129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_A0034 on replicon NC_010660
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010660  SbBS512_A0034  transposase  100 
 
 		 111 aa  226  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1759  IS66 family orf1  98.2 
 
 		 154 aa  224  3e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0153795  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0065  IS66 family orf1  98.2 
 
 		 225 aa  224  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.22402  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0003  IS66 family orf1  98.2 
 
 		 225 aa  224  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.930174  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0045  IS66 family orf1  98.2 
 
 		 225 aa  224  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.88778  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3366  IS66 family orf1  98.2 
 
 		 225 aa  224  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.451568  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4881  IS66 family orf1  98.2 
 
 		 225 aa  224  4e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3124  IS66 family transposase orfA  98.2 
 
 		 225 aa  224  4e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4274  ISSfl4 ORF1  42.74 
 
 		 224 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0021  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0040  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0070  IS66 family element  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0817  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.442103  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1405  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1762  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0423531  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2931  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3345  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3386  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4862  IS66 family orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0226  IS66 family element, orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0195  IS66 family element, orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0116  IS66 family element, orf1  42.45 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.837926  normal  0.82716 
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0144  IS66 family element, orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.642742  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0072  IS66 family element, orf1  42.45 
 
 		 129 aa  81.6  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000202563  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0019  hypothetical protein  42.45 
 
 		 133 aa  81.3  0.000000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3137  IS66 family transposase orfA  37.29 
 
 		 141 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2121  IS66 family orf1  36.44 
 
 		 141 aa  66.6  0.0000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.715021  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3776  putative transposase  36.19 
 
 		 131 aa  63.5  0.0000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.981228 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1337  transposase OrfA, ISEc8  41.23 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1391  IS66 family element, orf1  36.44 
 
 		 120 aa  62  0.000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.144161 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0025  transposase family  37.84 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000603896  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0063  IS66 family element, orf1  37.84 
 
 		 139 aa  61.6  0.000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.854269  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0663  transposase IS3/IS911 family protein  36.19 
 
 		 128 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.667805  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0472  putative transposase IS3/IS911  35 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0276  transposase IS3/IS911 family protein  35.06 
 
 		 126 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4596  transposase IS3/IS911 family protein  36.92 
 
 		 146 aa  49.7  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.699862 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0077  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0268541  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1101  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0229521  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1441  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1445  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0109828  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1452  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1931  transposase  45.95 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.575693  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2690  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2737  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0586218  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2889  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3089  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000589591  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3142  hypothetical protein  29.52 
 
 		 135 aa  49.3  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5563  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.121852 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4855  transposase IS3/IS911  45.95 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3311  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6834  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5054  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.880446  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5095  transposase IS3/IS911 family protein  45.95 
 
 		 133 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5537  transposase IS3/IS911  30.19 
 
 		 131 aa  48.5  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4974  transposase IS3/IS911  39.62 
 
 		 138 aa  48.1  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000160707  normal  0.614281 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2589  putative IS3 transposase, TnpA  31.68 
 
 		 142 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.789608  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0257  putative transposase  46.51 
 
 		 145 aa  47.8  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0626977 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1057  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.905137  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1090  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1364  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.059427 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1480  transposase IS3/IS911 family protein  35.94 
 
 		 135 aa  47.8  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10456 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2606  transposase IS3/IS911 family protein  39.22 
 
 		 133 aa  47.4  0.00006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.22197 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1992  transposase IS3/IS911  43.24 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.135346 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2557  transposase IS3/IS911  43.24 
 
 		 133 aa  46.2  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.221495 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2813  transposase  30.91 
 
 		 131 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6443  transposase IS3/IS911 family protein  48.65 
 
 		 133 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000000408557 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4721  transposase  43.24 
 
 		 122 aa  45.4  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0095  transposase  45.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0367  transposase  45.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1454  transposase  45.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1537  transposase  45.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2585  transposase  45.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.238572  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2745  transposase  45.95 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1178  putative DNA-binding protein  30.7 
 
 		 131 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.693647  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5080  transposase IS3/IS911 family protein  32.61 
 
 		 129 aa  44.7  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3339  transposase IS3/IS911 family protein  32.69 
 
 		 170 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6859  transposase IS3/IS911 family protein  29.81 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.643706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1112  transposase IS3/IS911 family protein  35.19 
 
 		 149 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.856791  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3966  ISPpu14, transposase Orf1  36.36 
 
 		 106 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0732889 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4447  transposase IS3/IS911 family protein  38.46 
 
 		 130 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.151096  normal  0.0837239 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0108  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0157365  hitchhiker  0.00244119 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0401  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1086  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.612076  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1207  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.4197  normal  0.231836 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1670  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.724698 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1887  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 136 aa  43.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00245938 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6523  transposase IS3/IS911 family protein  27.18 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0816552  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0656  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0829  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1660  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.391271  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2242  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.89134  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3246  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3726  transposase IS3/IS911 family protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0566  ISRSO10-transposase ORFA protein  40.54 
 
 		 122 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2197  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000281528  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0075  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009788  EcE24377A_D0033  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0006  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009790  EcE24377A_E0041  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.64652  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0395  insertion sequence 2 OrfA protein  43.24 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.867286  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>