45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4677 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4677  Curlin associated repeat protein  100 
 
 		 392 aa  741    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119342  normal  0.286934 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1516  curlin-associated protein  31.93 
 
 		 552 aa  100  4e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.977405  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3235  curlin-associated protein  31.17 
 
 		 627 aa  92.8  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4726  Curlin associated repeat protein  31.75 
 
 		 415 aa  89  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6064  Curlin associated repeat protein  30.24 
 
 		 453 aa  77.4  0.0000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4724  hypothetical protein  31.47 
 
 		 470 aa  74.7  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2550  curlin-associated protein  33.75 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.895792  normal  0.0129391 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1877  Curlin associated repeat protein  30.8 
 
 		 441 aa  72.4  0.00000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2364  curlin-associated protein  29.84 
 
 		 498 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3499  curlin-associated protein  29.7 
 
 		 496 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.95975  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1996  curlin associated  31.34 
 
 		 483 aa  70.5  0.00000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.425748  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6066  Curlin associated repeat protein  29.25 
 
 		 578 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0876  curlin-associated protein  29.05 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3095  curlin associated  28.31 
 
 		 498 aa  69.3  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.33683  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0864  Curlin associated repeat protein  29.05 
 
 		 496 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0841  curlin-associated protein  28.89 
 
 		 496 aa  67.8  0.0000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3136  curlin-associated protein  27.78 
 
 		 496 aa  65.5  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1514  curlin-associated protein  30.32 
 
 		 517 aa  65.1  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2947  hypothetical protein  28.4 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.424974  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0721  curlin-associated protein  26.75 
 
 		 502 aa  64.7  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.000376706  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0645  curlin-associated protein  29.82 
 
 		 503 aa  63.5  0.000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.572248  unclonable  0.0000000277194 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3413  curlin-associated protein  26.75 
 
 		 502 aa  63.5  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.602514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2590  curlin associated protein  32.71 
 
 		 457 aa  63.2  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0823306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0376  curlin-associated protein  30.3 
 
 		 564 aa  62  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0865  hypothetical protein  27.71 
 
 		 502 aa  61.6  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1269  Curlin associated repeat protein  26.64 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3300  curlin-associated protein  26.81 
 
 		 451 aa  55.8  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2955  curlin-associated protein  31.03 
 
 		 481 aa  54.7  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0863246  normal  0.318983 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0034  hypothetical protein  30.33 
 
 		 400 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0940044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3364  Curlin associated repeat protein  31.27 
 
 		 241 aa  54.7  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.730228  normal  0.191795 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3135  curlin-associated protein  40 
 
 		 139 aa  53.1  0.000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0865  Curlin associated repeat protein  39.05 
 
 		 139 aa  52.4  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3498  curlin-associated protein  39.05 
 
 		 139 aa  52  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.477257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2946  minor curlin subunit CsgB, putative  40.26 
 
 		 144 aa  51.2  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.121135 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0877  curlin-associated protein  38.1 
 
 		 139 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0842  curlin-associated protein  38.1 
 
 		 139 aa  50.4  0.00005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3750  Curlin associated repeat protein  33.22 
 
 		 585 aa  50.1  0.00006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2728  curlin associated  29.24 
 
 		 434 aa  48.5  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.718258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3094  curlin associated  42.68 
 
 		 142 aa  48.5  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.884996  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3299  curlin-associated protein  37.5 
 
 		 139 aa  47.8  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.518948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3412  curlin-associated protein  37.14 
 
 		 139 aa  46.2  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.179505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0722  curlin-associated protein  37.14 
 
 		 139 aa  45.8  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0634124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2346  curlin-associated protein  30.81 
 
 		 281 aa  45.1  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0866  minor curlin subunit CsgB, putative  36.19 
 
 		 139 aa  45.1  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01503  putative secreted major subunit of curlin, may bind calcium  26.98 
 
 		 483 aa  43.9  0.005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>