More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_27920 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_27920  ribosomal protein S6  100 
 
 
97 aa  198  2e-50  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  6.27266e-05  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0022  ribosomal protein S6  75.26 
 
 
97 aa  155  1e-37  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  4.173e-08  normal  0.882806 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11560  SSU ribosomal protein S6P  69.07 
 
 
97 aa  145  3e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0123194  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0019  ribosomal protein S6  62.89 
 
 
97 aa  130  7e-30  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  5.15173e-05  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2656  30S ribosomal protein S6  50 
 
 
95 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  4.85291e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2978  30S ribosomal protein S6  50 
 
 
95 aa  99  2e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000894429  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3308  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 
95 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490454  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0045  ribosomal protein S6  41.05 
 
 
112 aa  89.7  1e-17  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3417  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
95 aa  87  7e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  9.05863e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2097  ribosomal protein S6  45.05 
 
 
96 aa  85.9  2e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  7.74697e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3546  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
95 aa  85.9  2e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6034  30S ribosomal protein S6  41.49 
 
 
96 aa  85.1  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.342744  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4355  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2394  30S ribosomal protein S6  38.95 
 
 
95 aa  85.1  3e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  4.6004e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0874  30S ribosomal protein S6  42.39 
 
 
96 aa  84.7  4e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23260  30S ribosomal protein S6  37.11 
 
 
101 aa  84.3  5e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5459  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.544177  normal  0.0132428 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5746  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.37623 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5370  30S ribosomal protein S6  42.55 
 
 
96 aa  84  6e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23360  ribosomal protein S6  39.36 
 
 
95 aa  83.2  1e-15  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  9.28748e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10052  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 
96 aa  82  2e-15  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00129452  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0308  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
98 aa  81.6  3e-15  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.052599 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2216  ribosomal protein S6  37.23 
 
 
94 aa  81.6  3e-15  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1219  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
96 aa  81.3  4e-15  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4740  ribosomal protein S6  37.63 
 
 
93 aa  81.3  4e-15  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4169  ribosomal protein S6  36.56 
 
 
94 aa  80.9  5e-15  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37810  SSU ribosomal protein S6P  38.3 
 
 
95 aa  80.9  6e-15  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188789  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2138  ribosomal protein S6  37.89 
 
 
95 aa  80.5  7e-15  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  4.3387e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0128  30S ribosomal protein S6  36.84 
 
 
98 aa  80.1  9e-15  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  4.43622e-08  normal  0.826671 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3561  30S ribosomal protein S6  39.36 
 
 
96 aa  79.7  1e-14  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.642829 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4014  30S ribosomal protein S6  32.63 
 
 
95 aa  80.1  1e-14  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.208118  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3095  30S ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  79.3  2e-14  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0478466  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9357  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
96 aa  79.3  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.569899 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2525  ribosomal protein S6  36.17 
 
 
95 aa  79.3  2e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.863645  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2540  ribosomal protein S6  38.14 
 
 
97 aa  79  2e-14  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  1.26793e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31780  SSU ribosomal protein S6P  36.46 
 
 
96 aa  79.3  2e-14  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4936  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
95 aa  78.2  4e-14  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  6.45168e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0483  ribosomal protein S6  36.84 
 
 
94 aa  77.8  5e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  2.93762e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4664  SSU ribosomal protein S6P  37.23 
 
 
96 aa  77.8  5e-14  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.663648  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0911  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
124 aa  77.4  6e-14  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2930  ribosomal protein S6  36.96 
 
 
95 aa  77  7e-14  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.448494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4556  30S ribosomal protein S6  38.54 
 
 
96 aa  77  8e-14  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.158034  normal  0.78601 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5174  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
124 aa  76.3  1e-13  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1400  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
124 aa  76.3  1e-13  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3700  ribosomal protein S6  34.04 
 
 
97 aa  76.3  1e-13  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0333  30S ribosomal protein S6  42.11 
 
