36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6055 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_6055  Protein of unknown function DUF2329  100 
 
 		 474 aa  987    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2429  hypothetical protein  57.08 
 
 		 503 aa  513  1e-144  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1016  hypothetical protein  55.12 
 
 		 505 aa  502  1e-141  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.349259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00879  hypothetical protein  54.13 
 
 		 525 aa  497  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.173118  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2684  putative secreted protein  53.29 
 
 		 534 aa  493  9.999999999999999e-139  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.791899  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1551  putative secreted protein  53.17 
 
 		 560 aa  493  9.999999999999999e-139  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.423773  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1608  hypothetical protein  49.49 
 
 		 561 aa  490  1e-137  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4503  hypothetical protein  50.11 
 
 		 443 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1146  hypothetical protein  48.85 
 
 		 432 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3780  hypothetical protein  45.95 
 
 		 444 aa  368  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4109  hypothetical protein  45.5 
 
 		 444 aa  362  8e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2992  hypothetical protein  44.18 
 
 		 439 aa  347  3e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.864122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3133  hypothetical protein  43.51 
 
 		 427 aa  342  1e-92  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0763875  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0531  hypothetical protein  39.21 
 
 		 450 aa  317  3e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.549745 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2208  hypothetical protein  42.27 
 
 		 437 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.220762 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4068  hypothetical protein  38.19 
 
 		 929 aa  301  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.83009  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4543  hypothetical protein  37.39 
 
 		 423 aa  269  8e-71  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.483705  normal  0.411575 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0082  hypothetical protein  37.13 
 
 		 466 aa  258  2e-67  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0251  hypothetical protein  33.65 
 
 		 396 aa  225  1e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0294  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  35.14 
 
 		 1967 aa  225  2e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.630839  hitchhiker  0.000980746 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3637  hypothetical protein  33.48 
 
 		 457 aa  220  5e-56  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.104213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0406  hypothetical protein  32.37 
 
 		 420 aa  218  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3636  hypothetical protein  32.96 
 
 		 555 aa  217  2.9999999999999998e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.289719  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4452  hypothetical protein  32.59 
 
 		 459 aa  215  9.999999999999999e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000124037  normal  0.847922 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6279  hypothetical protein  30.48 
 
 		 441 aa  210  6e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1126  fibronectin type III domain-containing protein  30.89 
 
 		 733 aa  209  9e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435357 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5524  hypothetical protein  31 
 
 		 432 aa  207  5e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.86603  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4453  hypothetical protein  32.06 
 
 		 556 aa  206  8e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000000395035  normal  0.300253 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3301  hypothetical protein  30.52 
 
 		 424 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0855983  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1126  hypothetical protein  30.07 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3523  hypothetical protein  27.87 
 
 		 457 aa  187  4e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.91954  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8073  hypothetical protein  31.57 
 
 		 429 aa  177  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0080  hypothetical protein  30.61 
 
 		 412 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.815437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0623  glycosyltransferase 36  29.45 
 
 		 2929 aa  48.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2133  glycosyltransferase 36  27.74 
 
 		 2881 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.150749 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3150  hypothetical protein  22.37 
 
 		 541 aa  43.9  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>