More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_19700 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_19700  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 		 200 aa  395  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0754126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  51.26 
 
 		 200 aa  190  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  41.45 
 
 		 197 aa  132  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2752  Methyltransferase type 12  40.8 
 
 		 225 aa  122  4e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4583  Methyltransferase type 11  40.39 
 
 		 220 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.130075 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39 
 
 		 233 aa  106  2e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.420732  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  37.13 
 
 		 203 aa  103  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 211 aa  93.6  2e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1502  Methyltransferase type 12  34.63 
 
 		 223 aa  92.8  3e-18  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1258  hypothetical protein  41.09 
 
 		 238 aa  88.2  7e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4082  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 198 aa  85.5  5e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0341683  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.36 
 
 		 268 aa  81.3  0.000000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1197  Methyltransferase type 12  30.38 
 
 		 289 aa  79.7  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.11 
 
 		 233 aa  68.2  0.00000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  39.68 
 
 		 232 aa  68.2  0.00000000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  38.61 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0800  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000119753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2575  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 		 251 aa  67  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000803036  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0840  biotin biosynthesis protein BioC  36.84 
 
 		 251 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 272 aa  65.5  0.0000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1279  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.89 
 
 		 253 aa  65.1  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  25.91 
 
 		 213 aa  64.7  0.0000000009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  35.96 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  35.96 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  35.96 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  35.96 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  25 
 
 		 194 aa  64.3  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  35.96 
 
 		 251 aa  64.3  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  36.14 
 
 		 263 aa  64.3  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  38.05 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.42 
 
 		 235 aa  63.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2718  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 		 230 aa  63.2  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.566379 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  33.88 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  33.03 
 
 		 199 aa  63.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3913  methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 232 aa  62.8  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119732  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.6 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.15 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3679  hypothetical protein  38.78 
 
 		 244 aa  61.6  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.278991 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  37.04 
 
 		 238 aa  61.6  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  29.09 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 267 aa  61.6  0.000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 240 aa  61.6  0.000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  38.95 
 
 		 252 aa  61.2  0.000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2828  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.54 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0566454  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0264  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 252 aa  60.1  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  37.86 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  36.04 
 
 		 265 aa  59.7  0.00000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  31.45 
 
 		 205 aa  59.3  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  33.62 
 
 		 255 aa  59.7  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3346  Methyltransferase type 11  35.2 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  40.7 
 
 		 194 aa  59.3  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1858  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.5 
 
 		 245 aa  58.9  0.00000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  32.11 
 
 		 252 aa  59.3  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 		 238 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  35.92 
 
 		 251 aa  58.9  0.00000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  37.84 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  35.51 
 
 		 296 aa  58.5  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2013  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.56 
 
 		 241 aa  58.5  0.00000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2596  biotin biosynthesis protein bioC  30.3 
 
 		 265 aa  58.2  0.00000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.093326  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2906  methyltransferase  39.62 
 
 		 248 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00515512  hitchhiker  0.000112395 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  34.82 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1690  Methyltransferase type 11  40.59 
 
 		 285 aa  58.2  0.00000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0193071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4425  methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 262 aa  58.5  0.00000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102836  normal  0.287125 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2267  Methyltransferase type 11  33.94 
 
 		 208 aa  58.2  0.00000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3913  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.100491  normal  0.248183 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2486  23S rRNA methyltransferase A  31.68 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.228527  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.97 
 
 		 243 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2537  biotin biosynthesis protein BioC  34.34 
 
 		 260 aa  58.2  0.00000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000300876  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3864  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 305 aa  58.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  33.04 
 
 		 292 aa  58.2  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.04 
 
 		 250 aa  58.2  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3723  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 238 aa  58.2  0.00000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0601738  normal  0.421349 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2207  Methyltransferase type 11  39.78 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  34.51 
 
 		 253 aa  58.2  0.00000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.32 
 
 		 236 aa  58.2  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.08 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1268  biotin biosynthesis protein BioC  30.38 
 
 		 251 aa  57.8  0.0000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00543221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  33.9 
 
 		 229 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  36.7 
 
 		 251 aa  57.4  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2091  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00620726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3983  methyltransferase type 11  33 
 
 		 293 aa  57  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.307607  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  32.14 
 
 		 292 aa  56.6  0.0000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  34.95 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  35.79 
 
 		 266 aa  56.2  0.0000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  34.95 
 
 		 251 aa  56.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>