66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5795 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5795  ATP binding protein  100 
 
 		 244 aa  506  9.999999999999999e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0894168 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2929  putative ATP binding protein  48.36 
 
 		 274 aa  258  4e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.177336  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11968  hypothetical protein  48.95 
 
 		 240 aa  258  6e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0019  ATP binding protein  44.96 
 
 		 223 aa  215  5e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1767  ATPase  44.49 
 
 		 244 aa  212  4.9999999999999996e-54  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0219688  normal  0.0604046 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0072  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  44.08 
 
 		 223 aa  189  4e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0064  hypothetical protein  40 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.677678  normal  0.181447 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2428  ATPase  41.95 
 
 		 222 aa  186  3e-46  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1360  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  42.79 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3648  protein of unknown function DUF71, ATPase  41.83 
 
 		 226 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.224253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4520  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  44.02 
 
 		 224 aa  156  3e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.397498  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1853  ATP binding protein  38.94 
 
 		 222 aa  156  3e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0716  putative ATP binding protein  35.41 
 
 		 210 aa  137  2e-31  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1118  hypothetical protein  34.93 
 
 		 217 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.391916  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1299  hypothetical protein  34.93 
 
 		 217 aa  129  6e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.118621  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3339  hypothetical protein  37.81 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.90487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1771  putative ATP binding protein  35.27 
 
 		 219 aa  123  3e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00331125 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1100  hypothetical protein  33.01 
 
 		 217 aa  120  1.9999999999999998e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1372  putative ATP binding protein  38.5 
 
 		 213 aa  117  9.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0726  hypothetical protein  33.65 
 
 		 227 aa  117  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0285  putative ATP binding protein  31.58 
 
 		 242 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_95  PP-loop ATPase  31.6 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1335  PP-loop ATPase  31.6 
 
 		 242 aa  115  5e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_80  PP-loop ATPase  31.16 
 
 		 250 aa  115  7.999999999999999e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0238  hypothetical protein  30.23 
 
 		 250 aa  113  3e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.864712  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0713  hypothetical protein  32.86 
 
 		 232 aa  112  6e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1384  PP-loop ATPase  29.22 
 
 		 245 aa  112  7.000000000000001e-24  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0110  putative ATP binding protein  29.88 
 
 		 248 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2885  hypothetical protein  30.15 
 
 		 223 aa  108  1e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.118092  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0105  putative ATP binding protein  30.56 
 
 		 288 aa  106  3e-22  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0139  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  33.52 
 
 		 196 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002157  ATPase of the PP-loop superfamily  29.05 
 
 		 227 aa  99  6e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000429654  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1634  putative ATP binding protein  30.99 
 
 		 226 aa  84  0.000000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0310  transcriptional regulator, putative  26.25 
 
 		 572 aa  67  0.0000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1107  putative ATP binding protein  25.11 
 
 		 229 aa  65.5  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0529  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  30.05 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.111834  normal  0.30018 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2709  ATP binding protein  29.03 
 
 		 242 aa  64.7  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1451  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  30.11 
 
 		 201 aa  65.1  0.000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.970916 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1352  putative ATP binding protein  26.21 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.426698  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0466  hypothetical protein  24.64 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.460863  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0933  tryptophan synthase  28.57 
 
 		 218 aa  62.4  0.000000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.93899  normal  0.081197 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0992  putative ATP binding protein  25.24 
 
 		 226 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.100611 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1530  putative ATP binding protein  24.02 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00257  ATPase  38.36 
 
 		 101 aa  58.9  0.00000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1584  protein of unknown function DUF71, ATP-binding region  26.57 
 
 		 225 aa  58.5  0.00000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1093  ATP binding protein  25.24 
 
 		 221 aa  58.2  0.0000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000290259  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2825  ATP binding protein  30 
 
 		 241 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0951589  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2025  putative ATP binding protein  24.37 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.307354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_35058  predicted protein  27.08 
 
 		 672 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_43636  predicted protein  24.77 
 
 		 652 aa  57.8  0.0000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.26747 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1253  putative ATP binding protein  25.37 
 
 		 224 aa  56.6  0.0000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0609  ATP binding protein  26.34 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1331  putative ATP binding protein  26.34 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000007  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1344  putative ATP binding protein  26.34 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.324314  normal  0.0449354 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1245  ATP binding protein  22.17 
 
 		 235 aa  55.5  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2610  ATP binding protein  26.96 
 
 		 245 aa  54.7  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2904  hypothetical protein  28.1 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449464  hitchhiker  0.000871155 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1353  putative ATP binding protein  24.64 
 
 		 222 aa  53.9  0.000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1875  putative ATP binding protein  23.89 
 
 		 258 aa  52.4  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0801  ATP binding protein  28.57 
 
 		 238 aa  52  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.789554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1353  ATP binding protein  27.59 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1010  putative ATP binding protein  23.56 
 
 		 244 aa  52  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0530  putative ATP binding protein  23.3 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0164  putative ATP binding protein  22.61 
 
 		 232 aa  44.3  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1736  ATP binding protein  21.5 
 
 		 222 aa  43.5  0.003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1086  ATP binding protein  22.75 
 
 		 218 aa  42.4  0.008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00130947  normal  0.155895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>