More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_2920 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_2920  hypothetical protein  100 
 
 		 551 aa  1152    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000907563  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_3994  protein of unknown function DUF323  37.91 
 
 		 657 aa  150  5e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2806  hypothetical protein  37.81 
 
 		 292 aa  148  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.232459  normal  0.401097 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0467  hypothetical protein  37.18 
 
 		 654 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0897  hypothetical protein  36.78 
 
 		 291 aa  137  4e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000129772  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1964  hypothetical protein  31.9 
 
 		 288 aa  137  5e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00574868  normal  0.693869 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0922  hypothetical protein  34.63 
 
 		 413 aa  137  5e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3842  hypothetical protein  35.63 
 
 		 616 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.360861 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00418  hypothetical protein  34.4 
 
 		 556 aa  135  1.9999999999999998e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.56953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25450  hypothetical protein  35.74 
 
 		 246 aa  135  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.873686  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2154  hypothetical protein  31.9 
 
 		 282 aa  134  3e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0257018  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3053  serine/threonine protein kinase  34.31 
 
 		 611 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.454143  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3987  RecF protein  33.77 
 
 		 338 aa  134  6e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.462952 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4081  hypothetical protein  31.94 
 
 		 286 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2008  hypothetical protein  33.33 
 
 		 549 aa  130  6e-29  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4215  hypothetical protein  34.53 
 
 		 301 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.579009  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33710  PvdO  33.21 
 
 		 284 aa  130  7.000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.0000619204  normal  0.0102341 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2087  hypothetical protein  33.33 
 
 		 600 aa  130  8.000000000000001e-29  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1679  hypothetical protein  34.52 
 
 		 292 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.1989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2864  hypothetical protein  32.97 
 
 		 283 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.72562  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3128  protein of unknown function DUF323  34.27 
 
 		 348 aa  128  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3855  hypothetical protein  33.92 
 
 		 348 aa  127  5e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3023  endoglucanase-like  33.19 
 
 		 869 aa  126  1e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00102959 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2718  hypothetical protein  34.3 
 
 		 292 aa  125  2e-27  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2071  hypothetical protein  32.63 
 
 		 892 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.481243 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3539  hypothetical protein  31.49 
 
 		 293 aa  120  6e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2136  hypothetical protein  30.83 
 
 		 1911 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3719  hypothetical protein  32.01 
 
 		 527 aa  119  9.999999999999999e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.680492 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2124  serine/threonine protein kinase  31.56 
 
 		 698 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4459  hypothetical protein  32.39 
 
 		 390 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669008 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4351  serine/threonine protein kinase  32.38 
 
 		 882 aa  117  6e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2098  hypothetical protein  31.41 
 
 		 586 aa  115  1.0000000000000001e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.092784 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5032  hypothetical protein  31.58 
 
 		 535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00427193 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2761  protein of unknown function DUF323  31.1 
 
 		 628 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.723769  normal  0.674463 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1851  hypothetical protein  28.77 
 
 		 303 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1300  hypothetical protein  33.89 
 
 		 491 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.865676 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1696  hypothetical protein  33.07 
 
 		 751 aa  114  5e-24  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0869805  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3529  hypothetical protein  31.05 
 
 		 929 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4304  hypothetical protein  32.3 
 
 		 862 aa  114  6e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0966898  normal  0.160271 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1894  protein of unknown function DUF323  32.38 
 
 		 523 aa  113  8.000000000000001e-24  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2006  hypothetical protein  33.47 
 
 		 522 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.6079 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2228  hypothetical protein  32.18 
 
 		 1196 aa  113  9e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2077  hypothetical protein  33.07 
 
 		 636 aa  112  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.189777  normal  0.779158 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5333  protein of unknown function DUF323  30.77 
 
 		 570 aa  110  5e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.00984541  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2069  hypothetical protein  32.16 
 
 		 281 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.425192  normal  0.19976 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2158  hypothetical protein  33.1 
 
 		 664 aa  110  5e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.653369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2415  hypothetical protein  29.96 
 
 		 603 aa  110  7.000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2604  hypothetical protein  31.56 
 
 		 497 aa  109  1e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3248  hypothetical protein  33.33 
 
 		 416 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000238215  normal  0.26381 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0556  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  32.95 
 
 		 554 aa  110  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0734765  normal  0.259485 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4550  hypothetical protein  31.88 
 
