45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3404 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009800  EcHS_A3130  GspL-like protein  98.21 
 
 
392 aa  785  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3239  GspL-like protein  94.9 
 
 
392 aa  759  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.139825  normal  0.775494 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3419  GspL-like protein  98.21 
 
 
392 aa  783  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3404  GspL-like protein  100 
 
 
392 aa  796  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0727  general secretion pathway protein L  98.21 
 
 
280 aa  555  1e-157  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02779  hypothetical protein  95.56 
 
 
90 aa  176  7e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  1.63075e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0177  general secretion pathway protein L  22.95 
 
 
398 aa  124  3e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.16429  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4726  general secretion pathway protein L  26.42 
 
 
399 aa  119  7e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4350  general secretion pathway protein L  24.31 
 
 
399 aa  116  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.697858 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0152  general secretion pathway protein L  23.58 
 
 
397 aa  116  7e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2916  general secretion pathway protein L  24.52 
 
 
411 aa  116  9e-25  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0161  general secretion pathway protein L  25.69 
 
 
395 aa  114  2e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0129  general secretion pathway L  23.36 
 
 
400 aa  114  3e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4198  general secretion pathway protein L  25.69 
 
 
395 aa  113  6e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0159  general secretion pathway protein L  25.14 
 
 
395 aa  113  7e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0164  general secretion pathway protein L  25.14 
 
 
395 aa  112  8e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0159  general secretion pathway protein L  25.14 
 
 
395 aa  112  8e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0174  general secretion pathway protein L  24.59 
 
 
395 aa  112  8e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3559  general secretion pathway protein L  25.97 
 
 
395 aa  112  1e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001884  general secretion pathway protein L  25.44 
 
 
400 aa  110  3e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0113  general secretion pathway protein L  22.93 
 
 
401 aa  111  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00609  general secretion pathway protein L  24.63 
 
 
381 aa  110  6e-23  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3611  general secretion pathway protein L  23.69 
 
 
396 aa  102  1e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0105  general secretion pathway protein L  24.55 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.810626  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0162  general secretion pathway protein L  24.11 
 
 
396 aa  93.2  8e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1307  general secretion pathway protein L  24.93 
 
 
400 aa  93.2  8e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0157  general secretion pathway protein L  23.84 
 
 
396 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2852  general secretion pathway protein L  22.45 
 
 
425 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1420  general secretion pathway protein L  22.38 
 
 
425 aa  91.7  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2298  general secretion pathway protein L  25 
 
 
403 aa  89  1e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03964  general secretion pathway protein L  24.86 
 
 
399 aa  85.9  1e-15  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1478  general secretion pathway protein L  23.68 
 
 
400 aa  85.1  2e-15  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.344143  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4583  general secretion pathway protein L  23.02 
 
 
450 aa  77.8  3e-13  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.760414  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2385  general secretion pathway protein L  26.93 
 
 
424 aa  72.8  9e-12  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.43221e-06 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0011  general secretion pathway protein L  22.04 
 
 
379 aa  69.7  7e-11  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.535604 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0239  general secretion pathway protein L  21.6 
 
 
397 aa  64.7  2e-09  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.824428  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2037  general secretion pathway protein L  25.65 
 
 
382 aa  60.8  4e-08  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24080  general secretion pathway protein L  25.36 
 
 
382 aa  59.3  1e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00737017  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0258  general secretion pathway L  22.64 
 
 
369 aa  53.5  7e-06  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.603796  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0236  general secretion pathway protein L  23.94 
 
 
412 aa  48.9  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0960  general secretion pathway protein L  24.22 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1012  general secretion pathway protein L  22.83 
 
 
396 aa  46.6  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3572  chitinase II  18.3 
 
 
411 aa  45.8  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.682274 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2918  general secretion pathway protein L  25.66 
 
 
379 aa  45.4  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.81605  normal  0.120008 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0380  general secretion pathway protein L  19.9 
 
 
387 aa  42.7  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>