188 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3518 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3518  thioesterase superfamily protein  100 
 
 		 144 aa  303  5.0000000000000004e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4603  thioesterase superfamily protein  83.21 
 
 		 154 aa  254  2e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0830506 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0318  thioesterase superfamily protein  80.85 
 
 		 159 aa  253  4e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00109584 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0343  thioesterase superfamily protein  77.54 
 
 		 143 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.0418657 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0335  thioesterase superfamily protein  77.54 
 
 		 143 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0333  thioesterase superfamily protein  77.54 
 
 		 143 aa  236  8e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0439  thioesterase superfamily protein  77.54 
 
 		 144 aa  236  1e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0334  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  76.81 
 
 		 144 aa  234  4e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0340  thioesterase superfamily protein  76.81 
 
 		 143 aa  233  8e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0343  thioesterase superfamily protein  76.09 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3683  thioesterase superfamily protein  76.09 
 
 		 144 aa  231  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3895  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  70.5 
 
 		 149 aa  227  4e-59  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4375  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  72.46 
 
 		 144 aa  225  2e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0345  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  70 
 
 		 143 aa  224  4e-58  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3386  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  68.75 
 
 		 143 aa  218  3e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3892  thioesterase superfamily protein  56.49 
 
 		 140 aa  176  1e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.725738 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4807  thioesterase superfamily protein  55.73 
 
 		 140 aa  175  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.777198  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5100  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  52.17 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0432  thioesterase superfamily protein  51.47 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.17123  normal  0.284958 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0896  thioesterase superfamily protein  51.54 
 
 		 142 aa  164  5e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.155236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0431  thioesterase superfamily protein  50.35 
 
 		 149 aa  163  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4575  thioesterase superfamily protein  50.38 
 
 		 140 aa  157  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4384  protein with predicted thioesterase domain-containing protein  49.63 
 
 		 138 aa  157  5e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00746999  normal  0.282869 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004071  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain protein  51.54 
 
 		 148 aa  154  4e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3880  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase domain-containing protein  47.73 
 
 		 135 aa  151  2e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0934  hypothetical protein  48.87 
 
 		 143 aa  150  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2096  putative thioesterase  46.56 
 
 		 152 aa  150  8e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1494  thioesterase superfamily protein  44.93 
 
 		 139 aa  149  8.999999999999999e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00778  hypothetical protein  47.37 
 
 		 144 aa  149  1e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0697  thioesterase superfamily protein  52.46 
 
 		 143 aa  149  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3057  thioesterase superfamily protein  48.87 
 
 		 143 aa  149  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0408994  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4080  thioesterase superfamily protein  47.69 
 
 		 142 aa  142  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.339486  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3916  thioesterase superfamily protein  46.97 
 
 		 143 aa  140  4e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.445729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3605  thioesterase superfamily protein  46.92 
 
 		 142 aa  140  7e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4768  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.283541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3691  thioesterase superfamily protein  42.22 
 
 		 144 aa  133  7.000000000000001e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.36122 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0119  thioesterase  47.54 
 
 		 147 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000833529  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0284  GTP cyclohydrolase I (GTP-CH-I)  41.18 
 
 		 144 aa  114  5e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000478521  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0973  thioesterase superfamily protein  40 
 
 		 150 aa  114  5e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.192088  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0434  thioesterase superfamily protein  37.4 
 
 		 146 aa  99.4  1e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1993  thioesterase superfamily protein  29.23 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4018  thioesterase superfamily protein  30.25 
 
 		 133 aa  72  0.000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal  0.548943 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0916  thioesterase superfamily protein  34.68 
 
 		 161 aa  71.2  0.000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1860  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 149 aa  70.5  0.000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.484862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5014  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 139 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2999  thioesterase superfamily protein  30.28 
 
 		 146 aa  68.2  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000025471  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0833  thioesterase superfamily protein  30.16 
 
 		 137 aa  68.2  0.00000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.143034  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2654  thioesterase  32.81 
 
 		 149 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0218  thioesterase superfamily protein  31.58 
 
 		 145 aa  67.8  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2172  thioesterase superfamily protein  31.21 
 
 		 137 aa  67.4  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1617  thioesterase superfamily protein  28.18 
 
 		 136 aa  67  0.00000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0489355  normal  0.206223 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1196  thioesterase superfamily protein  29.17 
 
 		 138 aa  66.6  0.0000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000235881  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0597  thioesterase superfamily protein  31.91 
 
 		 142 aa  65.5  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2309  thioesterase superfamily protein  29.66 
 
 		 140 aa  63.9  0.0000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1260  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.46 
 
 		 138 aa  63.9  0.0000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2221  thioesterase superfamily protein  28.81 
 
 		 140 aa  62.8  0.000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.19331  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1639  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.81 
 
 		 140 aa  62.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.345499  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2119  thioesterase  29.84 
 
 		 138 aa  62.4  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.06428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1694  thioesterase  29.67 
 
 		 146 aa  61.2  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1421  thioesterase superfamily protein  25.23 
 
 		 136 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3293  thioesterase superfamily protein  29.67 
 
 		 155 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000000460128  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0922  thioesterase family protein  29.66 
 
 		 155 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.192568  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1216  thioesterase superfamily protein  28.46 
 
 		 144 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2049  thioesterase superfamily protein  26.15 
 
 		 138 aa  60.1  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3313  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  29.67 
 
 		 139 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000159774  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0004  thioesterase superfamily protein  30.53 
 
 		 134 aa  59.7  0.00000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2255  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00034337  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3626  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase, putative  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00511508  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3401  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000818951  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3363  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000251262  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3617  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000115588 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1601  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000385666  hitchhiker  0.0000353735 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3632  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000106479  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3667  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000698977  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1462  thioesterase superfamily protein  26.02 
 
 		 141 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000224992  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3714  putative 4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  28.57 
 
 		 139 aa  59.3  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.001251  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1413  hypothetical protein  28.81 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0631394  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1440  hypothetical protein  28.81 
 
 		 155 aa  58.9  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.030632  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04081  thioesterase  28.57 
 
 		 146 aa  58.5  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.764654 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2196  thioesterase superfamily protein  28.32 
 
 		 143 aa  58.2  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0132  thioesterase superfamily protein  25.58 
 
 		 149 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00894639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12733  Predicted esterase  26.67 
 
 		 133 aa  58.2  0.00000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1937  thioesterase superfamily protein  25.47 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2367  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  33.33 
 
 		 115 aa  57.8  0.00000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1492  putative thioesterase  24.8 
 
 		 134 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000299251  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2401  thioesterase superfamily protein  27.07 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1886  thioesterase superfamily protein  27.13 
 
 		 138 aa  57.4  0.00000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000303531  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2221  thioesterase superfamily protein  26.72 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3386  thioesterase superfamily protein  22.52 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0551  thioesterase superfamily protein  23.57 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000165317  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3550  tol-pal system-associated acyl-CoA thioesterase  29.87 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0605  thioesterase superfamily protein  25 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.646186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0672  thioesterase superfamily protein  28.04 
 
 		 145 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0239  hypothetical protein  27.4 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0185294  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1692  thioesterase superfamily protein  26.25 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.662828  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2748  thioesterase superfamily protein  23.93 
 
 		 149 aa  54.7  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1267  thioesterase superfamily protein  28.57 
 
 		 139 aa  54.3  0.0000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000790915  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1696  4-hydroxybenzoyl-CoA thioesterase  26.8 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0154661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1423  thioesterase family protein  24.07 
 
 		 136 aa  52  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.0000396165  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1094  thioesterase superfamily protein  35.44 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>