More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0021 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0276  Mg chelatase-related protein  80.64 
 
 		 502 aa  764    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0021  Mg chelatase-related protein  100 
 
 		 502 aa  980    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.253404  normal  0.0270376 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3612  Mg chelatase, subunit ChlI  84.2 
 
 		 502 aa  811    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.623512  normal  0.505683 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0118  Mg chelatase-related protein  64.74 
 
 		 512 aa  611  9.999999999999999e-175  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0764948 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0317  Mg chelatase-related protein  64.94 
 
 		 512 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0320  Mg chelatase, subunit ChlI  65.74 
 
 		 512 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.620332  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0405  Mg chelatase-related protein  64.94 
 
 		 512 aa  596  1e-169  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0664  Mg chelatase, subunit ChlI  62.52 
 
 		 512 aa  593  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.507934 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3594  Mg chelatase, subunit ChlI  64.55 
 
 		 516 aa  591  1e-167  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0782  Mg chelatase, subunit ChlI  60.99 
 
 		 510 aa  587  1e-166  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0415  Mg chelatase-related protein  65.14 
 
 		 512 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.189612  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0136  putative enzyme  64.34 
 
 		 512 aa  576  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5418  Mg chelatase, subunit ChlI  65.16 
 
 		 512 aa  572  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.431694  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3140  Mg chelatase, subunit ChlI  64.14 
 
 		 512 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2132  Mg chelatase-related protein  61.58 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0159677  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4601  Mg chelatase, subunit ChlI  60.8 
 
 		 510 aa  568  1e-161  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0677524 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0179  Mg chelatase, subunit ChlI  60.99 
 
 		 516 aa  569  1e-161  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2199  Mg chelatase, subunit ChlI  64.37 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2048  Mg chelatase-related protein  61.58 
 
 		 510 aa  568  1e-160  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0235921  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1815  Mg chelatase, subunit ChlI  63.98 
 
 		 512 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3583  Mg chelatase, subunit ChlI  61.78 
 
 		 510 aa  563  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2620  Mg chelatase, subunit ChlI  62.9 
 
 		 510 aa  564  1.0000000000000001e-159  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0363  hypothetical protein  59.6 
 
 		 510 aa  558  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0335  Mg chelatase, subunit ChlI  62.6 
 
 		 510 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.943186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0209  Mg chelatase, subunit ChlI  64.44 
 
 		 512 aa  557  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228111  normal  0.494559 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3589  Mg chelatase-related protein  65.2 
 
 		 506 aa  558  1e-157  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0452  Mg chelatase-related protein  58.95 
 
 		 500 aa  556  1e-157  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.789016  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1345  Mg chelatase-like protein  55 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4338  Mg chelatase, subunit ChlI  59.4 
 
 		 510 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.91286  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3547  Mg chelatase, subunit ChlI  59.01 
 
 		 532 aa  546  1e-154  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2828  hypothetical protein  58.75 
 
 		 504 aa  539  9.999999999999999e-153  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.173102  normal  0.824664 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0565  Mg chelatase, subunit ChlI  62.75 
 
 		 512 aa  531  1e-150  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.509634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0902  Mg chelatase-related protein  57.26 
 
 		 513 aa  526  1e-148  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3017  Mg chelatase, subunit ChlI  60.12 
 
 		 509 aa  523  1e-147  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0721  Mg chelatase-related protein  52.6 
 
 		 502 aa  519  1e-146  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.059866  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0463  Mg chelatase, subunit ChlI  59.49 
 
 		 512 aa  512  1e-144  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0502  Mg chelatase-related protein  49.8 
 
 		 506 aa  513  1e-144  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1816  Mg chelatase-related protein  59.49 
 
 		 512 aa  511  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.589353  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0196  Mg chelatase, subunit ChlI  57.62 
 
 		 503 aa  505  9.999999999999999e-143  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.11951 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3961  Mg chelatase, subunit ChlI  57.95 
 
 		 510 aa  503  1e-141  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3056  Mg chelatase, subunit ChlI  58.43 
 
 		 509 aa  501  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0532  magnesium chelatase subunit D/I family protein  47.31 
 
 		 500 aa  485  1e-136  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0489  Mg chelatase-related protein  48.41 
 
 		 509 aa  455  1e-127  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00382275  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1768  magnesium chelatase subunit D/I family protein  48.81 
 
 		 513 aa  443  1e-123  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4031  Mg chelatase, subunit ChlI  47.42 
 
 		 509 aa  441  9.999999999999999e-123  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000713525  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2003  Mg chelatase-related protein  49 
 
 		 505 aa  434  1e-120  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0830  Mg chelatase, subunit ChlI  49.61 
 
 		 520 aa  432  1e-120  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0122975  normal  0.219751 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0068  Mg chelatase-related protein  45.51 
 
 		 501 aa  430  1e-119  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0853054  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2510  Mg chelatase-related protein  49.1 
 
 		 496 aa  428  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3780  Mg chelatase, subunit ChlI  46.93 
 
 		 509 aa  427  1e-118  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2058  Mg chelatase, subunit ChlI  43.43 
 
