More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_30830 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_2925  Xanthine/uracil/vitamin C permease  69.74 
 
 		 491 aa  660    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.703881  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30830  permease  100 
 
 		 494 aa  945    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.896956  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0864  Xanthine/uracil/vitamin C permease  71.72 
 
 		 517 aa  630  1e-179  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.214606  normal  0.081922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0025  Xanthine/uracil/vitamin C permease  62.9 
 
 		 515 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24090  permease  64.03 
 
 		 484 aa  572  1.0000000000000001e-162  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1382  Xanthine/uracil/vitamin C permease  66.46 
 
 		 488 aa  564  1.0000000000000001e-159  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0835214  normal  0.0315354 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3290  xanthine/uracil/vitamin C permease  60.84 
 
 		 506 aa  564  1.0000000000000001e-159  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.179403 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1996  Xanthine/uracil/vitamin C permease  63.42 
 
 		 518 aa  563  1.0000000000000001e-159  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3928  xanthine/uracil/vitamin C permease  61.26 
 
 		 491 aa  555  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8894  xanthine/uracil/vitamin C transporter  57.93 
 
 		 487 aa  529  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13510  permease  60.81 
 
 		 502 aa  528  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.283418  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0416  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.18 
 
 		 490 aa  488  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355701 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0504  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.05 
 
 		 490 aa  486  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000228802 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0817  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.71 
 
 		 507 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8411  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.37 
 
 		 463 aa  484  1e-135  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0240  putative xanthine/uracil permease  52.79 
 
 		 493 aa  484  1e-135  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0601  Xanthine/uracil/vitamin C permease  54.32 
 
 		 481 aa  480  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000948435 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1251  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.43 
 
 		 491 aa  477  1e-133  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.481719  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0380  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.62 
 
 		 480 aa  473  1e-132  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33970  permease  53.27 
 
 		 488 aa  466  9.999999999999999e-131  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.114648  normal  0.793617 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4178  Xanthine/uracil/vitamin C permease  51.84 
 
 		 484 aa  467  9.999999999999999e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.214839  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0138  Xanthine/uracil/vitamin C permease  53.2 
 
 		 486 aa  459  9.999999999999999e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.798704  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3423  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.43 
 
 		 498 aa  453  1.0000000000000001e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3203  Xanthine/uracil/vitamin C permease  50.72 
 
 		 521 aa  449  1e-125  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0488  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.53 
 
 		 479 aa  439  9.999999999999999e-123  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3129  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.28 
 
 		 475 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0337954  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2543  Xanthine/uracil/vitamin C permease  49.59 
 
 		 483 aa  435  1e-121  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0284041  normal  0.0397095 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2567  xanthine/uracil/vitamin C permease  51.05 
 
 		 461 aa  423  1e-117  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.33945  normal  0.390928 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0346  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.28 
 
 		 470 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0392  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.17 
 
 		 470 aa  405  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.225855  normal  0.649259 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4306  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.96 
 
 		 465 aa  400  9.999999999999999e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17840  permease  51.34 
 
 		 496 aa  397  1e-109  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.457216  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0342  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.96 
 
 		 471 aa  394  1e-108  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0353  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.96 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.457935  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0363  xanthine/uracil/vitamin C permease  48.96 
 
 		 471 aa  395  1e-108  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.92632 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0597  Xanthine/uracil/vitamin C permease  45.18 
 
 		 496 aa  385  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2228  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.42 
 
 		 480 aa  363  4e-99  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0279599  normal  0.0422886 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3345  xanthine/uracil/vitamin C transporter  46.44 
 
 		 456 aa  356  5e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3426  Xanthine/uracil/vitamin C permease  46.86 
 
 		 456 aa  356  6.999999999999999e-97  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3490  Xanthine/uracil/vitamin C permease  47.28 
 
 		 456 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.534774  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3412  xanthine/uracil/vitamin C permease  47.72 
 
 		 460 aa  350  2e-95  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.992629  normal  0.11074 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1118  xanthine/uracil/vitamin C permease  40.64 
 
 		 442 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.286705 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1835  xanthine/uracil permease family protein  38.51 
 
 		 444 aa  312  1e-83  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.000000130891  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0766  Xanthine/uracil/vitamin C permease  40.08 
 
 		 438 aa  309  9e-83  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.383073  normal  0.743941 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03550  permease  40.38 
 
 		 437 aa  305  1.0000000000000001e-81  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0299819 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2280  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000412367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2321  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 		 444 aa  300  3e-80  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000388996  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2962  xanthine/uracil/vitamin C permease  42.33 
 
