More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1992 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1992  CheW domain protein  100 
 
 		 169 aa  343  6e-94  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0971  CheW protein  46.2 
 
 		 169 aa  154  5.0000000000000005e-37  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0434  CheW protein  42.66 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.856053  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2648  CheW protein  41.5 
 
 		 163 aa  122  2e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.34231  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3653  CheW protein  38.65 
 
 		 167 aa  122  3e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1301  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.9 
 
 		 164 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.278999  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0658  CheW protein  37.65 
 
 		 169 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2984  purine-binding chemotaxis protein  33.55 
 
 		 166 aa  120  9.999999999999999e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.334831  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3216  CheW protein  37.67 
 
 		 174 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.83638 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1734  CheW protein  37.16 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1918  CheW protein  40.41 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.33362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2824  purine-binding chemotaxis protein  32.68 
 
 		 165 aa  118  3e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.176168 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2363  putative CheW protein  36.73 
 
 		 165 aa  118  3.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.699196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2099  CheW protein  36.05 
 
 		 170 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0593429  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1142  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.62 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0223438  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2246  putative CheW protein  36.05 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.537789  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2113  putative CheW protein  36.05 
 
 		 164 aa  117  6e-26  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1750  purine-binding chemotaxis protein  32.03 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1045  CheW protein  37.25 
 
 		 174 aa  117  7e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1639  purine-binding chemotaxis protein  32.03 
 
 		 165 aa  117  7e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0874  CheW protein  36.08 
 
 		 167 aa  117  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2122  purine-binding chemotaxis protein CheW  35.17 
 
 		 170 aa  116  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1849  CheW protein  34.78 
 
 		 163 aa  117  9.999999999999999e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.11346 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2166  putative CheW protein  37.65 
 
 		 205 aa  116  9.999999999999999e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.260989  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1078  CheW protein  36.13 
 
 		 160 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.603821  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1420  CheW protein  38.51 
 
 		 161 aa  117  9.999999999999999e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.701601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2092  CheW protein  35.58 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.557103 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1882  CheW protein  35.58 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.3321 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2217  CheW protein  35.58 
 
 		 170 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1299  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.62 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.125322  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3155  CheW protein  34.62 
 
 		 164 aa  115  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0809  CheW protein  37.24 
 
 		 163 aa  115  1.9999999999999998e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00050  chemotaxis signal transduction protein  36.81 
 
 		 160 aa  115  3e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.368988  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1106  CheW protein  34.62 
 
 		 164 aa  115  3.9999999999999997e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1856  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.170444  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2610  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  114  5e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.477364  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3300  putative CheW protein  33.97 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1513  purine-binding chemotaxis protein  32.68 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.095587  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1541  purine-binding chemotaxis protein  33.33 
 
 		 165 aa  114  6.9999999999999995e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.153613  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3359  CheW protein  31.25 
 
 		 171 aa  114  7.999999999999999e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.252293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22600  putative CheW protein  37.11 
 
 		 218 aa  114  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0185  CheW protein  34.13 
 
 		 183 aa  114  8.999999999999998e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2421  CheW protein  34.73 
 
 		 178 aa  114  8.999999999999998e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.726921  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1793  putative CheW protein  36.05 
 
 		 167 aa  114  8.999999999999998e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0779  CheW protein  40.27 
 
 		 165 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2991  putative CheW protein  36.77 
 
 		 169 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.5403  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3181  chemotaxis protein CheW  32.26 
 
 		 175 aa  113  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573458  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2858  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1685  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.285902  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0075  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3434  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.407346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2168  putative CheW protein  30.82 
 
 		 163 aa  112  2.0000000000000002e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3298  CheW-like protein  38.41 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3854  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.771017  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3117  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.807131  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3935  chemotaxis protein CheW  32.05 
 
 		 175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291192  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1609  CheW protein  38.36 
 
 		 157 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0166  CheW protein  31.41 
 
 		 174 aa  112  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.521886 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0112  CheW protein  37.25 
 
 		 185 aa  111  4.0000000000000004e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0239  CheW protein  30.63 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00551539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2850  CheW protein  30.63 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.369284  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0170  CheW protein  30.63 
 
 		 171 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0856369  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0257  CheW protein  30.63 
 
 		 177 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00394174  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0243  CheW protein  38.93 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0741  CheW protein  36.96 
 
 		 162 aa  111  5e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0183  CheW protein  30.63 
 
 		 171 aa  111  5e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1623  CheW protein  31.29 
 
 		 167 aa  109  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.118309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2023  CheW protein  32.21 
 
 		 164 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.656036  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2986  putative CheW protein  38.1 
 
 		 162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.344963  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0684  purine-binding chemotaxis protein CheW  34.72 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.260325  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  31.79 
 
 		 162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1407  chemotaxis protein CheW  30.57 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0899451 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3814  CheW protein  30.77 
 
 		 178 aa  108  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1201  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.958746  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1324  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  hitchhiker  2.9838600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2081  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  5.1078700000000004e-18 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2136  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  8.6841e-22 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2076  purine-binding chemotaxis protein  32.21 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.106823  hitchhiker  0.0000757321 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3106  biotin synthase  34.62 
 
 		 187 aa  108  3e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0120  CheW protein  31.17 
 
 		 178 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.949591 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  35.37 
 
 		 183 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2482  CheW protein  31.14 
 
 		 194 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.259604  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2578  CheW protein  31.14 
 
 		 194 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2476  CheW protein  37.24 
 
 		 185 aa  107  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.100144  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1079  CheW protein  30.46 
 
 		 156 aa  107  7.000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000657241 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0575  CheW protein  34.9 
 
 		 164 aa  107  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.447704  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1381  CheW protein  37.24 
 
 		 181 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.916051  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1600  CheW protein  32.7 
 
 		 171 aa  107  8.000000000000001e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.443722  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1753  CheW protein  31.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00384276  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2120  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000459496  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01847  hypothetical protein  31.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0297243  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0365  CheW protein  37.32 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.278695  decreased coverage  0.00626903 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1983  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.174065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2973  CheW protein  30.38 
 
 		 175 aa  107  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000110924 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2572  CheW protein  37.24 
 
 		 185 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1375  CheW protein  32.24 
 
 		 194 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1297  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.734506  hitchhiker  0.0000988763 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2314  CheW protein  37.41 
 
 		 165 aa  106  1e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2626  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.476506  hitchhiker  0.000000000506085 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1745  purine-binding chemotaxis protein  31.51 
 
 		 167 aa  106  1e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>