More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_0037 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_0037  ArsR family transcriptional regulator  100 
 
 
102 aa  207  4e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.139091 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0029  ArsR family transcriptional regulator  88.24 
 
 
102 aa  185  2e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  4.81298e-05  hitchhiker  7.45632e-07 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0026  ArsR family transcriptional regulator  87.25 
 
 
102 aa  184  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0021  ArsR family transcriptional regulator  87.25 
 
 
102 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  3.64753e-06  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0023  ArsR family transcriptional regulator  87.25 
 
 
102 aa  184  5e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  1.24872e-09  hitchhiker  0.000733869 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0025  transcriptional regulator, ArsR family  87.25 
 
 
102 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.111257  hitchhiker  1.53005e-06 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0026  regulatory protein, ArsR  87.25 
 
 
102 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000871967  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0025  ArsR family transcriptional regulator  87.25 
 
 
102 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00398711  normal  0.0110166 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0021  regulatory protein ArsR  87.25 
 
 
102 aa  182  1e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00282375  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0018  regulatory protein, ArsR  87.13 
 
 
102 aa  182  2e-45  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.413678  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0028  regulatory protein, ArsR  86.14 
 
 
102 aa  177  3e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  1.36281e-05  normal  0.0492639 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0026  ArsR family transcriptional regulator  84.16 
 
 
101 aa  177  5e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.849172  normal  0.018094 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0025  ArsR family transcriptional regulator  83.17 
 
 
101 aa  175  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0024  ArsR family transcriptional regulator  85 
 
 
101 aa  174  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  5.55304e-09  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0020  regulatory protein, ArsR  82.18 
 
 
101 aa  174  5e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0018  transcriptional regulator, ArsR family protein  79.21 
 
 
101 aa  169  1e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.591177  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2367  regulatory protein ArsR  54.95 
 
 
97 aa  105  2e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.74667  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1236  ArsR family transcriptional regulator  46.94 
 
 
101 aa  103  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.118736  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0576  transcriptional activator HlyU  52.58 
 
 
103 aa  99.8  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000103894  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2615  ArsR family transcriptional regulator  47.42 
 
 
119 aa  97.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.237547  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00976  hypothetical protein  53.06 
 
 
101 aa  96.7  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1287  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  1.65957e-07  normal  0.329148 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000101  transcriptional regulator ArsR family  49.48 
 
 
102 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.344497  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1095  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
98 aa  94.4  4e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  6.20503e-09  normal  0.070685 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0210  transcriptional activator HlyU  58.75 
 
 
85 aa  94.7  4e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  9.76206e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1190  ArsR family transcriptional regulator  51.55 
 
 
98 aa  94.4  5e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00010661  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1079  ArsR family transcriptional regulator  52.58 
 
 
104 aa  94  7e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  7.95282e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2292  ArsR family transcriptional regulator  52.13 
 
 
99 aa  92.8  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.863307  hitchhiker  1.72581e-07 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004423  transcriptional activator HlyU  50.52 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  1.88739e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4153  transcriptional regulator, ArsR family  43.88 
 
 
119 aa  92  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161785  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0920  transcriptional regulator HlyU  51.55 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  3.31953e-10  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1151  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  3.55977e-06  normal  0.185077 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1117  regulatory protein ArsR  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  3.62609e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1050  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  2.42354e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3239  transcriptional regulator, ArsR family  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00078895  normal  0.52452 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3141  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  1.77762e-05  normal  0.988511 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2961  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  3.18119e-07  normal  0.703465 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3043  ArsR family transcriptional regulator  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  1.76438e-06  normal  0.676383 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1055  regulatory protein, ArsR  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.584265  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3538  transcriptional regulator HlyU  50.52 
 
 
98 aa  90.5  6e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2894  transcriptional regulator, ArsR family protein  50.52 
 
 
98 aa  90.5  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0578791  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1306  ArsR family transcriptional regulator  40.2 
 
 
109 aa  90.1  9e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.680406  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1937  ArsR family transcriptional regulator  51.04 
 
 
107 aa  90.1  9e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0586  ArsR family transcriptional regulator  43.3 
 
 
105 aa  89.4  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1589  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
115 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.000194684  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1532  ArsR family transcriptional regulator  52.17 
 
 
115 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0961  regulatory protein, ArsR  39.8 
 
 
135 aa  88.2  3e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6792  ArsR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
108 aa  87.4  6e-17  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.439051  normal  0.0283932 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2727  regulatory protein, ArsR  48.45 
 
 
98 aa  87.4  6e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  3.69896e-11  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1580  regulatory protein ArsR  50 
 
 
115 aa  87  7e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.0014541  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01281  transcriptional regulator, ArsR family protein  48.15 
 
 
87 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  4.57227e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2476  ArsR family transcriptional regulator  37.37 
 
