More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_35260 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_35260  uncharacterized membrane-associated protein  100 
 
 
277 aa  554  1e-157  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2971  SNARE associated Golgi protein-related protein  60.29 
 
 
286 aa  303  3e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0017  SNARE associated Golgi protein  52.54 
 
 
363 aa  253  2e-66  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.447324  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0031  hypothetical protein  48.71 
 
 
268 aa  243  2e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6926  SNARE associated Golgi protein  53.64 
 
 
249 aa  244  2e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  56.59 
 
 
237 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0132  SNARE associated Golgi protein  56.1 
 
 
237 aa  237  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.365407  decreased coverage  2.35996e-05 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4065  SNARE associated Golgi protein-like protein  48.95 
 
 
240 aa  228  6e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2311  SNARE associated Golgi protein  48.12 
 
 
259 aa  226  3e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.16146e-09 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2579  hypothetical protein  52.4 
 
 
256 aa  220  2e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00440757  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0237  hypothetical protein  47.41 
 
 
236 aa  207  2e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0668  hypothetical protein  46.98 
 
 
232 aa  207  2e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.791744 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10369  transmembrane protein  47.52 
 
 
227 aa  199  6e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.702136 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0509  SNARE associated Golgi protein-related protein  48.13 
 
 
239 aa  195  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2555  hypothetical protein  47.03 
 
 
219 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2718  hypothetical protein  47.03 
 
 
219 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2509  hypothetical protein  47.03 
 
 
219 aa  194  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2468  hypothetical protein  48.42 
 
 
219 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02242  conserved inner membrane protein  48.42 
 
 
219 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02202  hypothetical protein  48.42 
 
 
219 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3457  hypothetical protein  48.42 
 
 
219 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1339  SNARE associated Golgi protein-like protein  48.42 
 
 
219 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.217693  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1335  hypothetical protein  48.42 
 
 
219 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.64425 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2597  hypothetical protein  47.03 
 
 
219 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.651507 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2799  hypothetical protein  45.37 
 
 
220 aa  193  3e-48  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.606088  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2609  hypothetical protein  46.53 
 
 
219 aa  193  3e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.36856  normal  0.051576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1466  hypothetical protein  45.85 
 
 
221 aa  192  5e-48  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2866  hypothetical protein  47.52 
 
 
219 aa  192  6e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.416299 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2611  hypothetical protein  47.37 
 
 
219 aa  191  1e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2473  hypothetical protein  47.37 
 
 
219 aa  190  2e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2695  hypothetical protein  47.37 
 
 
219 aa  189  4e-47  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0512  hypothetical protein  46.85 
 
 
231 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0490  hypothetical protein  46.85 
 
 
231 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.164166  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0501  hypothetical protein  46.85 
 
 
231 aa  189  5e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3333  hypothetical protein  47.24 
 
 
220 aa  187  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00119993  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4066  SNARE associated Golgi protein-like protein  49.01 
 
 
248 aa  186  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2715  SNARE associated Golgi protein  43.15 
 
 
221 aa  181  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.65306 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1369  hypothetical protein  45.92 
 
 
221 aa  180  3e-44  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.25777  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4180  SNARE associated Golgi protein  43.75 
 
 
246 aa  177  2e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.531841  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30240  uncharacterized membrane-associated protein  44.22 
 
 
228 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.397546 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2575  hypothetical protein  43.06 
 
 
232 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  46.6 
 
 
220 aa  176  5e-43  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  46.6 
 
 
220 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5157  SNARE associated Golgi protein  40.37 
 
 
235 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  46.6 
 
 
220 aa  176  5e-43  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4379  hypothetical protein  48.86 
 
 
234 aa  175  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.76296  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4224  DedA protein (DSG-1 protein)  42.23 
 
 
220 aa  175  7e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0539738  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3465  SNARE associated Golgi protein  42.93 
 
 
222 aa  172  4e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.133962  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1595  phosphoesterase, PA-phosphatase related  46.77 
 
 
458 aa  172  4e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1169  SNARE associated Golgi protein  41.9 
 
 
217 aa  172  6e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.922899  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11720  hypothetical protein  45.5 
 
 
221 aa  172  6e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3663  SNARE associated Golgi protein-like protein  41.71 
 
