More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_1676 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_00787  fused predicted transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  79.25 
 
 		 530 aa  904    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2822  ABC transporter related protein  79.25 
 
 		 530 aa  904    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.596097  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2483  ABC transporter, ATP-binding protein  77.55 
 
 		 531 aa  881    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2150  ABC transporter ATPase  65.73 
 
 		 599 aa  710    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.911921  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0906  ABC transporter ATP-binding protein  79.43 
 
 		 530 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.753314  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2999  ABC transporter ATP-binding protein  77.36 
 
 		 587 aa  879    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000839463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3190  ABC transporter related  92.26 
 
 		 531 aa  1026    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2936  ABC transporter ATP-binding protein  76.75 
 
 		 528 aa  865    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.914866  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2209  ABC transporter related  64.31 
 
 		 530 aa  726    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2115  ABC transporter ATPase  66.41 
 
 		 549 aa  747    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.199216  normal  0.196946 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1795  ABC transporter related  66.85 
 
 		 530 aa  724    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.348279 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2836  ABC transporter related  76.56 
 
 		 528 aa  864    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.104102  normal  0.187196 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0127  ABC transporter, ATP-binding protein  72.64 
 
 		 546 aa  821    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1453  ABC transporter ATP-binding protein  65.37 
 
 		 540 aa  736    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.657517  normal  0.782574 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1500  ABC transporter related  89.46 
 
 		 522 aa  978    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.130097  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0969  ABC transporter ATP-binding protein  79.43 
 
 		 531 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.138083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1366  ABC transporter, ATP-binding protein  63.57 
 
 		 534 aa  707    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3204  ABC transporter, ATP-binding protein  78.07 
 
 		 530 aa  879    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.305557  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02269  hypothetical protein  78.49 
 
 		 530 aa  874    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2122  ABC transporter related  65.15 
 
 		 536 aa  731    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.282545  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2315  ABC transporter related  65.73 
 
 		 530 aa  734    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.751632  normal  0.0855999 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1409  ABC transporter related  89.43 
 
 		 546 aa  990    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0180506  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1690  ABC transporter, ATP-binding protein  90 
 
 		 530 aa  997    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2525  ABC transporter, ATP-binding protein  64.83 
 
 		 533 aa  735    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0100  ABC transporter, ATP-binding protein  65.73 
 
 		 599 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.388339  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2766  ABC transporter, ATP-binding protein  74.86 
 
 		 521 aa  806    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0491169  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1486  ABC transporter-related protein  90.63 
 
 		 524 aa  1003    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0878  ABC transporter, ATP-binding protein  79.43 
 
 		 530 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.720445  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2237  ABC transporter related  64.77 
 
 		 536 aa  727    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0936  ABC transporter ATP-binding protein  79.25 
 
 		 530 aa  904    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337532  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3332  ABC transporter ATP-binding protein  75.61 
 
 		 529 aa  852    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0990  ABC transporter ATP-binding protein  79.43 
 
 		 531 aa  905    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.166125  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1308  ABC transporter, ATP-binding protein  65.91 
 
 		 530 aa  716    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1386  ABC transporter, ATP-binding protein  88.49 
 
 		 531 aa  988    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.65535  normal  0.0289108 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2495  ABC transporter  75.8 
 
 		 529 aa  823    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0013  ABC transporter related  61.48 
 
 		 540 aa  684    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.189304 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1545  ABC transporter-related protein  77.54 
 
 		 522 aa  875    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1844  ABC transporter related  65 
 
 		 540 aa  736    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2003  ABC transporter related  75.99 
 
 		 528 aa  854    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.118433  decreased coverage  0.00762466 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0151  ABC transporter, ATP-binding protein  66.23 
 
 		 530 aa  733    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.175992  normal  0.980614 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2173  ABC transporter related  74.22 
 
 		 520 aa  815    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453186  normal  0.189659 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2318  putative ABC transport system, ATP-binding protein  65.73 
 
 		 555 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06614  hypothetical protein  65.7 
 
 		 526 aa  723    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  76.94 
 
 		 528 aa  867    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1676  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 531 aa  1096    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.762171  unclonable  0.00000352126 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1500  ABC transporter related  65.78 
 
 		 530 aa  708    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0377572 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5068  ABC transporter, fused ATPase subunits  65.91 
 
 		 530 aa  712    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.882741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2186  ABC transporter, ATP-binding protein  65.73 
 
