More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  100 
 
 		 97 aa  198  1.9999999999999998e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.0000627266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  75.26 
 
 		 97 aa  155  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000004173  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  69.07 
 
 		 97 aa  145  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  62.89 
 
 		 97 aa  130  6.999999999999999e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000515173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  50 
 
 		 95 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000485291  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  41.05 
 
 		 112 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 95 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000905863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  45.05 
 
 		 96 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 		 95 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000046004  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 		 96 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 		 96 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 101 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 		 96 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 95 aa  83.2  0.000000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  82  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  37.23 
 
 		 94 aa  81.6  0.000000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 98 aa  81.6  0.000000000000003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 96 aa  81.3  0.000000000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 93 aa  81.3  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 94 aa  80.9  0.000000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  38.3 
 
 		 95 aa  80.9  0.000000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.000000043387  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 98 aa  80.1  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000443622  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 		 96 aa  79.7  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 		 95 aa  80.1  0.00000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 95 aa  79.3  0.00000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 97 aa  79  0.00000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000126793  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  36.46 
 
 		 96 aa  79.3  0.00000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 95 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000645168  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.84 
 
 		 94 aa  77.8  0.00000000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000293762  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 		 96 aa  77.8  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 124 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  36.96 
 
 		 95 aa  77  0.00000000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 		 96 aa  77  0.00000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 		 128 aa  76.6  0.0000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000995265  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 124 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  34.04 
 
 		 97 aa  76.3  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 122 aa  75.5  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  34.78 
 
 		 111 aa  75.9  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  38.71 
 
 		 95 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000662537  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 		 96 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 		 124 aa  75.5  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  0.0000000595408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 		 122 aa  75.1  0.0000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  39.13 
 
 		 95 aa  75.1  0.0000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 96 aa  75.1  0.0000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 		 124 aa  75.1  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  40 
 
 		 128 aa  74.7  0.0000000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108359  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 125 aa  74.7  0.0000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000278233  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000255569  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000742686  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000611758  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 		 124 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000406973  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 		 108 aa  74.7  0.0000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 		 101 aa  74.7  0.0000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  74.7  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000242081  hitchhiker  0.000000688979 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  36.17 
 
 		 96 aa  74.3  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 		 125 aa  74.3  0.0000000000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 		 134 aa  73.9  0.0000000000006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 		 96 aa  73.9  0.0000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 		 143 aa  74.3  0.0000000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  34.38 
 
 		 98 aa  73.9  0.0000000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.11 
 
 		 124 aa  73.9  0.0000000000007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 		 101 aa  73.6  0.0000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  32.61 
 
 		 96 aa  72.8  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.11 
 
 		 94 aa  72  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000548177  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 132 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 		 131 aa  72.4  0.000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  33.33 
 
 		 94 aa  72.4  0.000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3678  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 		 128 aa  71.6  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0325198  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 124 aa  72  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.102092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>