134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2356 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_2356  BioY protein  100 
 
 		 200 aa  374  1e-103  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0996  BioY protein  58.6 
 
 		 191 aa  185  4e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3005  BioY protein  53.77 
 
 		 200 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.312874  normal  0.884214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8405  BioY family protein  55.38 
 
 		 189 aa  170  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2330  BioY protein  49.5 
 
 		 196 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  48.85 
 
 		 197 aa  138  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21370  hypothetical protein  46.6 
 
 		 205 aa  128  6e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.283174  normal  0.337859 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  49.72 
 
 		 203 aa  125  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0230  BioY protein  50.94 
 
 		 204 aa  125  5e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.949273  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  42.29 
 
 		 199 aa  118  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  47.43 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0901  BioY protein  50 
 
 		 208 aa  112  5e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  40.34 
 
 		 203 aa  105  3e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  40.41 
 
 		 207 aa  104  8e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  51.05 
 
 		 195 aa  102  3e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  41.81 
 
 		 205 aa  102  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  37 
 
 		 197 aa  102  4e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  40.88 
 
 		 206 aa  98.6  5e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  40.68 
 
 		 197 aa  99  5e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  39.89 
 
 		 195 aa  98.6  6e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3745  BioY protein  33.33 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000421582  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0144  BioY protein  42.44 
 
 		 200 aa  97.1  2e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  36.52 
 
 		 184 aa  92  4e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  32.93 
 
 		 187 aa  86.7  2e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  39.16 
 
 		 182 aa  87  2e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  37.65 
 
 		 179 aa  85.9  4e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2445  BioY protein  43.17 
 
 		 198 aa  79  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00000283482  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07160  hypothetical protein  38.19 
 
 		 205 aa  77  0.0000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.635094  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  39.86 
 
 		 178 aa  75.9  0.0000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3011  BioY protein  41.82 
 
 		 187 aa  75.1  0.0000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131178  normal  0.563491 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  36.31 
 
 		 182 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  38.17 
 
 		 210 aa  70.9  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  36.36 
 
 		 182 aa  70.1  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  30.48 
 
 		 203 aa  69.3  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_967  biotin biosynthesis protein BioY  34.68 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000844147  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0776  BioY protein  33.33 
 
 		 200 aa  68.6  0.00000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.656127  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  33.33 
 
 		 187 aa  68.2  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0995  BioY protein  34.71 
 
 		 215 aa  68.6  0.00000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  36.36 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2134  putative BioY protein  32.97 
 
 		 197 aa  68.2  0.00000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.669748 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  38.85 
 
 		 169 aa  68.2  0.00000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  38.89 
 
 		 189 aa  65.9  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  40 
 
 		 216 aa  63.9  0.000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  48.67 
 
 		 224 aa  63.2  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0575  BioY protein  39.52 
 
 		 185 aa  63.2  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0498  BioY protein  39.49 
 
 		 193 aa  62.8  0.000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.583343 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  41.38 
 
 		 182 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  31.46 
 
 		 191 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  31.84 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2544  BioY protein  34.59 
 
 		 192 aa  61.2  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000000269732  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  34.68 
 
 		 199 aa  60.8  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  30.9 
 
 		 191 aa  60.1  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1184  BioY family protein  34.71 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000330178  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3444  BioY protein  31.28 
 
 		 181 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.356601 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1515  bioY family protein  31.21 
 
 		 184 aa  59.3  0.00000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00248245  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  32.95 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  29.55 
 
 		 182 aa  58.5  0.00000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  36.13 
 
 		 212 aa  57.8  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  37.2 
 
 		 192 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1588  BioY protein  34.15 
 
 		 167 aa  57.4  0.0000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.0000111141  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  32.97 
 
 		 187 aa  57.4  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  31.71 
 
 		 184 aa  57.4  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1318  BioY protein  38.24 
 
 		 189 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00324631 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1924  BioY family protein  38.82 
 
 		 145 aa  56.2  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.930651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0169  BioY protein  35.21 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989963  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1788  BioY protein  37.5 
 
 		 169 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.385852  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0506  BioY family protein  32.34 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.529292  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  32.02 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0243  BioY protein  36.17 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00131705  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0509  BioY family protein  32.34 
 
 		 199 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  32.02 
 
 		 191 aa  55.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  32.29 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  31.74 
 
 		 189 aa  54.7  0.0000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  35.39 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0886  BioY protein  31.16 
 
 		 235 aa  53.9  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.452064  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  28.99 
 
 		 184 aa  53.9  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1719  BioY family protein  35.98 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  32.53 
 
 		 216 aa  53.5  0.000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1662  BioY family protein  35.98 
 
 		 191 aa  53.5  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  30.34 
 
 		 191 aa  53.1  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  34.36 
 
 		 187 aa  53.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  30.9 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  30.9 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  30.9 
 
 		 191 aa  52.8  0.000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  37.32 
 
 		 207 aa  52.8  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.31 
 
 		 191 aa  53.1  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  34.12 
 
 		 187 aa  52.8  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  35.67 
 
 		 205 aa  52  0.000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0610  BioY protein  36.08 
 
 		 174 aa  52  0.000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000775885  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0132  hypothetical protein  30.43 
 
 		 176 aa  51.6  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1630  hypothetical protein  40.56 
 
 		 199 aa  51.6  0.000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  32.35 
 
 		 187 aa  51.6  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  40.15 
 
 		 204 aa  51.2  0.00001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  34.29 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4329  BioY protein  36.36 
 
 		 212 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.794239  normal  0.373185 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  34.12 
 
 		 190 aa  50.8  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  34.29 
 
 		 169 aa  50.8  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  29.78 
 
 		 191 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0998  BioY protein  34.85 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000197008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>