 
209 aa  171  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0005  integral membrane protein; DedA family protein  44.14 
 
 
218 aa  171  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.695694  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1076  hypothetical protein  45.5 
 
 
221 aa  169  5e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.313022  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1467  SNARE associated Golgi protein  43.5 
 
 
213 aa  169  5e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1301  DedA protein (DSG-1 protein)  42.21 
 
 
230 aa  167  1e-40  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0955835  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5129  SNARE associated Golgi protein  41.21 
 
 
244 aa  165  7e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.958225 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1150  SNARE associated Golgi protein  41.62 
 
 
224 aa  163  3e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  3.66321e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2173  hypothetical protein  41.27 
 
 
218 aa  161  8e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0895  SNARE associated Golgi protein  43.56 
 
 
220 aa  160  1e-38  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2201  hypothetical protein  40.74 
 
 
218 aa  161  1e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3379  SNARE associated Golgi protein-related protein  47.4 
 
 
216 aa  161  1e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0980  DedA protein (DSG-1 protein)  43.07 
 
 
220 aa  160  2e-38  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.275118  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1127  SNARE associated Golgi protein  41.26 
 
 
219 aa  160  2e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.325402 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1167  DedA protein (DSG-1 protein)  40.39 
 
 
219 aa  159  6e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.482076  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1943  DedA protein  43.28 
 
 
220 aa  159  7e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.777005  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4353  DedA family membrane protein  40.18 
 
 
247 aa  158  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2029  DedA protein (DSG-1 protein)  41.33 
 
 
218 aa  158  9e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1317  SNARE associated Golgi protein  46.99 
 
 
223 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0112006  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4994  hypothetical protein  44.22 
 
 
216 aa  155  5e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.579773 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0086  SNARE associated Golgi protein  44.95 
 
 
216 aa  154  1e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.862215  hitchhiker  0.00916794 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0585  SNARE associated Golgi protein  43.01 
 
 
215 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.654254 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0575  DedA family protein  40.82 
 
 
213 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.684924  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3305  DedA protein (DSG-1 protein)  41.71 
 
 
215 aa  154  2e-36  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25714  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1312  SNARE associated Golgi protein  40.4 
 
 
229 aa  153  3e-36  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.192929 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0724  DedA family protein  45.03 
 
 
215 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1759  hypothetical protein  41.8 
 
 
213 aa  151  1e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.335415  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0303  DedA protein  45.6 
 
 
222 aa  151  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0592  SNARE associated Golgi protein  44.09 
 
 
215 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1321  hypothetical protein  40.29 
 
 
253 aa  150  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.777218  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3208  DedA protein (DSG-1 protein)  38.81 
 
 
215 aa  150  3e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.043821  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1497  SNARE associated Golgi protein-like protein  43.84 
 
 
201 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.330026  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1474  SNARE associated Golgi protein  38.14 
 
 
214 aa  150  3e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4444  SNARE associated Golgi protein  39.2 
 
 
218 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27115  predicted protein  43.15 
 
 
252 aa  149  7e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000197052  normal  0.0145567 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1987  SNARE associated Golgi protein  42.11 
 
 
222 aa  148  8e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.446526  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0626  hypothetical protein  42.93 
 
 
215 aa  148  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1142  SNARE associated Golgi protein  42.21 
 
 
216 aa  147  1e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0706  SNARE associated Golgi protein-like protein  45.71 
 
 
213 aa  147  2e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.240923  normal  0.524025 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3395  SNARE associated Golgi protein  38.92 
 
 
216 aa  147  2e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2073  SNARE associated Golgi protein-like protein  43 
 
 
231 aa  147  2e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0994  DedA family protein  38.27 
 
 
214 aa  146  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00874601  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  38.03 
 
 
220 aa  147  3e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0244  SNARE associated Golgi protein  41.63 
 
 
237 aa  146  3e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.052895  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2482  dedA protein  45.99 
 
 
198 aa  146  4e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.323289  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3163  hypothetical protein  43.86 
 
 
213 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0592  DedA family protein  41 
 
 
219 aa  146  5e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2620  SNARE associated Golgi protein  39.13 
 
 
227 aa  145  8e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1159  dedA protein  37.76 
 
 
214 aa  144  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  6.84044e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2425  hypothetical protein  41.41 
 
 
262 aa  143  2e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>