215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3359 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007912  Sde_3359  hypothetical protein  100 
 
 
291 aa  600  1.0000000000000001e-171  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.110922 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3181  FHA domain-containing protein  34.76 
 
 
302 aa  126  3e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.999719  normal  0.141986 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1775  hypothetical protein  32.7 
 
 
302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00409515  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0751  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  27.55 
 
 
863 aa  65.9  0.0000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.039806 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4227  FHA domain containing protein  34.69 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.208424  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3436  FHA domain-containing protein  33.64 
 
 
244 aa  60.8  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00012558 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1709  FHA domain-containing protein  37.14 
 
 
268 aa  60.1  0.00000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0382  hypothetical protein  38.75 
 
 
318 aa  58.5  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0186101  normal  0.489682 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0638  FHA domain-containing protein  23.14 
 
 
1559 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.449825  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4557  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  35.14 
 
 
606 aa  58.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0553  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
226 aa  57.8  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3611  FHA domain containing protein  32.93 
 
 
279 aa  57  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.331547  hitchhiker  0.0013234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3849  FHA domain containing protein  37.33 
 
 
267 aa  57  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.149542  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0092  FHA domain containing protein  38.89 
 
 
219 aa  56.2  0.0000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0424  FHA domain-containing protein  36.25 
 
 
377 aa  55.5  0.000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0026  FHA domain-containing protein  40.98 
 
 
280 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0031  Forkhead-associated protein  39.34 
 
 
433 aa  54.3  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2161  Stage II sporulation E family protein  34.69 
 
 
566 aa  54.7  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0242635  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2478  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
142 aa  54.7  0.000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0947  FHA domain-containing protein  38.36 
 
 
851 aa  54.3  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231474 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2044  FHA domain-containing protein  30.93 
 
 
405 aa  53.9  0.000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000130358  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2193  transcriptional regulator, SARP family  37.18 
 
 
385 aa  53.5  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00163999  hitchhiker  0.00133858 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1541  FHA domain-containing protein  27.93 
 
 
158 aa  53.5  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.439137  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2309  FHA domain-containing protein  38.71 
 
 
279 aa  53.5  0.000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0931454  hitchhiker  0.000599707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0223  FHA domain-containing protein  35.14 
 
 
513 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.443938 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0907  FHA domain-containing protein  39.34 
 
 
252 aa  53.1  0.000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000610253  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2992  diguanylate phosphodiesterase  33.33 
 
 
387 aa  52.8  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1054  FHA domain-containing protein  40 
 
 
134 aa  52.4  0.000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000340466  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4060  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  24.53 
 
 
890 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.344917 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1608  FHA domain-containing protein  23.08 
 
 
668 aa  52  0.00001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.861318 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0330  FHA domain-containing protein  32.98 
 
 
144 aa  51.6  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1788  FHA domain containing protein  35.62 
 
 
153 aa  52  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0678  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  40.26 
 
 
510 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0623565  normal  0.0400211 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0136  diguanylate cyclase  33.78 
 
 
288 aa  52  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.041844  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1633  FHA domain containing protein  36.99 
 
 
238 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3650  FHA domain-containing protein  33.67 
 
 
334 aa  51.2  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.143589  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0338  FHA domain-containing protein  35.06 
 
 
144 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2060  FHA domain-containing protein  30 
 
 
154 aa  51.6  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52887  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2713  forkhead-associated protein  31.76 
 
 
176 aa  50.8  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.163281  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0055  Forkhead-associated protein  32.74 
 
 
260 aa  50.4  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5478  FHA domain containing protein  33.67 
 
 
673 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.366631  normal  0.328506 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0033  FHA domain containing protein  37.7 
 
 
428 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.897494  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2047  Forkhead-associated protein  45.45 
 
 
814 aa  50.8  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.445057 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2521  FHA domain-containing protein  35.16 
 
 
946 aa  50.8  0.00003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.295094 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4686  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  26.06 
 
 
856 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5595  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  35.62 
 
 
838 aa  50.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0852343  hitchhiker  0.00394117 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0047  FHA domain-containing protein  32.18 
 
 
253 aa  50.4  0.00003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.183651 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4617  FHA domain containing protein  29.17 
 
 
387 aa  50.1  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3708  FHA domain containing protein  39.13 
 
 
313 aa  50.1  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.856573  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0042  FHA domain-containing protein  32.18 
 
