More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_1006 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_1006  Methyltransferase type 11  100 
 
 
242 aa  494  1e-139  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00471985  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.89 
 
 
345 aa  69.3  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5499  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 
196 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456016  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  32.59 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0490  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0014  putative methylase involved in ubiquinone/menaquinone biosynthesis  34.04 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2735  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  25.83 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0158342 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4806  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  32.77 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3454  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0752  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
214 aa  64.3  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0454  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 
256 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0799871  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0335  Methyltransferase type 11  32.12 
 
 
283 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5011  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5061  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 
256 aa  63.2  0.000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.82 
 
 
205 aa  63.2  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4885  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.85 
 
 
256 aa  62.8  0.000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  30 
 
 
201 aa  62.8  0.000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2358  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
634 aa  62.8  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.295252  hitchhiker  0.00225016 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0842  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.58 
 
 
235 aa  62.4  0.000000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3305  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  28.21 
 
 
199 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0666  hypothetical protein  32.03 
 
 
233 aa  61.2  0.00000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.207992  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  30.08 
 
 
711 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  29.69 
 
 
710 aa  61.2  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45410  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.01 
 
 
253 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.179927  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03490  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.49 
 
 
261 aa  61.2  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1349  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
581 aa  60.8  0.00000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00108025  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5802  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.12 
 
 
256 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  28.47 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0328  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 
283 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0322  Methyltransferase type 11  24.61 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1067  methyltransferase type 11  35.34 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66900  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  23.12 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0427  hypothetical protein  23.9 
 
 
244 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  32.52 
 
 
249 aa  60.5  0.00000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  29.82 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.48 
 
 
236 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2034  methyltransferase  24.83 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00341547  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2225  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.449222  normal  0.183181 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0698  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  24.16 
 
 
246 aa  59.7  0.00000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  27.03 
 
 
243 aa  60.1  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  29.17 
 
 
238 aa  59.3  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0235  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3422  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.89 
 
 
271 aa  59.3  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.352558  normal  0.929536 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
236 aa  58.9  0.00000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0289  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methlytransferase UbiE  28.4 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1968  arsenite S-adenosylmethyltransferase  28.89 
 
 
276 aa  58.9  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.429307  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0466  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  28.4 
 
 
261 aa  58.9  0.00000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000612243 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  28.48 
 
 
235 aa  58.9  0.00000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2107  methyltransferase type 11  28.95 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0523  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.57 
 
 
256 aa  58.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.846514  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6211  Methyltransferase type 11  22.46 
 
 
215 aa  58.5  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
270 aa  58.5  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5105  hypothetical protein  25.5 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0389  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.15 
 
 
256 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2494  hypothetical protein  26.87 
 
 
194 aa  58.5  0.00000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00130351  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1922  Methyltransferase type 11  23.5 
 
 
226 aa  58.5  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07175  ubiE/COQ5 methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G03321)  28.93 
 
 
313 aa  58.2  0.0000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.38441  normal  0.150354 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5150  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase UbiE  25.15 
 
 
256 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  24.59 
 
 
275 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4453  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
527 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0387  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  22.35 
 
 
256 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.108679 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1100  methyltransferase type 11  29.27 
 
 
313 aa  57.8  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  27.33 
 
 
213 aa  58.2  0.0000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3143  hypothetical protein  32.41 
 
 
216 aa  58.5  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0708214  normal  0.0392147 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4444  glycosyl transferase family protein  28.25 
 
 
519 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2907  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.13 
 
 
259 aa  58.2  0.0000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.488187 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
442 aa  58.5  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72050  hypothetical protein  25.32 
 
 
278 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.892313  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2398  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  27.21 
 
 
238 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0448  methyltransferase type 12  28.32 
 
 
307 aa  57.4  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  decreased coverage  0.00834451  normal  0.0296348 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0186  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1769  Methyltransferase type 11  28.07 
 
 
273 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0806  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 
231 aa  57.4  0.0000002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.622934  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0844  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.648831  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0368  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 
365 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0146  methionine biosynthesis protein MetW  29.79 
 
 
194 aa  57.4  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.990375  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0390  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 
194 aa  57.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2760  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.793539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0553  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1849  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 
273 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4293  glycosyl transferase family protein  28.14 
 
 
531 aa  57.4  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4002  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.268063  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  20.56 
 
 
624 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1396  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.482862  normal  0.887166 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 
206 aa  57.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2273  methyltransferase type 11  24.34 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.972016  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0069  demethylmenaquinone methyltransferase  24.86 
 
 
258 aa  57.8  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5219  Methyltransferase type 11  25.32 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0306756 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0667  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2318  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.605839  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0683  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  21 
 
 
243 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2463  methyltransferase type 11  25.4 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.899692  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3237  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  30 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.675115  normal  0.0534893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4117  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase / demethylmenaquinone methyltransferase  22.17 
 
 
245 aa  56.6  0.0000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.930509  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4432  glycosyl transferase family 2  28.5 
 
 
527 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2345  methyltransferase type 11  24.34 
 
 
204 aa  56.6  0.0000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0654899 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2007  methyltransferase type 11  27.66 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3273  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  22.78 
 
 
266 aa  56.6  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0556001  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>