More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0678 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007954  Sden_0678  acyltransferase 3  100 
 
 
379 aa  763  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6280  acyltransferase 3  35.99 
 
 
393 aa  220  4e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0993  acyltransferase 3  34.06 
 
 
371 aa  210  4e-53  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1419  acyltransferase 3  30.1 
 
 
377 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.601087  normal  0.841522 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2428  acyltransferase 3  30.15 
 
 
637 aa  95.9  1e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000222239  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1701  hypothetical protein  29.62 
 
 
690 aa  95.1  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.205815  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2462  acyltransferase 3  27.91 
 
 
381 aa  94  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.488787  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1654  acyltransferase 3  28.96 
 
 
380 aa  92.4  1e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.440281  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3697  acyltransferase 3  33.47 
 
 
386 aa  91.7  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.668211  normal  0.507185 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3032  acyltransferase family protein  28.69 
 
 
377 aa  90.1  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0506461  hitchhiker  0.00350534 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5009  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  29.19 
 
 
656 aa  89.7  7e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131159  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1265  putative membrane-located cell surface saccharide acetylase  29.69 
 
 
660 aa  89.7  8e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2589  acyltransferase 3  28.88 
 
 
603 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2644  acyltransferase 3  28.88 
 
 
603 aa  87  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5518  acyltransferase 3  26.1 
 
 
604 aa  86.7  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.224376  normal  0.367583 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0723  acyltransferase 3  30.71 
 
 
632 aa  86.3  7e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5872  acyltransferase 3  30.21 
 
 
435 aa  85.9  1e-15  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0997  acyltransferase family protein  30.18 
 
 
667 aa  85.1  2e-15  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.378364  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0770  acyltransferase 3  31.17 
 
 
684 aa  84.7  2e-15  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2497  acyltransferase 3  27.53 
 
 
351 aa  84.7  3e-15  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1783  acyltransferase 3  30.33 
 
 
346 aa  84.3  3e-15  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3487  acyltransferase 3  27.13 
 
 
395 aa  84  4e-15  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547681  normal  0.220575 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4559  acyltransferase 3  27.13 
 
 
395 aa  84  4e-15  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.86176 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1762  acyltransferase 3  29.52 
 
 
662 aa  83.6  5e-15  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.127648 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5455  acyltransferase 3  30.68 
 
 
665 aa  83.6  6e-15  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0257346 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2232  putative membrane-located cell surface O-antigen acetylase  31.46 
 
 
372 aa  83.2  7e-15  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.315371 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5981  putative O-antigen acetylase  29.91 
 
 
662 aa  83.2  7e-15  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0938  acyltransferase 3  28.53 
 
 
710 aa  82.8  9e-15  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0213168  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0955  acyltransferase 3  28.53 
 
 
710 aa  82.8  9e-15  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.41733  normal  0.619354 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26510  predicted acyltransferase  29.76 
 
 
681 aa  82.8  9e-15  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5132  putative acyltransferase  36.61 
 
 
638 aa  82.4  1e-14  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0874375 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1902  acyltransferase 3  34.3 
 
 
742 aa  82.8  1e-14  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.73797  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2137  hypothetical protein  34.44 
 
 
602 aa  82  1e-14  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1241  hypothetical protein  30 
 
 
675 aa  82.4  1e-14  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5910  acyltransferase 3  29.04 
 
 
399 aa  82  2e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.103949  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1967  acyltransferase 3  30.84 
 
 
368 aa  81.3  3e-14  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3871  acyltransferase 3  29.29 
 
 
690 aa  80.9  3e-14  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.127096 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1138  acyltransferase 3  33.33 
 
 
629 aa  81.3  3e-14  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.725287  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0040  acyltransferase 3  30.22 
 
 
635 aa  80.9  3e-14  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.578182  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0862  acyltransferase 3  31 
 
 
673 aa  79.7  8e-14  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.587252 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5014  acyltransferase 3  36.97 
 
 
695 aa  79.7  8e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.21213 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08830  predicted acyltransferase  36.16 
 
 
711 aa  79.7  8e-14  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.63777 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0631  acyltransferase 3  34.87 
 
 
360 aa  79.3  9e-14  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.238984  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000263  putative lipopolysaccharide modification acyltransferase  27.99 
 
 
616 aa  79.7  9e-14  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2885  acyltransferase 3  34.92 
 
 
385 aa  79.7  9e-14  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4875  acyltransferase 3  30.04 
 
 
671 aa  79  1e-13  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2002  acyltransferase 3  29.66 
 
 
382 aa  79  1e-13  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0337  acyltransferase 3  35.84 
 
 
690 aa  79  1e-13  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0070  acyltransferase 3  29.55 
 
 
392 aa  79  1e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.332625  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0821  hypothetical protein  27.06 
 
 
660 aa  79  1e-13  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4447  acyltransferase 3  32.19 
 