 		 452 aa  297  2e-79  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.610327  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2522  Xanthine/uracil/vitamin C permease  43.57 
 
 		 438 aa  294  2e-78  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.013559  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0516  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.36 
 
 		 460 aa  294  2e-78  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000274491  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1115  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.76 
 
 		 441 aa  289  7e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02510  Xanthine/uracil/vitamin C permease  39.02 
 
 		 443 aa  287  2.9999999999999996e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0238  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.5 
 
 		 441 aa  286  7e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1745  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.27 
 
 		 440 aa  285  9e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04970  Xanthine/uracil/vitamin C permease  37.92 
 
 		 433 aa  286  9e-76  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.131082  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0393  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.97 
 
 		 437 aa  281  2e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.796704  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0993  putative guanine/hypoxanthine or xanthine/uracil permease  38.92 
 
 		 428 aa  281  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2728  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.56 
 
 		 429 aa  280  4e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000027248  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2421  xanthine/uracil/vitamin C permease  38.46 
 
 		 443 aa  280  4e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01158  permease  37.45 
 
 		 429 aa  278  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0974  membrane permease  37.18 
 
 		 430 aa  276  7e-73  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.827979  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3169  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.09 
 
 		 442 aa  275  1.0000000000000001e-72  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000290647  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004272  xanthine/uracil/thiamine/ascorbate permease family protein  37.45 
 
 		 429 aa  275  1.0000000000000001e-72  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1232  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.5 
 
 		 441 aa  274  3e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.444446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0940  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.12 
 
 		 463 aa  273  4.0000000000000004e-72  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1453  Xanthine/uracil/vitamin C permease  35.11 
 
 		 462 aa  273  5.000000000000001e-72  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5022  xanthine/uracil permease family protein  38.09 
 
 		 441 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000757996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0965  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.11 
 
 		 429 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0293  xanthine/uracil permease family protein  37.87 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.903242  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0255  xanthine/uracil permease family protein  37.66 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0241  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  37.66 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.864417  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0302  xanthine/uracil permease family protein  38.09 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00487612  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0270  xanthine/uracil permease family protein  37.66 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0137601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1868  hypothetical protein  36.75 
 
 		 430 aa  271  2e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0492643  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0321  xanthine/uracil permease family protein  37.66 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000181359  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0244  guanine-hypoxanthine permease; xanthine/uracil permease family protein  37.45 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0242401  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0295  xanthine/uracil permease family protein  37.66 
 
 		 441 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1360  xanthine/uracil permease family protein  37.39 
 
 		 434 aa  270  4e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0202  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 		 446 aa  270  5e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  hitchhiker  0.00866517  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1598  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.62 
 
 		 435 aa  270  5e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3244  xanthine/uracil/vitamin C permease  34.88 
 
 		 461 aa  270  5e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3904  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.59 
 
 		 453 aa  269  7e-71  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2607  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.04 
 
 		 466 aa  269  1e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3417  xanthine/uracil/vitamin C permease  35.11 
 
 		 429 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.933273 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1611  xanthine/uracil permease family protein  37.87 
 
 		 458 aa  267  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0248  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.23 
 
 		 441 aa  267  2.9999999999999995e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000150063  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0846  xanthine/uracil family permease  34.83 
 
 		 436 aa  266  5e-70  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4897  xanthine/uracil/vitamin C permease  37.42 
 
 		 431 aa  266  8e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.419904  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4060  inner membrane protein YicO  36.23 
 
 		 445 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4182  hypothetical protein  36.23 
 
 		 445 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.848417  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4075  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  36.23 
 
 		 445 aa  266  8.999999999999999e-70  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4029  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.58 
 
 		 448 aa  265  2e-69  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.607592 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4132  inner membrane protein YicO  35.61 
 
 		 445 aa  265  2e-69  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0691662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2111  Xanthine/uracil/vitamin C permease  36.67 
 
 		 428 aa  264  3e-69  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000533126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4172  sulfate permease family inorganic anion transporter  34.44 
 
 		 470 aa  264  3e-69  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0797  Xanthine/uracil/vitamin C permease  34.24 
 
 		 467 aa  264  3e-69  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.400193 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03548  predicted xanthine/uracil permase  34.44 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03490  hypothetical protein  34.44 
 
 		 444 aa  263  6e-69  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4255  inorganic anion transporter, sulfate permease (SulP) family  34.44 
 
 		 470 aa  263  6.999999999999999e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4241  xanthine/uracil/vitamin C permease  36.62 
 
 		 442 aa  262  8.999999999999999e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>