73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36740 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36740  ArsR family regulatory protein  100 
 
 		 230 aa  445  1.0000000000000001e-124  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.929416  normal  0.251119 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2040  regulatory protein ArsR  46.75 
 
 		 201 aa  128  6e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1322  transcriptional regulator, ArsR family  37.06 
 
 		 210 aa  94.4  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.302064  normal  0.0955096 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2358  transcriptional regulator, ArsR family  31.16 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.276644  normal  0.13645 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4924  transcriptional regulator, ArsR family  35.12 
 
 		 193 aa  87  2e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.864535  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2681  transcriptional regulator, ArsR family  31.89 
 
 		 214 aa  83.6  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08060  ArsR family regulatory protein  33.7 
 
 		 232 aa  83.2  0.000000000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.365451  normal  0.146174 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1813  ArsR family transcriptional regulator  39.26 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0789444  hitchhiker  0.0000651262 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2755  regulatory protein, ArsR  32.37 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.083885  normal  0.132738 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2302  regulatory protein, ArsR  36.72 
 
 		 201 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.71264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4753  transcriptional regulator, ArsR family  34.78 
 
 		 206 aa  77.4  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7118  transcriptional regulator, ArsR family  44.57 
 
 		 180 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4088  putative transcriptional regulator protein, ArsR family  41.23 
 
 		 213 aa  75.5  0.0000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1862  putative transcriptional regulator, ArsR family  32.4 
 
 		 213 aa  75.1  0.0000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0267319 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1822  regulatory protein, ArsR  38.01 
 
 		 198 aa  74.7  0.000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00289732  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18080  predicted transcriptional regulator  35.44 
 
 		 211 aa  69.7  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.493664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4497  regulatory protein, ArsR  32.57 
 
 		 224 aa  69.3  0.00000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.175286  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1441  transcriptional regulator, ArsR family  40 
 
 		 192 aa  68.2  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27290  hypothetical protein  34.78 
 
 		 212 aa  67  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.109442  normal  0.290934 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4321  ArsR family transcriptional regulator  33.13 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120832  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20540  ArsR family regulatory protein  34.52 
 
 		 187 aa  65.1  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.614505 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2503  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.118338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2257  transcriptional regulator, ArsR family  49.25 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  0.865774 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5019  transcriptional regulator, ArsR family  42.31 
 
 		 227 aa  63.9  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7390  hypothetical protein  34.81 
 
 		 196 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1212  transcriptional regulator, ArsR family  31.14 
 
 		 212 aa  61.6  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.838465 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2961  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.13 
 
 		 213 aa  60.8  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.878538  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0321  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 195 aa  60.5  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.322661  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2852  ArsR family transcriptional regulator  36.5 
 
 		 230 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.260551  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4545  ArsR family transcriptional regulator  40.28 
 
 		 187 aa  60.1  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0707495  normal  0.191523 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02100  predicted transcriptional regulator  34.21 
 
 		 192 aa  58.5  0.00000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2909  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.78 
 
 		 243 aa  57.4  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0487501  normal  0.155618 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0521  putative transcriptional regulator  38.57 
 
 		 191 aa  50.1  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.124685  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0075  regulatory protein ArsR  26.63 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.493033  normal  0.853303 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0259  transcriptional regulator, ArsR family  34.75 
 
 		 171 aa  46.2  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.792172  normal  0.339898 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05590  hypothetical protein  28.4 
 
 		 197 aa  45.8  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.604639  normal  0.83451 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2826  regulatory protein, ArsR  45.1 
 
 		 112 aa  44.7  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0214569  hitchhiker  0.000742235 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1338  putative transcriptional regulator  39.66 
 
 		 230 aa  43.9  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1225  transcriptional regulator, ArsR family  26.63 
 
 		 193 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.233594 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1421  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 113 aa  44.3  0.002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.116907  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2967  transcriptional regulator, ArsR family  39.47 
 
 		 183 aa  44.3  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.048308 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0631  ArsR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 108 aa  43.5  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2317  transcriptional regulator, ArsR family  54.9 
 
 		 115 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.161195 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4978  ArsR family transcriptional regulator  39.76 
 
 		 137 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0407948  normal  0.625296 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2009  ArsR family transcriptional regulator  48.98 
 
 		 118 aa  43.5  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.602726 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  37.5 
 
 		 391 aa  43.5  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  39.13 
 
 		 125 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0142  ArsR family transcriptional regulator  33.96 
 
 		 98 aa  42.7  0.004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2853  putative transcriptional regulator  39.13 
 
 		 193 aa  42.7  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.76719  decreased coverage  0.00327558 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4382  ArsR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 107 aa  42.7  0.005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.39 
 
 		 111 aa  42.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000621973 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4613  ArsR family transcriptional regulator  41.43 
 
 		 120 aa  42.4  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.296682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1965  transcriptional regulator, ArsR family  44 
 
 		 102 aa  42.4  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.891597 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0618  regulatory protein, ArsR  36.36 
 
 		 210 aa  42.4  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4982  putative transcriptional regulator, ArsR family  44.29 
 
 		 111 aa  42.4  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2878  transcriptional regulator, MarR family  36.67 
 
 		 112 aa  42.4  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0740  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 95 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000116934  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5219  transcriptional regulator, ArsR family  41.67 
 
 		 118 aa  42.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0522  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000193474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0612  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000261335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6418  transcriptional regulator, ArsR family  36.23 
 
 		 124 aa  42  0.008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0522  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.61865e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0578  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000313265  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0270  transcriptional regulator, TrmB  45.1 
 
 		 102 aa  42  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0526  ArsR family transcriptional regulator  35.82 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000387166  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  36.49 
 
 		 121 aa  42  0.008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4688  transcriptional regulator, ArsR family  35.82 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000941473  hitchhiker  1.78464e-24 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0667  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.44996e-48 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0680  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000146838  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0870  transcriptional regulator, ArsR family  39.22 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.680607 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0529  regulatory protein ArsR  35.82 
 
 		 95 aa  42  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000128704  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2463  transcriptional regulator, TrmB  44.62 
 
 		 110 aa  42  0.009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.473489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0649  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 95 aa  42  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000126178  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>