 		 287 aa  108  2e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3768  hypothetical protein  32 
 
 		 289 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2689  hypothetical protein  30.69 
 
 		 781 aa  107  4e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.36496  decreased coverage  0.00230732 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3940  hypothetical protein  29.72 
 
 		 277 aa  107  5e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1568  hypothetical protein  29.93 
 
 		 820 aa  107  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1944  protein of unknown function DUF323  31.03 
 
 		 829 aa  107  6e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.550405  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0037  hypothetical protein  33.59 
 
 		 325 aa  106  1e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2829  serine/threonine protein kinase  31.58 
 
 		 593 aa  106  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3099  protein of unknown function DUF323  34.02 
 
 		 269 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2507  protein of unknown function DUF323  32.62 
 
 		 538 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0461  serine/threonine protein kinase  31.35 
 
 		 621 aa  104  4e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.45 
 
 		 517 aa  104  5e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0460  serine/threonine protein kinase  30.92 
 
 		 620 aa  103  6e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0228  protein of unknown function DUF323  31.28 
 
 		 276 aa  103  1e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0902  hypothetical protein  29.1 
 
 		 586 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.530608  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0900  hypothetical protein  30.63 
 
 		 826 aa  103  1e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0718  protein of unknown function DUF323  33.59 
 
 		 298 aa  102  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0462  serine/threonine protein kinase  30.86 
 
 		 625 aa  102  2e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1144  hypothetical protein  31.8 
 
 		 300 aa  102  2e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.617976  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2390  protein of unknown function DUF323  31.14 
 
 		 293 aa  102  2e-20  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0264886  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0463  serine/threonine protein kinase  29.41 
 
 		 637 aa  102  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1290  protein of unknown function DUF323  30.49 
 
 		 1160 aa  99.8  1e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.286485  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2378  protein of unknown function DUF323  31.93 
 
 		 433 aa  99.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1330  protein of unknown function DUF323  31.65 
 
 		 475 aa  99  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1036  serine/threonine protein kinase  30.36 
 
 		 617 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.92194  normal  0.529135 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1731  hypothetical protein  32.38 
 
 		 877 aa  99  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0165  hypothetical protein  32.71 
 
 		 605 aa  98.2  3e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000147879  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1942  protein of unknown function DUF323  30.74 
 
 		 517 aa  98.6  3e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00637394  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5054  Serine/threonine protein kinase  29.89 
 
 		 616 aa  98.2  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.688753 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4101  protein of unknown function DUF323  30.92 
 
 		 358 aa  98.6  3e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.664344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3524  hypothetical protein  28.52 
 
 		 802 aa  97.1  7e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.316986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2998  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 		 351 aa  96.3  1e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.012467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3102  protein of unknown function DUF323  30.18 
 
 		 740 aa  95.5  2e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3565  protein of unknown function DUF323  30.13 
 
 		 925 aa  94.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.233339 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1079  protein of unknown function DUF323  32.35 
 
 		 267 aa  95.1  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000235261  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3760  serine/threonine protein kinase  31.71 
 
 		 637 aa  94.4  5e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  28.96 
 
 		 398 aa  94  7e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1490  hypothetical protein  30.1 
 
 		 742 aa  92.8  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  decreased coverage  0.00271295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1727  hypothetical protein  29.39 
 
 		 305 aa  93.2  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.172162  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2831  serine/threonine protein kinase  30.71 
 
 		 618 aa  92.8  1e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.314695 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2480  protein of unknown function DUF323  29.39 
 
 		 584 aa  92.8  2e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1572  hypothetical protein  31.62 
 
 		 267 aa  92.4  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0907  protein of unknown function DUF323  30.62 
 
 		 359 aa  92.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1268  serine/threonine protein kinase  31.54 
 
 		 509 aa  91.7  3e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6095  protein of unknown function DUF323  30.36 
 
 		 319 aa  90.9  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2895  hypothetical protein  28.28 
 
 		 409 aa  90.5  7e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1169  protein of unknown function DUF323  26.47 
 
 		 279 aa  90.5  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4035  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 639 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4072  serine/threonine protein kinase  29.07 
 
 		 639 aa  90.5  8e-17  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.228125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0247  serine/threonine protein kinase  29.6 
 
 		 623 aa  90.1  8e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.171781  decreased coverage  0.00306578 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>