 
110 aa  85.5  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1050  ArsR family transcriptional regulator  40.82 
 
 
141 aa  84.7  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4201  regulatory protein, ArsR  43.01 
 
 
106 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.541615  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3721  ArsR family transcriptional regulator  41.94 
 
 
104 aa  82.8  1e-15  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0645821  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3631  transcriptional regulator of ArsR family protein  47.73 
 
 
103 aa  82.8  1e-15  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0363  regulatory protein, ArsR  39.6 
 
 
111 aa  82.8  1e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  hitchhiker  6.21973e-05 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2370  ArsR family transcriptional regulator  46.07 
 
 
103 aa  82.4  2e-15  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  1.92814e-05  hitchhiker  1.68087e-05 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3223  ArsR family transcriptional regulator  41 
 
 
123 aa  82.8  2e-15  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.675106  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3285  transcriptional regulator ArsR family  43.75 
 
 
105 aa  82.4  2e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0333  ArsR family transcriptional regulator  38 
 
 
104 aa  82.4  2e-15  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3099  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
99 aa  81.3  4e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.22781  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1206  ArsR family transcriptional regulator  45.26 
 
 
115 aa  81.3  4e-15  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233915  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2994  regulatory protein ArsR  43.75 
 
 
99 aa  81.3  4e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.566931  normal  0.0250812 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4302  ArsR family transcriptional regulator  41.76 
 
 
106 aa  81.6  4e-15  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.372535 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05708  hypothetical protein  40.86 
 
 
97 aa  81.3  4e-15  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2105  ArsR family transcriptional regulator  51.32 
 
 
100 aa  80.9  5e-15  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02487  hypothetical protein  47.19 
 
 
99 aa  80.9  6e-15  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0240  ArsR family transcriptional regulator  44.44 
 
 
110 aa  80.9  6e-15  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02523  predicted DNA-binding transcriptional regulator  47.19 
 
 
99 aa  80.9  6e-15  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1016  transcriptional regulator, ArsR family  47.19 
 
 
99 aa  80.9  6e-15  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1211  transcriptional regulator, ArsR family  39.18 
 
 
113 aa  80.9  6e-15  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2802  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
99 aa  80.9  6e-15  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2947  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
99 aa  80.9  6e-15  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1039  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
99 aa  80.9  6e-15  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8029  transcriptional regulator ArsR family  50.59 
 
 
106 aa  80.5  7e-15  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2910  regulatory protein, ArsR  42.71 
 
 
99 aa  80.5  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2977  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 
99 aa  80.5  8e-15  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.623995  normal  0.100497 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4701  regulatory protein, ArsR  32.65 
 
 
106 aa  80.1  9e-15  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.593544  normal  0.304994 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2942  regulatory protein ArsR  42.71 
 
 
99 aa  79.7  1e-14  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.130788 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0793  regulatory protein, ArsR  36.63 
 
 
105 aa  79.7  1e-14  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1544  transcriptional regulator, ArsR family  42.53 
 
 
109 aa  79.7  1e-14  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.411749  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1189  transcriptional regulator, ArsR family  41.24 
 
 
142 aa  79.7  1e-14  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0132  transcriptional regulator, TrmB  47.19 
 
 
107 aa  80.1  1e-14  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.500146  normal  0.0196192 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3741  transcriptional regulator, ArsR family  48.98 
 
 
103 aa  80.1  1e-14  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2309  regulatory protein ArsR  49.43 
 
 
114 aa  79.7  1e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.374797 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2787  ArsR family transcriptional regulator  47.19 
 
 
99 aa  79.7  1e-14  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.255483 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2827  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 
105 aa  79  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.313122  normal  0.191386 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2002  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
100 aa  79  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3096  transcriptional regulator, ArsR family  50.6 
 
 
105 aa  79  2e-14  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.556468  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  40.45 
 
 
111 aa  79  2e-14  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3214  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 
99 aa  78.6  2e-14  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2369  transcriptional regulator, ArsR family  41.11 
 
 
100 aa  79  2e-14  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  unclonable  0.000230878  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2316  transcriptional regulator, TrmB  46.07 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.66279  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3909  transcriptional regulator, ArsR family  46.07 
 
 
99 aa  78.6  3e-14  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.305368 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1609  regulatory protein ArsR  39.77 
 
 
110 aa  78.6  3e-14  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.020188  normal  0.119159 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48910  ArsR family regulatory protein  39.18 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.316349  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1410  transcriptional regulator, ArsR family  34.69 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2435  ArsR family transcriptional regulator  34.69 
 
 
107 aa  78.6  3e-14  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.285599  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1619  regulatory protein ArsR  42.27 
 
 
103 aa  78.2  4e-14  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  5.54955e-08  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>