More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3854 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011071  Smal_3854  ATP-dependent DNA helicase DinG  100 
 
 
700 aa  1424  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02825  ATP-dependent DNA helicase DinG  76.18 
 
 
710 aa  1102  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2118  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.47 
 
 
707 aa  413  1e-114  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.149773  hitchhiker  7.14427e-07 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0350  ATP-dependent DNA helicase DinG  37.41 
 
 
711 aa  410  1e-113  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  decreased coverage  0.00468076  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0995  ATP-dependent DNA helicase DinG  38.14 
 
 
708 aa  401  1e-110  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.196461  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2470  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.27 
 
 
690 aa  398  1e-109  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00127477 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.13 
 
 
690 aa  396  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.920562  hitchhiker  0.00302525 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2538  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.27 
 
 
690 aa  397  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.536241  unclonable  3.22681e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1819  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.13 
 
 
690 aa  392  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1513  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.85 
 
 
690 aa  390  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.433839  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4334  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.74 
 
 
714 aa  384  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.044641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_50840  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.74 
 
 
714 aa  385  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00144938 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3856  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.89 
 
 
714 aa  383  1e-105  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.160495  normal  0.793215 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1249  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.08 
 
 
691 aa  384  1e-105  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000153763 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2630  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.24 
 
 
691 aa  379  1e-104  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1225  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.03 
 
 
714 aa  382  1e-104  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1129  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.68 
 
 
694 aa  382  1e-104  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0640459  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4120  ATP-dependent helicase, DinG family  34.75 
 
 
714 aa  382  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1624  ATP-dependent DNA helicase DinG  36.51 
 
 
721 aa  381  1e-104  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1618  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.71 
 
 
690 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.326155  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1652  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.71 
 
 
690 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.303868 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1629  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.71 
 
 
690 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117477  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2725  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.71 
 
 
690 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0300555  hitchhiker  0.000425027 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1446  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.7 
 
 
703 aa  378  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  1.07544e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2178  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.33 
 
 
686 aa  375  1e-102  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.647766 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19450  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.35 
 
 
714 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1146  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.75 
 
 
714 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.980909  normal  0.730569 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3086  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.26 
 
 
692 aa  373  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.175143  hitchhiker  4.11022e-05 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2483  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.89 
 
 
690 aa  375  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204554 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2656  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.33 
 
 
690 aa  374  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.765136  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003963  ATP-dependent helicase DinG/Rad3  33.15 
 
 
691 aa  373  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1161  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.75 
 
 
714 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.665209  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1566  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.96 
 
 
692 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  6.20367e-05 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1125  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.75 
 
 
714 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.437588  hitchhiker  8.38668e-05 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4290  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.61 
 
 
714 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01557  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.66 
 
 
691 aa  368  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1427  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.34 
 
 
714 aa  368  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.152164  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2272  ATP-dependent DNA helicase DinG  30.75 
 
 
712 aa  365  2e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2381  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.56 
 
 
720 aa  363  5e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00980399 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2429  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.35 
 
 
691 aa  359  8e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1585  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.18 
 
 
725 aa  348  2e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.629158  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0884  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.27 
 
 
714 aa  337  3e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0857  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.27 
 
 
714 aa  337  3e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.27 
 
 
714 aa  337  5e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.607089  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0969  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.27 
 
 
714 aa  337  6e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.725445  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0916  ATP-dependent DNA helicase DinG  35.13 
 
 
714 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0866  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.56 
 
 
716 aa  333  5e-90  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0948  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.75 
 
 
762 aa  331  2e-89  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00783  hypothetical protein  34.75 
 
 
716 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0823  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.75 
 
 
716 aa  331  3e-89  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2843  helicase c2  34.75 
 
 
716 aa  331  3e-89  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00766  ATP-dependent DNA helicase  34.75 
 
 
716 aa  331  3e-89  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2495  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.03 
 
