More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4477 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4477  sodium/hydrogen exchanger  100 
 
 		 400 aa  752    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92242  normal  0.214913 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1889  hypothetical protein  65.08 
 
 		 403 aa  465  9.999999999999999e-131  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.993371  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2065  Sodium/hydrogen exchanger  40.93 
 
 		 408 aa  239  5e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0630296 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4572  sodium/hydrogen exchanger  41.6 
 
 		 407 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0384  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.33 
 
 		 407 aa  233  5e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4775  Na+/H+ antiporter  43.35 
 
 		 399 aa  233  6e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.169433  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0232  sodium/hydrogen exchanger  38.4 
 
 		 412 aa  233  6e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.568377  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4853  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.33 
 
 		 407 aa  232  7.000000000000001e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5156  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.35 
 
 		 399 aa  232  8.000000000000001e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.3609399999999994e-21 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4911  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.35 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5286  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.35 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5201  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.35 
 
 		 399 aa  231  1e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.195654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5187  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.35 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4756  Na+/H+ antiporter  43.09 
 
 		 399 aa  231  2e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.586497  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4474  Na+/H+ antiporter  41.6 
 
 		 407 aa  230  3e-59  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4492  Na+/H+ antiporter  41.6 
 
 		 407 aa  230  4e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5193  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.35 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.147358  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0056  sodium/hydrogen exchanger family protein  43.35 
 
 		 399 aa  229  7e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0399092  hitchhiker  0.000000129264 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4639  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.6 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4993  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.6 
 
 		 393 aa  229  9e-59  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.850719  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4871  sodium/hydrogen exchanger  43.09 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.813703  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4877  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.07 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4863  sodium/hydrogen exchanger family protein  41.07 
 
 		 407 aa  228  1e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4884  sodium/hydrogen exchanger family protein  40.86 
 
 		 407 aa  227  3e-58  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3239  sodium/hydrogen exchanger  40.21 
 
 		 405 aa  226  6e-58  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.845679 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0798  sodium/hydrogen exchanger  38 
 
 		 403 aa  211  2e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.539065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1518  sodium/hydrogen exchanger  40.57 
 
 		 411 aa  209  5e-53  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1612  sodium/hydrogen exchanger  35.81 
 
 		 393 aa  198  1.0000000000000001e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.716831  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3108  sodium/hydrogen exchanger  33.52 
 
 		 400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.315718  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0084  sodium/hydrogen exchanger  35.97 
 
 		 436 aa  178  2e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1207  sodium/hydrogen exchanger  34.6 
 
 		 399 aa  175  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000156939  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0363  sodium/hydrogen exchanger  37.1 
 
 		 414 aa  174  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.624328 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2190  sodium/hydrogen exchanger  35.75 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3663  sodium/hydrogen exchanger  37.01 
 
 		 393 aa  169  5e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1752  sodium/hydrogen exchanger  36.06 
 
 		 409 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1893  sodium/hydrogen exchanger  37.96 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.285532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0918  sodium/hydrogen exchanger  36.63 
 
 		 394 aa  161  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272174  normal  0.102052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3876  sodium/hydrogen exchanger  37.08 
 
 		 396 aa  161  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4657  sodium/hydrogen exchanger  35.6 
 
 		 436 aa  159  7e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0119  sodium/hydrogen exchanger  37.64 
 
 		 401 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.714442  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2225  sodium/hydrogen exchanger  34.2 
 
 		 404 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00686408 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3880  sodium/hydrogen exchanger family protein  36.57 
 
 		 386 aa  153  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.143006 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3034  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 585 aa  150  4e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0555922  hitchhiker  0.00545855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0716  sodium/hydrogen exchanger  33.03 
 
 		 585 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355706  normal  0.655046 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0953  CPA2 family Na(+)/H(+) antiporter  33.33 
 
 		 585 aa  147  3e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.238119  normal  0.80164 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1158  sodium/hydrogen exchanger  35.06 
 
 		 388 aa  147  4.0000000000000006e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.637442  normal  0.354058 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5068  sodium/hydrogen exchanger family protein  32.38 
 
 		 587 aa  145  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0118  sodium/hydrogen exchanger  36.93 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000413782 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_19020  Kef-type K+ transport system, membrane component  34.16 
 
 		 415 aa  144  4e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2649  sodium/hydrogen exchanger  36.87 
 
 		 399 aa  143  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.382226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2800  sodium/hydrogen exchanger  38.14 
 
 		 387 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.685752  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5404  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 586 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115045 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5263  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 586 aa  140  3e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.680967  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5133  sodium/hydrogen exchanger  31.81 
 
