113 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0923 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0923  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00500148  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0726  hypothetical protein  77.43 
 
 		 262 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.935088  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0773  hypothetical protein  74.81 
 
 		 262 aa  401  1e-111  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3165  hypothetical protein  74.81 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0801  hypothetical protein  74.81 
 
 		 262 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0701  hypothetical protein  71.21 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3610  hypothetical protein  71.21 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0588613  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3733  hypothetical protein  71.21 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3542  hypothetical protein  71.21 
 
 		 262 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000309634 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3829  hypothetical protein  73.15 
 
 		 262 aa  392  1e-108  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0807  hypothetical protein  70.82 
 
 		 262 aa  388  1e-107  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3676  hypothetical protein  71.21 
 
 		 262 aa  377  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.113679  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3452  hypothetical protein  71.21 
 
 		 262 aa  374  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3123  hypothetical protein  67.45 
 
 		 262 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.292454  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2906  hypothetical protein  67.32 
 
 		 262 aa  353  1e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.849831 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2563  hypothetical protein  56.42 
 
 		 262 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.610667  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004200  protein SirB1  31.34 
 
 		 269 aa  130  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1610  hypothetical protein  30.14 
 
 		 281 aa  127  2.0000000000000002e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.119985  normal  0.579551 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01253  hypothetical protein  29.48 
 
 		 269 aa  127  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1753  hypothetical protein  32.2 
 
 		 270 aa  116  3.9999999999999997e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302338  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01189  predicted transcriptional regulator  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.506875  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2433  sirB1 protein  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00804318  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01199  hypothetical protein  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.498926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1319  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000562395  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1362  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00721974  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2412  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.402469  hitchhiker  0.0000254452 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1928  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0634354  normal  0.0610741 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1378  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0629002  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1695  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 269 aa  114  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0244126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1993  putative transcriptional regulator  30.41 
 
 		 269 aa  113  3e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.236117  hitchhiker  0.00468418 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2334  putative transcriptional regulator  28.33 
 
 		 269 aa  112  5e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2075  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 269 aa  112  8.000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.826481  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2404  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1904  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.275809  normal  0.448983 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1968  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.213248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1366  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0144221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1550  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 269 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.15312 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2111  putative transcriptional regulator  29.49 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.201208  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1910  putative transcriptional regulator  28.9 
 
 		 269 aa  109  5e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1858  putative transcriptional regulator  29.03 
 
 		 269 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.155221  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2063  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000599802  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2457  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.507867  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2176  putative transcriptional regulator  30.88 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.064164  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0793  protein SirB1  29.91 
 
 		 269 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.293934  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0947  hypothetical protein  27.84 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2558  hypothetical protein  26.86 
 
 		 281 aa  88.6  9e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.14895  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0533  hypothetical protein  26.64 
 
 		 283 aa  88.2  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2428  hypothetical protein  26.03 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2834  hypothetical protein  26.03 
 
 		 281 aa  85.9  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0875238  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0834  hypothetical protein  27.75 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.695011  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0745  TPR repeat-containing protein  27.75 
 
 		 281 aa  82.8  0.000000000000005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2906  hypothetical protein  27.69 
 
 		 282 aa  80.1  0.00000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.938112 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1758  hypothetical protein  27.27 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.542914  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3201  hypothetical protein  24.3 
 
 		 280 aa  79.3  0.00000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0130133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0761  hypothetical protein  24.3 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2767  hypothetical protein  25.23 
 
 		 282 aa  78.6  0.00000000000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0747  hypothetical protein  25 
 
 		 280 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.583133  normal  0.492979 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2598  hypothetical protein  24.07 
 
 		 280 aa  73.6  0.000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1078  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.107032  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0737  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0679  transcriptional regulator  24.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2514  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0922  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.425881  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0925  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.872313  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0128  hypothetical protein  24.88 
 
 		 280 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2559  hypothetical protein  23.53 
 
 		 304 aa  72.4  0.000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.026679  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2468  hypothetical protein  24.07 
 
 		 284 aa  72.4  0.000000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00867567 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2624  hypothetical protein  23.81 
 
 		 271 aa  72  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000153014  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1937  hypothetical protein  24.06 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0658551  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2549  hypothetical protein  24.06 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.934561  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2573  hypothetical protein  24.06 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.590374 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5881  hypothetical protein  24.06 
 
 		 280 aa  70.1  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.624652  normal  0.456824 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0503  hypothetical protein  24.64 
 
 		 274 aa  69.7  0.00000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.794885  normal  0.439248 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1456  transglutaminase domain protein  28 
 
 		 283 aa  67.8  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1775  hypothetical protein  25.45 
 
 		 283 aa  65.9  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1339  hypothetical protein  23.83 
 
 		 284 aa  65.5  0.0000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3549  hypothetical protein  34.94 
 
 		 273 aa  63.2  0.000000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0671  hypothetical protein  26.67 
 
 		 290 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3285  hypothetical protein  24.75 
 
 		 281 aa  62.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2183  hypothetical protein  25.65 
 
 		 281 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.502228 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1368  hypothetical protein  21.76 
 
 		 272 aa  59.7  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.880811 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02386  tetratricopeptide repeat domain protein  25.84 
 
 		 293 aa  59.3  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0820  hypothetical protein  27.17 
 
 		 268 aa  58.9  0.00000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3568  hypothetical protein  25.65 
 
 		 282 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.747718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4602  hypothetical protein  28.8 
 
 		 268 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.795214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3003  hypothetical protein  24.61 
 
 		 283 aa  57.4  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2998  hypothetical protein  25.59 
 
 		 282 aa  57.4  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.398739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3633  hypothetical protein  25.27 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2475  hypothetical protein  25.27 
 
 		 265 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3024  hypothetical protein  24.62 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1169  hypothetical protein  24.06 
 
 		 283 aa  56.2  0.0000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.617808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2425  hypothetical protein  25.12 
 
 		 282 aa  55.8  0.0000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1707  hypothetical protein  28.28 
 
 		 270 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.607161  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4478  hypothetical protein  27.17 
 
 		 268 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.242324  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4618  hypothetical protein  27.17 
 
 		 268 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2894  hypothetical protein  23.03 
 
 		 266 aa  54.7  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5388  hypothetical protein  28.97 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.666876  normal  0.357549 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2526  hypothetical protein  24.06 
 
 		 283 aa  53.5  0.000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.846479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_19860  hypothetical protein  28.28 
 
 		 270 aa  52.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0730355  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4192  hypothetical protein  24.51 
 
 		 278 aa  52.8  0.000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00269295 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>