42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1976 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1976  CRISPR-associated Cse3 family protein  100 
 
 		 206 aa  413  9.999999999999999e-116  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0708342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0945  CRISPR-associated protein, Cse3 family  44.44 
 
 		 214 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.417479  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1588  CRISPR-associated Cse3 family protein  40 
 
 		 232 aa  147  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0734757  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17180  CRISPR-associated protein, Cse3 family  39.8 
 
 		 207 aa  133  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.784887  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2652  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.7 
 
 		 230 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4089  CRISPR-associated protein, Cse3 family  33.17 
 
 		 206 aa  101  8e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.208178  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1900  CRISPR-associated protein, Cse3 family  30.13 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2443  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.6 
 
 		 219 aa  98.6  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.880295 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0646  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.93 
 
 		 238 aa  88.2  9e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.503781  normal  0.334707 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0764  CRISPR system CASCADE complex protein CasE  26.94 
 
 		 215 aa  79  0.00000000000004  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0680361 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2684  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.26 
 
 		 229 aa  67  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000634043  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13920  CRISPR-associated protein, Cse3 family  34.19 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.475319 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1285  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.12 
 
 		 239 aa  65.5  0.0000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17220  CRISPR-associated protein, CT1974  31.31 
 
 		 205 aa  64.3  0.000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2829  CRISPR-associated Cse3 family protein  30.23 
 
 		 202 aa  63.5  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1596  CRISPR-associated Cse3 family protein  26.67 
 
 		 207 aa  63.2  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00642378  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3756  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.85 
 
 		 204 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.353675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3905  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.05 
 
 		 236 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.154401  normal  0.123474 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17310  CRISPR-associated protein, Cse3 family  27.87 
 
 		 241 aa  58.9  0.00000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2673  CRISPR-associated protein, Cse3 family  28.71 
 
 		 215 aa  58.5  0.00000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0925  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.93 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2577  CRISPR-associated Cse3 family protein  27.03 
 
 		 227 aa  56.6  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0617652 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2634  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.57 
 
 		 211 aa  55.5  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.38182  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0984  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.79 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1531  Cse3 family CRISPR-associated protein  26.2 
 
 		 230 aa  53.9  0.000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.010314  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0909  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.73 
 
 		 215 aa  53.1  0.000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.752623  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3050  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.51 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000131653  hitchhiker  0.000844358 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1235  CRISPR-associated protein, Cse3 family  24.53 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00100035  normal  0.670253 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0956  CRISPR-associated Cse3 family protein  29.29 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2895  CRISPR-associated Cse3 family protein  28.79 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.698854  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0932  CRISPR-associated protein, Cse3 family  29.29 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2338  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.78 
 
 		 224 aa  49.3  0.00004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0402  CRISPR-associated protein, Cse3 family  25.44 
 
 		 215 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0280403  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1587  transcriptional regulator, Fis family protein  24.47 
 
 		 180 aa  46.6  0.0002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.551291  normal  0.450631 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1416  CRISPR-associated protein, Cse3 family  26.26 
 
 		 208 aa  46.6  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.116754 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0598  CRISPR-associated Cse3 family protein  22.17 
 
 		 224 aa  46.6  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  decreased coverage  0.000000000000163206  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2161  CRISPR-associated protein, Cse3 family  23.47 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169878  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3014  Cse3 family CRISPR-associated protein  26.64 
 
 		 210 aa  45.8  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00083763  normal  0.0405409 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0829  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.58 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0022  hypothetical protein  45.95 
 
 		 275 aa  43.9  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.724418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3058  CRISPR-associated Cse3 family protein  24.29 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3067  crispr-associated protein, Cse3 family  22.17 
 
 		 216 aa  41.6  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>