42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A0217 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011205  SeD_A0217  putative minor fimbrial subunit  100 
 
 		 170 aa  342  1e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000836634  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0235  putative minor fimbrial subunit  99.41 
 
 		 170 aa  341  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000106323  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0219  putative minor fimbrial subunit  98.24 
 
 		 170 aa  336  8e-92  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000129948  normal  0.612326 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0234  putative minor fimbrial subunit  97.06 
 
 		 170 aa  334  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.554532  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3091  fimbrial subunit  53.61 
 
 		 168 aa  172  1.9999999999999998e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3155  fimbrial subunit  53.01 
 
 		 168 aa  171  5e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.201472 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3272  fimbrial subunit  53.01 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0174095 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3174  fimbrial subunit  53.01 
 
 		 168 aa  170  6.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.292671 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2494  fimbrial protein  50 
 
 		 163 aa  162  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0240648  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02260  predicted fimbrial-like adhesin protein  51.7 
 
 		 168 aa  152  2e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02220  hypothetical protein  51.7 
 
 		 161 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1321  putative minor fimbrial subunit  44.44 
 
 		 170 aa  147  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2487  putative minor fimbrial subunit  47.62 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1317  putative fimbrial protein  47.62 
 
 		 169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2715  putaive minor fimbrial subunit  46.94 
 
 		 169 aa  144  6e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.627577  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2630  fimbrial protein  42.67 
 
 		 167 aa  139  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4141  fimbrial protein  38.19 
 
 		 166 aa  97.8  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.513852  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4719  MrfE protein  33.91 
 
 		 168 aa  87.4  8e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.151155  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0235  fimbrial subunit  35.8 
 
 		 158 aa  85.9  3e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.318738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3477  fimbrial protein  44.32 
 
 		 88 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.870738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4142  MrfE protein  32.08 
 
 		 170 aa  79.7  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.263878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0236  fimbrial subunit  35.8 
 
 		 158 aa  79.3  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000043634  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0220  fimbrial subunit  38.24 
 
 		 158 aa  78.2  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.00000915003  normal  0.582993 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2714  putative minor fimbrial protein  36.49 
 
 		 162 aa  77.4  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.758483  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1318  hypothetical protein  36.49 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2486  hypothetical protein  36.49 
 
 		 162 aa  76.6  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0218  fimbrial subunit  37.5 
 
 		 158 aa  75.9  0.0000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.00000705138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3273  fimbrial subunit  36.57 
 
 		 156 aa  71.6  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0246717 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4718  MrfF protein  35.88 
 
 		 163 aa  71.2  0.000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.122578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3156  fimbrial subunit  36.57 
 
 		 156 aa  71.2  0.000000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.240912 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3175  fimbrial subunit  36.57 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.366267 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3092  fimbrial subunit  36.57 
 
 		 156 aa  70.9  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2629  hypothetical protein  32.39 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4143  fimbrial protein  29.76 
 
 		 158 aa  68.9  0.00000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.281941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2493  putative minor fimbrial protein  35.62 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000704766  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02219  hypothetical protein  34.56 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.812417  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02259  predicted fimbrial-like adhesin protein  34.56 
 
 		 159 aa  68.6  0.00000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.933603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4140  MrfF protein  38.06 
 
 		 142 aa  68.2  0.00000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.358754  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3476  fimbrial subunit  34.81 
 
 		 149 aa  67  0.0000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.560689  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1322  conserved hypothetical protein  34.53 
 
 		 162 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0407  fimbrial protein  32.82 
 
 		 170 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4676  type I pilus assembly protein FimE  28.57 
 
 		 334 aa  47  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>