More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_0033 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003909  BCE_2553  carboxyl transferase domain-containing protein  62.18 
 
 
513 aa  654    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2375  carboxyl transferase domain-containing protein  62.18 
 
 
513 aa  653    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2332  propionyl-CoA carboxylase  62.18 
 
 
513 aa  654    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2291  propionyl-CoA carboxylase  62.18 
 
 
513 aa  653    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0918842  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2360  propionyl-CoA carboxylase  62.06 
 
 
513 aa  659    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.306025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2445  Methylcrotonoyl-CoA carboxylase  63.83 
 
 
517 aa  660    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2516  carboxyl transferase domain protein  61.86 
 
 
513 aa  655    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0027  propionyl-CoA carboxylase  96.08 
 
 
510 aa  995    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2552  carboxyl transferase domain-containing protein  62.18 
 
 
513 aa  653    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.953071  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1836  Propionyl-CoA carboxylase  62.52 
 
 
520 aa  659    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.101625  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2565  carboxyl transferase domain protein  61.9 
 
 
513 aa  652    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.89145e-17 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2186  Propionyl-CoA carboxylase  79.77 
 
 
523 aa  827    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1807  propionyl-CoA carboxylase  62.06 
 
 
513 aa  659    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.171719  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2052  Propionyl-CoA carboxylase  65.02 
 
 
518 aa  659    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00336851  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1346  Propionyl-CoA carboxylase  67.01 
 
 
508 aa  656    Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0403  propionyl-CoA carboxylase  75.05 
 
 
510 aa  748    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2807  carboxyl transferase domain protein  61.86 
 
 
513 aa  655    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000977821 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2608  carboxyl transferase domain protein  62.18 
 
 
513 aa  654    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.444131  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0033  propionyl-CoA carboxylase  100 
 
 
510 aa  1033    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6415  Propionyl-CoA carboxylase  81.64 
 
 
506 aa  827    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2164  propionyl-CoA carboxylase  64.03 
 
 
522 aa  632  1e-180  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.207678  normal  0.196324 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2300  Sigma 54 interacting domain protein  63.89 
 
 
513 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.535149  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2212  Propionyl-CoA carboxylase  63.69 
 
 
513 aa  626  1e-178  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  unclonable  0.000980367  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1646  propionyl-CoA carboxylase  63.49 
 
 
524 aa  623  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08220  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  60.31 
 
 
537 aa  620  1e-176  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.394862 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0008  Propionyl-CoA carboxylase  43.9 
 
 
607 aa  430  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2122  Propionyl-CoA carboxylase  44.64 
 
 
625 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.893863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2913  Propionyl-CoA carboxylase  44.88 
 
 
586 aa  427  1e-118  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.615692  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2454  carboxyl transferase  43.24 
 
 
612 aa  417  9.999999999999999e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1363  carboxyl transferase  41.33 
 
 
508 aa  400  9.999999999999999e-111  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00300636  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1593  Propionyl-CoA carboxylase  43.85 
 
 
525 aa  397  1e-109  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4102  carboxyl transferase  42.32 
 
 
516 aa  377  1e-103  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.09097  normal  0.079173 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2536  carboxyl transferase  40.39 
 
 
531 aa  374  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.449472 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2555  propionyl-CoA carboxylase complex B subunit  40 
 
 
534 aa  366  1e-100  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117382  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08340  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  41.19 
 
 
537 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0195606  normal  0.225361 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1156  carboxyl transferase  40.35 
 
 
517 aa  366  1e-100  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000234749  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3291  carboxyl transferase  42.54 
 
 
516 aa  366  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0262589  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1489  carboxyl transferase  37.48 
 
 
518 aa  365  2e-99  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.810044  normal  0.0441726 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0797  carboxyl transferase  38.95 
 
 
516 aa  364  2e-99  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000527493  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2466  carboxyl transferase  41.05 
 
 
550 aa  364  2e-99  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0850  carboxyl transferase  39.81 
 
 
526 aa  364  2e-99  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  0.000103034  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2573  carboxyl transferase  38.79 
 
 
516 aa  363  3e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.455501 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0802  carboxyl transferase  41.98 
 
 
527 aa  363  3e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000659561 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0856  carboxyl transferase  41.39 
 
 
527 aa  361  2e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0690985  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1431  propionyl-CoA carboxylase beta chain  38.9 
 
 
513 aa  361  2e-98  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1021  carboxyl transferase  40.41 
 
 
531 aa  360  4e-98  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.698781  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4130  carboxyl transferase  40.81 
 
 
530 aa  360  4e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0379  carboxyl transferase  40.08 
 
 
514 aa  358  9e-98  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.887348 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0944  propionyl-CoA carboxylase  40.04 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0699  carboxyl transferase  38.09 
 
 
516 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0700  carboxyl transferase  39.96 
 
