
233 aa  61.6  8e-09  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2310  pilin glycosylation protein PglB  26.54 
 
 
206 aa  61.2  1e-08  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.380656  normal  0.841589 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1935  acetyltransferase  27.83 
 
 
227 aa  60.8  1e-08  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4284  acetyltransferase  24.77 
 
 
212 aa  61.2  1e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1665  hexapaptide repeat-containing transferase  29.13 
 
 
212 aa  60.5  2e-08  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11536  hypothetical protein  25.5 
 
 
221 aa  60.1  3e-08  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.315623 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1195  putative acetyltransferase  31.67 
 
 
219 aa  58.9  5e-08  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.581226  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3457  hexapeptide transferase family protein  32.89 
 
 
210 aa  58.2  8e-08  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.10928  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4045  hexapaptide repeat-containing transferase  32.43 
 
 
222 aa  58.5  8e-08  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.950103  normal  0.545183 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1662  hexapeptide transferase family protein  32.89 
 
 
210 aa  58.2  8e-08  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3093  hexapeptide transferase family protein  32.89 
 
 
210 aa  58.2  8e-08  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.915098  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2882  hexapeptide transferase family protein  32.89 
 
 
210 aa  58.2  8e-08  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3961  hexapeptide repeat-containing transferase  32.89 
 
 
210 aa  58.2  8e-08  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2645  acetyltransferase  28.12 
 
 
214 aa  57.8  1e-07  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.84069  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>