 		 586 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.322747 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0408  sodium/hydrogen exchanger  35.31 
 
 		 388 aa  139  6e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5648  Sodium/hydrogen exchanger  31.23 
 
 		 587 aa  139  6e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00653645 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5519  sodium/hydrogen exchanger family protein  31.52 
 
 		 587 aa  139  7e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5355  sodium/hydrogen exchanger  31.52 
 
 		 586 aa  139  8.999999999999999e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.547992 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6330  putative sodium/proton antiporter  30.41 
 
 		 585 aa  136  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2651  sodium/hydrogen exchanger  33.77 
 
 		 373 aa  136  7.000000000000001e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000172671  decreased coverage  0.000202867 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72940  putative sodium/proton antiporter  30.95 
 
 		 585 aa  135  9e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13265  integral membrane transport protein  34.81 
 
 		 385 aa  133  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.53552 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1130  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 		 586 aa  133  6e-30  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.496723 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2892  sodium/hydrogen exchanger  33.95 
 
 		 384 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.757225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2906  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0894257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2862  sodium/hydrogen exchanger  33.68 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.514562  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0821  Na+/H+ antiporter  27.53 
 
 		 741 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0612935  normal  0.436267 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1372  sodium/hydrogen exchanger  37 
 
 		 567 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1776  sodium/hydrogen exchanger  31.33 
 
 		 658 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000381991  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3333  sodium/hydrogen exchanger  30 
 
 		 747 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.7052  hitchhiker  0.00474985 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0261  sodium/hydrogen exchanger family protein  30.27 
 
 		 588 aa  125  2e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3551  sodium/hydrogen exchanger  30.48 
 
 		 741 aa  123  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.994377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0505  sodium/hydrogen exchanger  30.79 
 
 		 584 aa  122  8e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4597  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 777 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1509  sodium/hydrogen exchanger  35.79 
 
 		 567 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4527  sodium/hydrogen exchanger  31.72 
 
 		 671 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.436513  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1555  sodium/hydrogen exchanger  29.74 
 
 		 391 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000544506  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0806  sodium/hydrogen exchanger  30.17 
 
 		 666 aa  120  3e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1627  sodium/hydrogen exchanger family protein  35.87 
 
 		 567 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.510205  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5016  sodium/hydrogen exchanger  25.94 
 
 		 745 aa  120  4.9999999999999996e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0805  sodium/hydrogen exchanger  28.97 
 
 		 664 aa  120  4.9999999999999996e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.686788  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1119  sodium/hydrogen exchanger  28.26 
 
 		 741 aa  119  7e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1208  potassium efflux system protein  31.7 
 
 		 678 aa  119  9.999999999999999e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0754  sodium/hydrogen exchanger  28.49 
 
 		 598 aa  119  9.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.835162  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3229  putative cation:proton antiport protein  29.82 
 
 		 561 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.177126  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1082  putative cation:proton antiport protein  29.16 
 
 		 561 aa  117  3e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0321782  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2149  sodium/hydrogen exchanger  33.33 
 
 		 567 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1963  sodium/hydrogen exchanger  29.56 
 
 		 684 aa  117  5e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000770592  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0757  sodium/hydrogen exchanger  29.14 
 
 		 664 aa  117  5e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.199528  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1461  sodium/hydrogen exchanger  30.03 
 
 		 636 aa  117  5e-25  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.297602  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1105  Sodium/hydrogen exchanger  29.95 
 
 		 672 aa  116  6e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.107002  normal  0.0477197 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1390  sodium/hydrogen exchanger  28.02 
 
 		 782 aa  116  6.9999999999999995e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2285  sodium/hydrogen exchanger  29.7 
 
 		 408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0100423  hitchhiker  0.000500098 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10490  potassium proton antiporter  34.15 
 
 		 564 aa  116  7.999999999999999e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0861  sodium/hydrogen exchanger  27.06 
 
 		 395 aa  115  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03045  cation-efflux system transmembrane protein  31.09 
 
 		 405 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.21868  normal  0.662509 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0446  sodium/hydrogen exchanger  28.95 
 
 		 441 aa  115  1.0000000000000001e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.0000000379549 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2090  sodium/hydrogen exchanger  33.7 
 
 		 666 aa  114  3e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236107  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0023  sodium/hydrogen exchanger  29.97 
 
 		 673 aa  114  3e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000486087 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0402  sodium/hydrogen exchanger  30.34 
 
 		 562 aa  114  3e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>