More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_1180 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_1180  gamma-glutamyl kinase  100 
 
 		 370 aa  748    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.244345  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3416  gamma-glutamyl kinase  80.43 
 
 		 372 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3542  gamma-glutamyl kinase  80.43 
 
 		 372 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1037  gamma-glutamyl kinase  80.43 
 
 		 372 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00153793 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3324  gamma-glutamyl kinase  80.43 
 
 		 372 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0966  gamma-glutamyl kinase  80.76 
 
 		 369 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3416  gamma-glutamyl kinase  78.8 
 
 		 372 aa  595  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.181887 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2848  gamma-glutamyl kinase  78.53 
 
 		 374 aa  590  1e-167  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.910142  normal  0.563985 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1121  gamma-glutamyl kinase  80.43 
 
 		 372 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2976  gamma-glutamyl kinase  80.43 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0952  gamma-glutamyl kinase  80.71 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00208466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0990  gamma-glutamyl kinase  80.71 
 
 		 372 aa  590  1e-167  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.514316  normal  0.447996 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0954  gamma-glutamyl kinase  80.71 
 
 		 372 aa  589  1e-167  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.458593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3085  gamma-glutamyl kinase  77.72 
 
 		 372 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3599  gamma-glutamyl kinase  78.8 
 
 		 372 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2516  gamma-glutamyl kinase  77.38 
 
 		 379 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0370644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0977  gamma-glutamyl kinase  64.38 
 
 		 369 aa  472  1e-132  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.409722  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01162  gamma-glutamyl kinase  63.91 
 
 		 379 aa  455  1e-127  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1864  gamma-glutamyl kinase  64.31 
 
 		 377 aa  456  1e-127  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000076218  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004268  glutamate 5-kinase  64.19 
 
 		 379 aa  454  1.0000000000000001e-126  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000479337  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0967  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  432  1e-120  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00239  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3365  glutamate 5-kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0274  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.221134  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00242  hypothetical protein  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0356  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0362  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0371  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.742166  normal  0.561664 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0296  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00410823 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0239  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0353  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0269  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0363  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000626557 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3339  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0287  gamma-glutamyl kinase  59.94 
 
 		 367 aa  428  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.406641  normal  0.77952 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0768  gamma-glutamyl kinase  59.39 
 
 		 367 aa  427  1e-118  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0787621 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0935  gamma-glutamyl kinase  61.33 
 
 		 367 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0900  gamma-glutamyl kinase  60.88 
 
 		 367 aa  421  1e-116  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3284  gamma-glutamyl kinase  60.5 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3301  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000177494  hitchhiker  0.00343208 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3288  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3150  gamma-glutamyl kinase  59.67 
 
 		 367 aa  416  9.999999999999999e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.384204  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3431  gamma-glutamyl kinase  60.22 
 
 		 367 aa  412  1e-114  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00966992  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0192  gamma-glutamyl kinase  57.42 
 
 		 370 aa  398  9.999999999999999e-111  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.266887  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2953  gamma-glutamyl kinase  55.89 
 
 		 378 aa  386  1e-106  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.839271  normal  0.0806681 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0762  gamma-glutamyl kinase  52.2 
 
 		 367 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.2046 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4446  gamma-glutamyl kinase  51.22 
 
 		 393 aa  360  2e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.148731 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3206  gamma-glutamyl kinase  50.55 
 
 		 370 aa  360  2e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.316856  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1093  gamma-glutamyl kinase  48.11 
 
 		 373 aa  344  2e-93  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0668591  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1282  gamma-glutamyl kinase  47.43 
 
 		 373 aa  343  4e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.165957  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0992  gamma-glutamyl kinase  50.27 
 
 		 363 aa  343  4e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.0265732 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1065  gamma-glutamyl kinase  46.88 
 
 		 373 aa  337  2.9999999999999997e-91  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.16455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2272  gamma-glutamyl kinase  53.7 
 
 		 370 aa  333  2e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00918384 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1519  gamma-glutamyl kinase  45.21 
 
 		 372 aa  320  3.9999999999999996e-86  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2580  gamma-glutamyl kinase  45.05 
 
 		 373 aa  318  1e-85  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000904023  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0562  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 		 378 aa  310  2e-83  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2805  glutamate 5-kinase  45.21 
 
 		 373 aa  309  4e-83  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3198  gamma-glutamyl kinase  43.84 
 
 		 373 aa  307  2.0000000000000002e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000419132  unclonable  1.8251500000000002e-23 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4132  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 390 aa  304  2.0000000000000002e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000335095  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1872  gamma-glutamyl kinase  46.85 
 
 		 374 aa  303  3.0000000000000004e-81  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.51855  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0834  glutamate 5-kinase  42.74 
 
 		 371 aa  302  5.000000000000001e-81  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0755  glutamate 5-kinase  44.11 
 
 		 373 aa  302  7.000000000000001e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000228937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5205  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  301  2e-80  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.655893  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60420  gamma-glutamyl kinase  44.38 
 
 		 372 aa  300  3e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1170  glutamate 5-kinase  46.84 
 
 		 366 aa  298  1e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.197851  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1011  gamma-glutamyl kinase  44.11 
 
 		 376 aa  296  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0752585  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0267  glutamate 5-kinase  42.19 
 
 		 390 aa  295  6e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.192015  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1120  gamma-glutamyl kinase  43.01 
 
 		 374 aa  295  1e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.54768  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1608  gamma-glutamyl kinase  44.51 
 
 		 375 aa  295  1e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3473  gamma-glutamyl kinase  43.96 
 
 		 372 aa  294  2e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0908085  normal  0.284394 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0186  gamma-glutamyl kinase  44.23 
 
 		 373 aa  294  2e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.341313  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40760  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 368 aa  293  3e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01920  glutamate 5-kinase  41.89 
 
 		 387 aa  293  3e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1843  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 		 372 aa  288  1e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.505967  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3212  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 373 aa  287  2e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.226676  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1630  gamma-glutamyl kinase  43.25 
 
 		 371 aa  287  2e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2216  gamma-glutamyl kinase  41.87 
 
 		 372 aa  286  4e-76  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0240462  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2008  glutamate 5-kinase  42.19 
 
 		 376 aa  285  5.999999999999999e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.426925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3669  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  285  7e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0702726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3311  gamma-glutamyl kinase  44.14 
 
 		 373 aa  285  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000115273  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2249  gamma-glutamyl kinase  41.48 
 
 		 374 aa  284  1.0000000000000001e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0100094  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0089  glutamate 5-kinase  43.41 
 
 		 376 aa  284  2.0000000000000002e-75  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.512468  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4269  gamma-glutamyl kinase  40.81 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2520  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.231613  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1845  gamma-glutamyl kinase  41.21 
 
 		 376 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.471089  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4215  gamma-glutamyl kinase  42.19 
 
 		 379 aa  281  1e-74  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.373076  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3209  glutamate 5-kinase  42.19 
 
 		 375 aa  281  1e-74  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3521  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.204583  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0443  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0102  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.170572  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3523  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 394 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3261  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0584  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0369613  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1302  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2953  gamma-glutamyl kinase  42.74 
 
 		 373 aa  281  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3486  gamma-glutamyl kinase  43.29 
 
 		 372 aa  281  1e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920567  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3779  gamma-glutamyl kinase  45.13 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000615506  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3863  gamma-glutamyl kinase  45.13 
 
 		 373 aa  280  2e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.69297 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2819  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 374 aa  280  4e-74  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.055732  normal  0.155386 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0487  gamma-glutamyl kinase  43.56 
 
 		 372 aa  279  4e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.097418  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>