 
701 aa  329  1e-88  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.324564  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2553  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.42 
 
 
716 aa  328  2e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0853  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.61 
 
 
716 aa  328  2e-88  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2844  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.61 
 
 
716 aa  328  2e-88  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0506897 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1289  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.09 
 
 
725 aa  325  2e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.649523  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0013  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.82 
 
 
741 aa  324  3e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0014  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.34 
 
 
729 aa  323  7e-87  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.11513  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4158  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.2 
 
 
758 aa  323  8e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2398  ATP-dependent DNA helicase DinG  34.12 
 
 
715 aa  320  4e-86  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.927767  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2910  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.06 
 
 
699 aa  314  3e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0021  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.71 
 
 
692 aa  312  1e-83  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2856  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 
726 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.642331  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2777  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 
726 aa  311  2e-83  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1321  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.15 
 
 
726 aa  311  4e-83  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1461  ATP-dependent DNA helicase DinG  33.1 
 
 
732 aa  310  6e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.498771 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0503  helicase c2  32.13 
 
 
750 aa  309  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.516825  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2033  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.7 
 
 
716 aa  308  2e-82  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1552  ATP-dependent DNA helicase DinG  32.49 
 
 
699 aa  306  7e-82  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2732  ATP-dependent DNA helicase DinG  31.96 
 
 
738 aa  303  8e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.196414  normal  0.101558 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01131  ATP-dependent helicase  30.88 
 
 
639 aa  245  2e-63  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.625206  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0997  helicase c2  32.55 
 
 
643 aa  239  1e-61  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.179863 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2809  helicase c2  29.35 
 
 
707 aa  239  1e-61  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1825  helicase c2  32.12 
 
 
636 aa  233  9e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.979985  normal  0.491186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2535  hypothetical protein  32.12 
 
 
636 aa  233  9e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50615  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01766  hypothetical protein  32.12 
 
 
636 aa  233  9e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.479225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01778  conserved protein with nucleoside triphosphate hydrolase domain  32.12 
 
 
636 aa  233  9e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.548012  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3167  helicase c2  30.43 
 
 
876 aa  233  9e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000644587  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2034  hypothetical protein  32.12 
 
 
636 aa  233  9e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2094  helicase c2  31.65 
 
 
673 aa  233  9e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.239782  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1896  hypothetical protein  32.12 
 
 
636 aa  233  9e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1295  helicase c2  31.37 
 
 
664 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1380  hypothetical protein  31.98 
 
 
636 aa  232  2e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.434814  normal  0.350106 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3886  ATP-dependent helicase  29.12 
 
 
647 aa  231  4e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2068  hypothetical protein  31.98 
 
 
636 aa  229  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1835  helicase c2  31.98 
 
 
636 aa  229  1e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00837342  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1651  Exonuclease RNase T and DNA polymerase III  30.26 
 
 
952 aa  229  1e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0733  ATP-dependent DNA helicase  30.44 
 
 
640 aa  225  2e-57  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.982369  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004095  DinG family ATP-dependent helicase YoaA  30.26 
 
 
646 aa  225  2e-57  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01374  ATP-dependent helicase  30.26 
 
 
644 aa  224  4e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2147  helicase c2  30.79 
 
 
641 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0303331  hitchhiker  0.00135971 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2517  ATP-dependent helicase, DEXD family  30.79 
 
 
641 aa  223  6e-57  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.764826  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1965  hypothetical protein  30.62 
 
 
636 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2022  hypothetical protein  30.62 
 
 
636 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.6889  normal  0.891564 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1310  hypothetical protein  31 
 
 
636 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.027986  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1495  hypothetical protein  30.62 
 
 
636 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1961  hypothetical protein  30.62 
 
 
636 aa  223  1e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.915388  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2378  helicase c2  30.86 
 
 
636 aa  221  2e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4122  helicase c2  28.55 
 
 
843 aa  221  3e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.77416e-07  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>