More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_1649 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009997  Sbal195_2816  exonuclease III  99.63 
 
 
270 aa  561  1e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  1.37718e-06  normal  0.625502 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2737  exonuclease III  100 
 
 
270 aa  563  1e-159  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  5.0651e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2715  exonuclease III  100 
 
 
270 aa  563  1e-159  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  2.24276e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1649  exonuclease III  100 
 
 
270 aa  563  1e-159  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  2.02985e-08  hitchhiker  6.56111e-11 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2418  exonuclease III  96.67 
 
 
270 aa  552  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.234508  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3037  exonuclease III  94.07 
 
 
270 aa  531  1e-150  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1513  exonuclease III  93.7 
 
 
270 aa  530  1e-150  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00343054  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1447  exonuclease III  94.44 
 
 
270 aa  531  1e-150  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00261577  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1503  exonuclease III  93.33 
 
 
270 aa  527  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.073629  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2262  exonuclease III  89.59 
 
 
269 aa  505  1e-142  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  5.98983e-07  normal  0.0890605 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1638  exonuclease III  87.64 
 
 
268 aa  493  1e-138  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2927  exonuclease III  85.45 
 
 
268 aa  488  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530845  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1668  exonuclease III  84.33 
 
 
268 aa  483  1e-135  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000408122  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1420  exonuclease III  85.39 
 
 
268 aa  477  1e-134  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.608481  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1465  exonuclease III  84.64 
 
 
269 aa  476  1e-133  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00148193  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01553  exonuclease III  75 
 
 
268 aa  438  1e-122  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3173  exonuclease III  74.16 
 
 
268 aa  435  1e-121  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003967  exodeoxyribonuclease III  72.76 
 
 
268 aa  427  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  1.03891e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1451  exonuclease III  71.64 
 
 
268 aa  425  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.70984e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1962  exonuclease III  68.28 
 
 
268 aa  403  1e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.134155  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2139  exodeoxyribonuclease III  74.63 
 
 
268 aa  401  1e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02430  exodeoxyribonuclease III  68.28 
 
 
269 aa  400  1e-110  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.977241  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2648  exodeoxyribonuclease III  68.66 
 
 
269 aa  395  1e-109  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1319  exodeoxyribonuclease III  67.79 
 
 
269 aa  393  1e-108  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2692  exonuclease III  67.67 
 
 
270 aa  388  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1974  exonuclease III  66.29 
 
 
272 aa  388  1e-107  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.755106  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2270  exonuclease III  67.04 
 
 
272 aa  389  1e-107  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31650  exonuclease III  66.54 
 
 
270 aa  384  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.294828 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2206  exodeoxyribonuclease III  65.54 
 
 
268 aa  385  1e-106  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2800  exonuclease III  67.29 
 
 
270 aa  386  1e-106  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.268451 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1964  exodeoxyribonuclease III  66.29 
 
 
268 aa  380  1e-105  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1695  exonuclease III  65.3 
 
 
268 aa  383  1e-105  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2890  exonuclease III  66.54 
 
 
270 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00987023  normal  0.852311 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2393  exonuclease III  66.92 
 
 
270 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.7029  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1396  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0639091 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1413  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2436  exonuclease III  66.92 
 
 
270 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.677359  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1429  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2715  exonuclease III  64.42 
 
 
268 aa  378  1e-104  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.946533  hitchhiker  0.00098113 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1873  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.991915  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2747  exodeoxyribonuclease III  65.79 
 
 
270 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0614534  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2476  exonuclease III  65.04 
 
 
270 aa  380  1e-104  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.1362  normal  0.165238 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2044  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  378  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1976  exonuclease III  64.93 
 
 
268 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  3.70761e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2340  exonuclease III  64.93 
 
 
268 aa  376  1e-103  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  5.18305e-08  normal  0.0191888 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2085  exonuclease III  64.93 
 