 
262 aa  50.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0179739  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1780  FHA domain-containing protein  30.7 
 
 
154 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000257566  normal  0.0327167 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1886  FHA domain containing protein  29.84 
 
 
156 aa  50.4  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0328071 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0908  FHA domain-containing protein  30.95 
 
 
162 aa  49.7  0.00005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000938723  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1490  FHA domain-containing protein  32.89 
 
 
218 aa  49.7  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0088  serine/threonine kinase protein  26.62 
 
 
448 aa  49.7  0.00006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2102  FHA domain containing protein  32.43 
 
 
174 aa  49.3  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1542  FHA domain containing protein  28.43 
 
 
158 aa  49.3  0.00008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000682315 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_03330  FHA domain-containing protein  41.51 
 
 
138 aa  49.3  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0536542  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1468  FHA domain-containing protein  32.99 
 
 
181 aa  48.9  0.00009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0818364 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1077  adenylate cyclase  32.67 
 
 
513 aa  48.9  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3427  hypothetical protein  34.67 
 
 
503 aa  48.9  0.00009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.281438  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1334  FHA domain containing protein  26.92 
 
 
1488 aa  48.9  0.00009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3791  FHA domain containing protein  37.68 
 
 
315 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000134808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1434  FHA domain-containing protein  30.99 
 
 
152 aa  48.9  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0740529  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1226  FHA domain-containing protein  35.38 
 
 
177 aa  48.9  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2371  diguanylate cyclase  33.33 
 
 
294 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.171648  normal  0.191081 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0139  diguanylate cyclase  31.08 
 
 
289 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3863  FHA domain-containing protein  34.72 
 
 
503 aa  48.9  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.312796  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0895  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
122 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1693  FHA domain-containing protein  36 
 
 
167 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0514614  normal  0.923966 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3837  FHA domain-containing protein  26.58 
 
 
853 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.928431 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0150  diguanylate cyclase  31.08 
 
 
289 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2154  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  38.27 
 
 
851 aa  48.5  0.0001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.288386  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2377  adenylate/guanylate cyclase  35.37 
 
 
395 aa  48.5  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0899  FHA domain containing protein  38.46 
 
 
122 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.322319  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0897  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  26.32 
 
 
878 aa  48.5  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0849  FHA domain-containing protein  34.67 
 
 
150 aa  48.1  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0012  FHA domain containing protein  26.5 
 
 
252 aa  47.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.421198  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0878  Forkhead-associated protein  28.07 
 
 
161 aa  47.8  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0159  FHA domain containing protein  39.34 
 
 
172 aa  47.8  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2459  FHA domain containing protein  31.01 
 
 
1011 aa  47.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2063  FHA domain containing protein  37.7 
 
 
209 aa  47.4  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3060  FHA domain-containing protein  33.33 
 
 
253 aa  47.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3468  FHA domain containing protein  30.17 
 
 
544 aa  47.4  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.371082  normal  0.175493 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00420  FHA domain-containing protein  36.07 
 
 
406 aa  47.4  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.110942  normal  0.295501 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2973  FHA domain containing protein  37.14 
 
 
264 aa  47.4  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.247002 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0024  FHA domain-containing protein  40.32 
 
 
280 aa  47.4  0.0003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1735  Forkhead-associated protein  28.85 
 
 
269 aa  47.4  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.164124  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1674  protein kinase  30.25 
 
 
1167 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3935  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25.52 
 
 
899 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.410503  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4978  FHA domain-containing protein  35.09 
 
 
242 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.064902  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1632  FHA domain containing protein  33.33 
 
 
149 aa  47.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3609  FHA modulated ABC efflux pump with fused ATPase and integral membrane subunits  25 
 
 
903 aa  47.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1341  FHA domain containing protein  38.98 
 
 
374 aa  47.4  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00287423 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4997  FHA domain-containing protein  34.18 
 
 
221 aa  47.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6477  FHA domain-containing protein  32.1 
 
 
246 aa  47.4  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0374778 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0132  diguanylate cyclase  31.08 
 
 
289 aa  47  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0508624  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0025  FHA domain-containing protein  35.42 
 
 
155 aa  47  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0405  FHA domain containing protein  30.43 
 
 
490 aa  47  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3612  FHA domain containing protein  27.16 
 
 
514 aa  47  0.0004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.323456  hitchhiker  0.00187032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>