More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_16050 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013165  Shel_16050  aspartate semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
337 aa  691  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000391441  hitchhiker  3.05241e-07 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  70 
 
 
340 aa  483  1e-135  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.15882  hitchhiker  4.11486e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1748  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  58.21 
 
 
360 aa  411  1e-114  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.15714e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0687  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.68 
 
 
337 aa  371  1e-102  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1265  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  54.22 
 
 
336 aa  366  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1941  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.73 
 
 
340 aa  363  2e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.733379  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3660  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.78 
 
 
329 aa  361  9e-99  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.487501  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0945  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.96 
 
 
336 aa  358  6e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0350  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  53.01 
 
 
334 aa  351  1e-95  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2919  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.9 
 
 
340 aa  351  1e-95  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3606  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.9 
 
 
347 aa  350  2e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1270  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
338 aa  348  6e-95  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000102592  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0604  aspartate semialdehyde dehydrogenase  53.59 
 
 
339 aa  348  6e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  2.71293e-07  hitchhiker  0.00940362 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3166  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.65 
 
 
340 aa  348  7e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3351  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.18 
 
 
339 aa  346  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0830053 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0910  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.89 
 
 
339 aa  343  2e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  7.0881e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0972  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
338 aa  343  2e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2220  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.7 
 
 
340 aa  343  3e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.763212  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0863  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.1 
 
 
338 aa  341  9e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1047  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.4 
 
 
339 aa  341  9e-93  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00486598  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_845  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.1 
 
 
338 aa  341  1e-92  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.514485  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1903  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.79 
 
 
339 aa  339  4e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.16797e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1106  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.39 
 
 
340 aa  339  4e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0598378  normal  0.0183621 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3170  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.55 
 
 
348 aa  338  6e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28856  predicted protein  51.94 
 
 
383 aa  337  1e-91  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.606954  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4362  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.2 
 
 
351 aa  337  1e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.821515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2926  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.24 
 
 
348 aa  337  2e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1641  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  51.36 
 
 
332 aa  337  2e-91  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  4.38606e-09  normal  0.466828 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08670  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.76 
 
 
351 aa  336  4e-91  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0724448  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
350 aa  335  5e-91  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.88543 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0587  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.85 
 
 
345 aa  335  5e-91  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1168  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.4 
 
 
348 aa  335  7e-91  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  1.89528e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1757  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.61 
 
 
341 aa  333  2e-90  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.783502  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3501  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  52.41 
 
 
337 aa  331  9e-90  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.465584 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2382  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.61 
 
 
349 aa  330  2e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0254  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50 
 
 
348 aa  330  2e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2453  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
348 aa  330  2e-89  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  1.94693e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1135  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  50.15 
 
 
333 aa  330  3e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0328  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  49.7 
 
 
349 aa  328  7e-89  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.453399 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0961  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.11 
 
 
332 aa  327  1e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2060  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.81 
 
 
347 aa  327  2e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3570  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.94 
 
 
348 aa  326  3e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00136281  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1066  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.75 
 
 
335 aa  326  4e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.058115  hitchhiker  0.00506315 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2990  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
339 aa  325  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.478455  normal  0.64702 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3032  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
339 aa  325  5e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3652  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
349 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0452792  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3812  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
348 aa  324  1e-87  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.82392e-61 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3937  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
348 aa  324  1e-87  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00621767  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3542  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
349 aa  323  2e-87  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000959699  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3560  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
349 aa  323  3e-87  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0433298  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3838  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
348 aa  323  3e-87  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.747438  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
348 aa  323  3e-87  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  1.45815e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1400  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
348 aa  323  4e-87  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  2.128e-05  hitchhiker  5.26638e-21 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3899  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.65 
 
 
348 aa  323  4e-87  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00229604  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2274  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.01 
 
 
348 aa  321  1e-86  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_00711  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.41 
 
 
343 aa  320  2e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.175105 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17801  aspartate semialdehyde dehydrogenase  48.8 
 
 
343 aa  320  3e-86  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1463  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.22 
 
 
341 aa  315  6e-85  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0571  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.05 
 
 
337 aa  315  9e-85  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3482  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.29 
 
 
348 aa  315  9e-85  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.513143 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0410  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.59 
 
 
335 aa  315  9e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.133119  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1848  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.59 
 
 
354 aa  313  2e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.301002 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4365  aspartate semialdehyde dehydrogenase  50.76 
 
 
341 aa  313  3e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04100  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.63 
 
 
346 aa  312  4e-84  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.917016 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21221  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.31 
 
 
345 aa  312  5e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0067  aspartate semialdehyde dehydrogenase  49.7 
 
 
340 aa  312  5e-84  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1252  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.31 
 
 
345 aa  312  5e-84  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0064  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  48.8 
 
 
340 aa  312  6e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2173  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.73 
 
 
338 aa  311  7e-84  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00782862  normal  0.216518 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1458  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.93 
 
 
344 aa  308  8e-83  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.920891  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2160  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.11 
 
 
325 aa  307  2e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1782  aspartate-semialdehyde dehydrogenase, USG-1 related  49.25 
 
 
339 aa  306  2e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2183  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.19 
 
 
329 aa  306  2e-82  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1167  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.77 
 
 
343 aa  306  3e-82  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.371916  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1782  aspartate semialdehyde dehydrogenase  47.34 
 
 
339 aa  305  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.017997  hitchhiker  0.00498224 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0765  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.48 
 
 
343 aa  305  7e-82  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00127422  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1871  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.81 
 
 
325 aa  304  1e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2986  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.96 
 
 
332 aa  303  2e-81  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0787481  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1369  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  43.98 
 
 
332 aa  303  3e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.705444  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1042  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  47.63 
 
 
343 aa  303  3e-81  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161921  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1940  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.66 
 
 
364 aa  303  4e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0319  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.75 
 
 
343 aa  302  4e-81  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2250  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
340 aa  302  4e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18441  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.1 
 
 
343 aa  302  4e-81  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.39713  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2221  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
340 aa  303  4e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0618  aspartate semialdehyde dehydrogenase  45.82 
 
 
352 aa  302  5e-81  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1077  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.24 
 
 
352 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  7.50093e-06  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1776  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.35 
 
 
334 aa  301  1e-80  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2854  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.73 
 
 
342 aa  300  2e-80  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.923137  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18441  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.51 
 
 
343 aa  299  4e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2559  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
341 aa  299  4e-80  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.894195  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18631  aspartate semialdehyde dehydrogenase  43.11 
 
 
343 aa  299  6e-80  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0915019  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2062  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  46.88 
 
 
340 aa  297  1e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2131  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.37 
 
 
342 aa  298  1e-79  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01262  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.83 
 
 
341 aa  296  2e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1243  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.4 
 
 
342 aa  297  2e-79  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1238  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  45.76 
 
 
331 aa  297  2e-79  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00324281  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1746  aspartate semialdehyde dehydrogenase  42.81 
 
 
343 aa  297  2e-79  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0379  aspartate semialdehyde dehydrogenase  46.08 
 
 
330 aa  296  3e-79  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  5.88949e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0997  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  48.2 
 
 
328 aa  296  3e-79  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>