 
268 aa  376  1e-103  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.40103  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1883  exonuclease III  63.81 
 
 
272 aa  377  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00382686 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1972  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  376  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1833  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  376  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2892  exonuclease III  65.79 
 
 
270 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0279312  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01706  hypothetical protein  63.81 
 
 
268 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1893  exodeoxyribonuclease III  63.81 
 
 
272 aa  377  1e-103  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0788201  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01718  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  376  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1997  exonuclease III  63.81 
 
 
268 aa  376  1e-103  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.892579  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3649  exonuclease III  65.04 
 
 
270 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0606806 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2468  exonuclease III  62.69 
 
 
268 aa  372  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.906333 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1441  exonuclease III  63.06 
 
 
268 aa  374  1e-102  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.377201  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2366  exodeoxyribonuclease III  66.17 
 
 
289 aa  368  1e-101  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.762147  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28880  exonuclease III  62.78 
 
 
270 aa  361  6e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.734088  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1621  exodeoxyribonuclease III  60.59 
 
 
276 aa  356  2e-97  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.000939978  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0836  exonuclease III  59.7 
 
 
267 aa  342  4e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.337185  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1490  exodeoxyribonuclease III  57.99 
 
 
270 aa  337  1e-91  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2052  exonuclease III  60.66 
 
 
273 aa  337  1e-91  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  1.69666e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2379  exonuclease III  58.8 
 
 
276 aa  337  2e-91  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  2.88562e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1995  exonuclease III  58.15 
 
 
272 aa  335  5e-91  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.297958  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1192  exonuclease III  59.7 
 
 
274 aa  334  9e-91  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.166558  normal  0.479841 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1199  exonuclease III  58.58 
 
 
274 aa  329  3e-89  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.712214  normal  0.0221694 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1539  exonuclease III  56.77 
 
 
271 aa  322  5e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.493203  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1637  exonuclease III  54.14 
 
 
270 aa  316  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00257363  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1258  exonuclease III  55.02 
 
 
271 aa  305  5e-82  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.75406e-11  normal  0.0123433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  39.63 
 
 
255 aa  181  1e-44  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 
260 aa  176  3e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2680  exonuclease III  36.57 
 
 
264 aa  176  3e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.112967  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  36.33 
 
 
279 aa  176  5e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  38.43 
 
 
267 aa  175  7e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  35.58 
 
 
260 aa  169  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  38.64 
 
 
255 aa  168  9e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1868  exodeoxyribonuclease III  39.25 
 
 
264 aa  167  1e-40  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0445089  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  38.26 
 
 
254 aa  167  2e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  39.26 
 
 
258 aa  167  2e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  34.83 
 
 
263 aa  167  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2331  exodeoxyribonuclease III Xth  35.96 
 
 
265 aa  165  9e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.231658  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3018  exodeoxyribonuclease III Xth  37.5 
 
 
261 aa  165  9e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.176682  normal  0.802869 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  34.46 
 
 
263 aa  164  2e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  35.58 
 
 
263 aa  163  2e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3266  exodeoxyribonuclease III Xth  36.23 
 
 
263 aa  164  2e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  39.02 
 
 
264 aa  162  5e-39  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  39.02 
 
 
264 aa  162  5e-39  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  35.98 
 
 
277 aa  161  1e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  34.08 
 
 
263 aa  161  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  35.56 
 
 
257 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  35.56 
 
 
257 aa  161  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  37.31 
 
 
256 aa  160  2e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  34.96 
 
 
281 aa  160  3e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2700  exodeoxyribonuclease III Xth  35.09 
 
 
270 aa  159  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.6811 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  35.58 
 
 
263 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2921  exodeoxyribonuclease III Xth  35.85 
 
 
264 aa  158  9e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  37.5 
 
 
269 aa  157  1e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.08 
 
 
254 aa  158  1e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3045  exodeoxyribonuclease III  37.22 
 
 
265 aa  158  1e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0213415  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>