 		 509 aa  425  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00507305  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3159  Mg chelatase-related protein  51.31 
 
 		 504 aa  425  1e-118  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.34745  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07410  Mg chelatase, subunit ChlI  47.23 
 
 		 508 aa  427  1e-118  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2735  Mg chelatase, subunit ChlI  47.35 
 
 		 510 aa  426  1e-118  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0252342  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2143  Mg chelatase, subunit ChlI  45.33 
 
 		 511 aa  427  1e-118  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.518837  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3181  Mg chelatase, subunit ChlI  47.62 
 
 		 509 aa  424  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.114994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0455  Mg chelatase, subunit ChlI  45.44 
 
 		 512 aa  422  1e-117  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00908238  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2915  Mg chelatase, subunit ChlI  47.62 
 
 		 509 aa  425  1e-117  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0525  Fis family transcriptional regulator  48.7 
 
 		 510 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2139  Mg chelatase-related protein  49.79 
 
 		 485 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.299004  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0050  Mg chelatase-related protein  47.69 
 
 		 498 aa  417  9.999999999999999e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.935988  normal  0.306456 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2023  Mg chelatase, subunit ChlI  45.51 
 
 		 509 aa  416  9.999999999999999e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00011944  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0906  Mg chelatase, subunit ChlI  45.65 
 
 		 506 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69840  putative magnesium chelatase  49.9 
 
 		 497 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.324365 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1108  Mg chelatase, subunit ChlI  48.81 
 
 		 509 aa  418  9.999999999999999e-116  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0588  hypothetical protein  44.84 
 
 		 512 aa  412  1e-114  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1706  Mg chelatase, subunit ChlI  44.84 
 
 		 510 aa  414  1e-114  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.518467  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4315  Mg chelatase, subunit ChlI  46.86 
 
 		 509 aa  413  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1394  Mg chelatase-related protein  49.7 
 
 		 499 aa  412  1e-114  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124903  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0354  magnesium chelatase, subunit ChlI  45.15 
 
 		 512 aa  413  1e-114  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.432046 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1523  Mg chelatase, subunit ChlI  49.21 
 
 		 513 aa  410  1e-113  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.653361  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0216  Mg chelatase, subunit ChlI  48.18 
 
 		 517 aa  410  1e-113  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.204007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3233  Mg chelatase-related protein  46.44 
 
 		 513 aa  411  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.424185  normal  0.0608426 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4765  Mg chelatase, subunit ChlI  46.63 
 
 		 509 aa  411  1e-113  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.1435 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1890  Mg chelatase, subunit ChlI  43.96 
 
 		 512 aa  409  1e-113  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4052  Mg chelatase, subunit ChlI  46.44 
 
 		 513 aa  409  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.119195  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3733  Mg chelatase, subunit ChlI  47.01 
 
 		 507 aa  411  1e-113  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.466129  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0119  Mg chelatase, subunit ChlI  47.66 
 
 		 515 aa  409  1e-113  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.145359 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0283  Mg chelatase, subunit ChlI  50.4 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.23119  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0816  Mg chelatase-related protein  46.92 
 
 		 509 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00379185  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5508  Mg chelatase-like protein  49 
 
 		 497 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.132191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0471  Mg chelatase-related protein  48.34 
 
 		 510 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2306  Mg chelatase, subunit ChlI  48.11 
 
 		 505 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0495422  normal  0.127469 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1395  Mg chelatase-related protein  49.4 
 
 		 501 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3170  Mg chelatase, subunit ChlI  47.71 
 
 		 511 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08906  magnesium chelatase subunit ChlI  44.64 
 
 		 512 aa  406  1.0000000000000001e-112  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2637  Mg chelatase, subunit ChlI  46.55 
 
 		 508 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0066  Mg chelatase, subunit ChlI  45.78 
 
 		 512 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0235  Mg chelatase, subunit ChlI  50 
 
 		 496 aa  405  1e-111  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.830549  normal  0.465886 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_858  magnesium chelatase  43.85 
 
 		 506 aa  400  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.102252  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2250  Mg chelatase, subunit ChlI  47.92 
 
 		 511 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.802745 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3646  Mg chelatase, subunit ChlI  45.15 
 
 		 513 aa  402  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0839529 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03657  ComM  49.41 
 
 		 506 aa  401  9.999999999999999e-111  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.478144  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0257  Mg chelatase, subunit ChlI  49.6 
 
 		 497 aa  399  9.999999999999999e-111  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2256  Mg chelatase, subunit ChlI  46.53 
 
 		 554 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0820  Mg chelatase, subunit ChlI  48.44 
 
 		 514 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2125  magnesium chelatase-related protein  45.04 
 
 		 516 aa  395  1e-109  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.69723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0237  Mg chelatase-related protein  48.8 
 
 		 495 aa  397  1e-109  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.176997  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7101  Sigma 54 interacting domain protein  44.84 
 
 		 514 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.746766 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0181  Mg chelatase-related protein  47.05 
 
 		 523 aa  396  1e-109  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>