 
695 aa  78.6  2e-13  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0974085  normal  0.0718898 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5645  putative acyltransferase, group 3  29.38 
 
 
634 aa  78.2  2e-13  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0563  hypothetical protein  31.67 
 
 
607 aa  78.2  2e-13  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3525  acyltransferase 3  25.26 
 
 
405 aa  77.8  3e-13  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  3.5035e-05  normal  0.249979 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0992  acyltransferase 3  25.8 
 
 
604 aa  77  5e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0914113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0973  acyltransferase 3  25.8 
 
 
604 aa  77  5e-13  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5442  acyltransferase 3  27.55 
 
 
339 aa  76.6  6e-13  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26700  predicted acyltransferase  27.96 
 
 
718 aa  76.6  6e-13  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2738  acyltransferase 3  26.94 
 
 
362 aa  76.3  8e-13  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.927019 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2396  acyltransferase 3  32.8 
 
 
716 aa  76.3  8e-13  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0132066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0830  acyltransferase 3  30.79 
 
 
384 aa  76.3  8e-13  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2751  acyltransferase family protein  24.73 
 
 
640 aa  75.9  1e-12  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0222973  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1054  acyltransferase 3  26.59 
 
 
671 aa  75.5  1e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1561  acyltransferase 3  29.09 
 
 
643 aa  75.9  1e-12  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2066  acyltransferase 3  32.3 
 
 
656 aa  75.9  1e-12  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0212  acyltransferase 3  27.45 
 
 
403 aa  75.1  2e-12  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0340967 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0485  acyltransferase 3  35.88 
 
 
777 aa  75.1  2e-12  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.712131  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0545  acyltransferase  29.34 
 
 
621 aa  74.7  2e-12  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0487  acyltransferase 3  31.1 
 
 
400 aa  74.3  3e-12  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1946  acyltransferase 3  29.34 
 
 
632 aa  74.3  3e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.63132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1084  acyltransferase 3  36.77 
 
 
635 aa  74.3  3e-12  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.87667  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2845  hypothetical protein  27.35 
 
 
658 aa  74.3  3e-12  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1922  acyltransferase 3  31.75 
 
 
685 aa  74.3  3e-12  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26680  predicted acyltransferase  29.17 
 
 
679 aa  73.9  4e-12  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0302  acyltransferase 3  35.58 
 
 
660 aa  73.9  4e-12  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.183552 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0194  acyltransferase 3  34.78 
 
 
403 aa  73.9  4e-12  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2590  acyltransferase 3  27.13 
 
 
360 aa  73.9  4e-12  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0963  acyltransferase family protein  31.69 
 
 
759 aa  73.9  4e-12  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.284523  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_27650  predicted acyltransferase  34.78 
 
 
682 aa  73.6  5e-12  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5131  putative acyltransferase  38.85 
 
 
632 aa  73.6  6e-12  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0498038  normal  0.0856851 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2714  hypothetical protein  27.08 
 
 
658 aa  73.6  6e-12  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0699  acyltransferase 3  33.97 
 
 
371 aa  73.6  6e-12  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23320  predicted acyltransferase  34.38 
 
 
381 aa  73.2  7e-12  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1947  acyltransferase 3  29.57 
 
 
642 aa  72.8  8e-12  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1349  acyltransferase 3  30.03 
 
 
629 aa  72.8  9e-12  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0292256 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0475  acyltransferase 3  26.17 
 
 
713 aa  72.8  9e-12  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1233  acyltransferase 3  33.92 
 
 
656 aa  72.8  9e-12  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00523739  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0685  acyltransferase 3  32.77 
 
 
658 aa  72.8  1e-11  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5497  acyltransferase 3  32.69 
 
 
977 aa  72.4  1e-11  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.114019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4332  acyltransferase 3  32.11 
 
 
681 aa  72  1e-11  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0185386  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0761  acyltransferase 3  35.9 
 
 
690 aa  72.4  1e-11  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3864  acyltransferase 3  32.05 
 
 
354 aa  72.4  1e-11  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3181  acyltransferase 3  35.2 
 
 
378 aa  72.4  1e-11  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  6.2652e-05  decreased coverage  1.45488e-06 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4418  acyltransferase 3  32.11 
 
 
681 aa  72  1e-11  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1981  acyltransferase 3  38.22 
 
 
671 aa  72.4  1e-11  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.158164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1859  acyltransferase 3  25 
 
 
671 aa  71.6  2e-11  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.590213  normal  0.294721 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4611  acyltransferase 3  31.73 
 
 
364 aa  71.6  2e-11  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846172  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4228  acyltransferase 3  37.8 
 
 
651 aa  71.6  2e-11  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0660245  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0544  acyltransferase 3  33.14 
 
 
675 aa  72  2e-11  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4712  acyltransferase 3  32.11 
 
 
680 aa  72  2e-11  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.357932  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>