 
531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.810443 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0214  carboxyl transferase  38.49 
 
 
515 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0212  carboxyl transferase  38.45 
 
 
515 aa  355  1e-96  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3941  carboxyl transferase  39.73 
 
 
536 aa  354  2.9999999999999997e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0385716  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1735  carboxyl transferase  37.74 
 
 
516 aa  353  2.9999999999999997e-96  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1317  carboxyl transferase  38.21 
 
 
512 aa  353  2.9999999999999997e-96  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0231  carboxyl transferase  40.51 
 
 
518 aa  353  2.9999999999999997e-96  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.810852  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1041  carboxyl transferase  40.87 
 
 
542 aa  354  2.9999999999999997e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3495  carboxyl transferase  40.54 
 
 
540 aa  353  4e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2281  carboxyl transferase  38.54 
 
 
531 aa  353  5.9999999999999994e-96  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0966059  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2284  carboxyl transferase  39.45 
 
 
522 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00152526  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6732  carboxyl transferase  38.92 
 
 
520 aa  351  2e-95  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0291  carboxyl transferase  38 
 
 
519 aa  351  2e-95  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5914  carboxyl transferase  39.58 
 
 
551 aa  351  2e-95  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.744099  normal  0.878673 
 
 
-
 
NC_002950  PG1612  methylmalonyl-CoA decarboxylase, alpha subunit  38.18 
 
 
517 aa  350  4e-95  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0700  carboxyl transferase  40.08 
 
 
529 aa  349  6e-95  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1320  carboxyl transferase  40.77 
 
 
530 aa  349  8e-95  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00164381  normal  0.627316 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3695  carboxyl transferase  39.49 
 
 
538 aa  348  1e-94  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0411544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2513  carboxyl transferase  38.25 
 
 
510 aa  348  1e-94  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.152871  normal  0.332227 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0947  carboxyl transferase  37.92 
 
 
513 aa  347  2e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.592853  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1325  carboxyl transferase  40.52 
 
 
527 aa  347  2e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000015031 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6937  propionyl-CoA carboxylase beta subunit  41.3 
 
 
559 aa  348  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.100753  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3484  carboxyl transferase  38.42 
 
 
510 aa  347  2e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21120  acetyl-CoA carboxylase, carboxyltransferase component (subunits alpha and beta)  38.93 
 
 
529 aa  348  2e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0918457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0950  carboxyl transferase  39.69 
 
 
514 aa  348  2e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.216274 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1759  carboxyl transferase  37.21 
 
 
514 aa  347  3e-94  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2999  carboxyl transferase  38.46 
 
 
510 aa  347  4e-94  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1738  carboxyl transferase  36.5 
 
 
516 aa  346  4e-94  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2361  carboxyl transferase  38.19 
 
 
513 aa  346  6e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000738755  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4364  carboxyl transferase  39.27 
 
 
541 aa  344  2e-93  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0792  carboxyl transferase  40.4 
 
 
524 aa  344  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.224802  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0268  carboxyl transferase  37.98 
 
 
523 aa  343  2.9999999999999997e-93  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0077  carboxyl transferase  37.04 
 
 
517 aa  343  2.9999999999999997e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.371983  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0201  carboxyl transferase  37.05 
 
 
521 aa  343  2.9999999999999997e-93  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0217258  normal  0.713971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0821  carboxyl transferase  39.27 
 
 
536 aa  343  2.9999999999999997e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.588825  normal  0.102269 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1677  carboxyl transferase  39.77 
 
 
542 aa  343  4e-93  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0051  carboxyl transferase  39.5 
 
 
517 aa  343  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.253581  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1330  carboxyl transferase  39.44 
 
 
556 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3025  carboxyl transferase  38.72 
 
 
532 aa  343  5e-93  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.432014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0489  carboxyl transferase  38.48 
 
 
520 aa  343  5e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1294  carboxyl transferase  39.44 
 
 
556 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2003  carboxyl transferase  38.06 
 
 
510 aa  343  5e-93  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1311  carboxyl transferase  39.44 
 
 
556 aa  343  5e-93  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0791098  normal  0.306854 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4239  carboxyl transferase  37.86 
 
 
510 aa  343  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.540833  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3374  carboxyl transferase  39.24 
 
 
510 aa  343  5.999999999999999e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.778087  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2042  carboxyl transferase  37.31 
 
 
510 aa  343  5.999999999999999e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0884189  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0260  carboxyl transferase  39.38 
 
 
519 aa  342  9e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1223  carboxyl transferase  37.24 
 
 
517 aa  342  9e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00883657  normal  0.269344 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0912  carboxyl transferase  37.67 
 
 
510 aa  342  1e-92  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1817  Methylmalonyl-CoA carboxytransferase  37.86 
 
 
517 aa  342  1e-92  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>