 		 555 aa  715    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1333  ABC transporter related  65 
 
 		 560 aa  738    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.858749  normal  0.306045 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1606  ABC transporter related  74.62 
 
 		 528 aa  838    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1063  ABC transporter related  70.13 
 
 		 530 aa  805    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03121  ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 530 aa  754    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0877  ABC transporter, ATP-binding protein  79.25 
 
 		 530 aa  904    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1839  ABC transporter related  64.02 
 
 		 536 aa  728    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.645779  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0820  ABC transporter related  65.4 
 
 		 527 aa  715    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.354226  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1811  ABC transporter related  68.67 
 
 		 557 aa  797    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2882  ABC transporter related  73.86 
 
 		 528 aa  825    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2269  ABC transporter, ATP-binding protein  66.1 
 
 		 530 aa  717    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2288  ABC transporter related  66.85 
 
 		 536 aa  759    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2771  ABC transporter related  91.38 
 
 		 522 aa  1005    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2823  ABC transporter related  79.25 
 
 		 530 aa  904    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1559  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  74.19 
 
 		 531 aa  836    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1013  ABC transporter ATP-binding protein  64.55 
 
 		 522 aa  716    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.563969  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2581  ABC transporter related  77.74 
 
 		 531 aa  882    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1135  ABC transporter related  65.98 
 
 		 531 aa  737    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.521044  normal  0.0732961 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1770  ABC transporter related  66.48 
 
 		 530 aa  721    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.210956  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2528  ABC transporter, ATP-binding protein  79.06 
 
 		 530 aa  903    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.138533  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1943  ABC transporter, fused ATPase subunits  66.1 
 
 		 530 aa  734    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.002693  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1961  ABC transporter related  64.33 
 
 		 534 aa  733    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2240  ABC transporter related  87.93 
 
 		 522 aa  971    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2755  ABC transporter related  76.37 
 
 		 528 aa  862    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2480  ABC transporter related  70.7 
 
 		 529 aa  787    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0844  ABC transporter, ATP-binding protein  79.25 
 
 		 530 aa  904    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1311  ABC transporter related  79.25 
 
 		 531 aa  900    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1795  ABC transporter, ATP-binding protein  65.73 
 
 		 599 aa  714    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0657845  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1575  ABC transporter-related protein  64.81 
 
 		 540 aa  739    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.830365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1506  ABC transporter related  89.46 
 
 		 522 aa  978    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1681  ABC transporter related  66.16 
 
 		 522 aa  705    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.607164  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3311  ABC transporter related  67.61 
 
 		 527 aa  755    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.819079 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6309  ABC transporter related  66.48 
 
 		 530 aa  721    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1712  ABC transporter related  72.94 
 
 		 520 aa  811    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4180  ABC transporter related  66.41 
 
 		 534 aa  751    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0101186  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3260  ABC transporter ATP-binding protein, two fused  73.51 
 
 		 523 aa  815    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0410854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2370  ABC transporter related  67.8 
 
 		 536 aa  771    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2353  ABC transporter related  64.58 
 
 		 536 aa  726    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.524444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1536  ABC transporter related  89.43 
 
 		 530 aa  993    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.211854  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2750  ABC transporter related  76.94 
 
 		 528 aa  868    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.742675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2084  ABC transporter related  64.31 
 
 		 530 aa  726    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2586  ABC transporter related  90.57 
 
 		 546 aa  999    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.109376 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1891  ABC transporter related  64.31 
 
 		 530 aa  726    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.12053 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2653  ABC transporter related  90.38 
 
 		 546 aa  998    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.498071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1349  ABC transporter related  86.21 
 
 		 522 aa  955    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2077  ABC transporter related  65.91 
 
 		 553 aa  738    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2760  ABC transporter related  90.57 
 
 		 546 aa  999    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.120146  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1709  ABC transporter related  66.48 
 
 		 530 aa  721    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39130  putative ATP-binding component of ABC transporter  75.43 
 
 		 521 aa  834    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.288914 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  65.73 
 
 		 599 aa  714    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.58247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1285  ABC transporter related  66.29 
 
 		 530 aa  736    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.143824  normal  0.818875 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1127  ABC transporter, ATP-binding protein  77.36 
 
 		 530 aa  867    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0890  ABC transporter, ATP-binding protein  79.25 
 
 		 530 aa  904    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.725571  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>