 
128 aa  76.6  1e-13  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  9.95265e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2187  SSU ribosomal protein S6P  38.71 
 
 
95 aa  75.9  2e-13  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  6.62537e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1783  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
124 aa  75.5  2e-13  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1874  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
124 aa  75.5  2e-13  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5068  30S ribosomal protein S6  37.5 
 
 
96 aa  75.5  2e-13  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000139658 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1307  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 
122 aa  75.5  2e-13  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1811  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
124 aa  75.5  2e-13  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.844657  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6205  30S ribosomal protein S6  37.76 
 
 
124 aa  75.5  2e-13  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39390  SSU ribosomal protein S6P  34.78 
 
 
111 aa  75.9  2e-13  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.549892 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1895  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1404  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0497703  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2416  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2252  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0770355  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1182  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 
122 aa  75.1  3e-13  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0492029  normal  0.220406 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2291  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0333903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2179  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0002  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143432  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1168  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115875  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1897  30S ribosomal protein S6  37.63 
 
 
124 aa  75.1  3e-13  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0154353  hitchhiker  5.95408e-08 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5068  ribosomal protein S6  39.13 
 
 
95 aa  75.1  3e-13  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.330379  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1243  30S ribosomal protein S6  36.73 
 
 
122 aa  75.1  3e-13  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0890507  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4844  ribosomal protein S6  38.04 
 
 
96 aa  75.1  3e-13  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7312  30S ribosomal protein S6  37.36 
 
 
108 aa  74.7  4e-13  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.032442 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5584  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.72731e-16 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5662  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  2.6821e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4120  30S ribosomal protein S6  32.99 
 
 
101 aa  74.7  4e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5334  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.42081e-06  hitchhiker  6.88979e-07 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5723  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  6.11758e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1213  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 
125 aa  74.7  4e-13  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.58007  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0127  30S ribosomal protein S6  34.38 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0286248 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5171  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  7.42686e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5155  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.55569e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5327  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  2.78233e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5267  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  74.7  4e-13  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  4.06973e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1786  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 
124 aa  74.7  4e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.58345  normal  0.226907 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2456  30S ribosomal protein S6  36.56 
 
 
124 aa  74.7  4e-13  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0929827  normal  0.188014 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0315  30S ribosomal protein S6  40 
 
 
128 aa  74.7  4e-13  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  1.08359e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0653  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 
125 aa  74.3  5e-13  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1088  30S ribosomal protein S6  38.14 
 
 
125 aa  74.3  5e-13  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4181  ribosomal protein S6  36.17 
 
 
96 aa  74.3  5e-13  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5601  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  73.9  6e-13  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00075847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1640  30S ribosomal protein S6  37.89 
 
 
134 aa  73.9  6e-13  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0507943  normal  0.0355259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5625  30S ribosomal protein S6  30.21 
 
 
96 aa  73.9  6e-13  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000119733  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00746  30S ribosomal protein S6  38.3 
 
 
143 aa  74.3  6e-13  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.741883  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3355  ribosomal protein S6  34.38 
 
 
98 aa  73.9  7e-13  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0951  30S ribosomal protein S6  37.11 
 
 
124 aa  73.9  7e-13  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.77513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3891  30S ribosomal protein S6  31.96 
 
 
101 aa  73.6  9e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.202922 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4949  ribosomal protein S6  32.61 
 
 
96 aa  72.8  1e-12  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1032  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
131 aa  72.4  2e-12  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0055  ribosomal protein S6  35.11 
 
 
94 aa  72  2e-12  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  5.48177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1337  30S ribosomal protein S6  35.79 
 
 
132 aa  72.4  2e-12  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.021992  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0650  ribosomal protein S6  33.33 
 
 
94 aa  72.4  2e-12  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0145579  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1951  30S ribosomal protein S6  36.46 
 
 
125 aa  72  3e-12  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.380092  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2006  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 
124 aa  72  3e-12  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1979  30S ribosomal protein S6  34.69 
 
 
124 aa  71.6  3e-12  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.102092 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>