96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0430 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0430  hypothetical protein  100 
 
 
122 aa  250  4e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  6.67584e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0718  cytochrome c class I  38.46 
 
 
457 aa  73.6  8e-13  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0002252  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00360  Cytochrome c-551  36.67 
 
 
104 aa  63.9  6e-10  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.66895  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0728  cytochrome c, class I  35.64 
 
 
110 aa  61.6  3e-09  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0783308 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0692  cytochrome c, class I  35.87 
 
 
104 aa  60.1  9e-09  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.926342 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4930  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
229 aa  57  1e-07  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06740  cytochrome c-551 precursor  30.68 
 
 
104 aa  55.1  3e-07  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2076  cytochrome c class I  33.33 
 
 
140 aa  55.1  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2450  cytochrome c family protein  33.33 
 
 
100 aa  55.1  3e-07  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3134  cytochrome c, class I  33.75 
 
 
129 aa  55.5  3e-07  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7278  cytochrome c class I  28 
 
 
138 aa  55.5  3e-07  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3321  cytochrome c, class I  33.71 
 
 
102 aa  54.7  4e-07  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.344703  hitchhiker  0.0021347 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1476  cytochrome c class I  37.68 
 
 
111 aa  54.3  5e-07  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5332  PKD domain containing protein  28.72 
 
 
909 aa  53.1  1e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0649636  normal  0.493539 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6271  cytochrome c class I  33.33 
 
 
663 aa  53.1  1e-06  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  9.87167e-05  normal  0.709184 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2749  cytochrome c class I  31.63 
 
 
102 aa  52.4  2e-06  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.210292  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4773  cytochrome c class I  32.05 
 
 
669 aa  52.8  2e-06  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.358642  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2205  cytochrome c class I  33.33 
 
 
656 aa  52.8  2e-06  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.170192  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3236  cytochrome c class I  34.57 
 
 
647 aa  52.4  2e-06  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0631004  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0619  cytochrome c-551 precursor  29.55 
 
 
104 aa  51.6  3e-06  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1488  cytochrome c class I  34.67 
 
 
101 aa  52  3e-06  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.02284 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0985  cytochrome c class I  30.21 
 
 
101 aa  50.4  7e-06  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1069  cytochrome c, class I  30.21 
 
 
101 aa  50.4  7e-06  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2468  cytochrome c, class I  35.53 
 
 
115 aa  50.4  7e-06  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.202233  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1783  cytochrome c, class I  35.37 
 
 
106 aa  50.4  8e-06  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.434687  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7275  PKD domain containing protein  32.05 
 
 
1138 aa  49.7  1e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000186518  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5794  cytochrome c, class I  32.91 
 
 
108 aa  48.9  2e-05  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.288359 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1504  cytochrome c, class I  35.71 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.125489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2528  cytochrome c class I  31.43 
 
 
101 aa  48.9  2e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5011  cytochrome c, class I  34.67 
 
 
101 aa  49.3  2e-05  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.259324  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3171  cytochrome c, class I  34.78 
 
 
101 aa  48.5  3e-05  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3220  cytochrome c, class I  30.3 
 
 
101 aa  48.1  4e-05  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.294896  normal  0.453437 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2405  cytochrome c family protein  30.53 
 
 
105 aa  48.1  4e-05  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2050  cytochrome c, class I  34.29 
 
 
105 aa  48.1  4e-05  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.0434258 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3610  hypothetical protein  26.58 
 
 
180 aa  48.1  4e-05  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.853045 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5897  cytochrome c class I  32.26 
 
 
93 aa  48.1  4e-05  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.106259  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2468  cytochrome c class I  30.69 
 
 
108 aa  47.8  5e-05  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2463  cytochrome c, class I  30.69 
 
 
108 aa  47.8  5e-05  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1852  cytochrome c, class I  30.69 
 
 
108 aa  47.8  5e-05  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0431  cytochrome c class I  25.23 
 
 
107 aa  47.8  6e-05  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  5.40538e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3038  cytochrome c, class I  36.84 
 
 
116 aa  47.4  6e-05  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.277662  normal  0.17422 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1693  cytochrome c class I  24.71 
 
 
118 aa  47.4  7e-05  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.504006 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0304  cytochrome c, class I  26.8 
 
 
101 aa  47  8e-05  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  1.45467e-21  normal  0.0822288 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0722  Crp/FNR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
800 aa  47  9e-05  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2726  cytochrome C transmembrane protein  32.18 
 
 
106 aa  47  9e-05  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.502569 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2512  cytochrome c, class I  31.25 
 
 
109 aa  47  9e-05  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0831  cytochrome c class I  33.75 
 
 
145 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2380  cytochrome c class I  31.25 
 
 
109 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3394  cytochrome c, class I  29.79 
 
 
120 aa  45.4  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3145  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
111 aa  45.4  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0318  cytochrome c class I  29.33 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00066919  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1037  cytochrome c class I  32.47 
 
 
96 aa  44.7  0.0004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.692369 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5197  putative cytochrome c  31.88 
 
 
138 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00308424  normal  0.125409 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2099  cytochrome c class I  31.25 
 
 
110 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0021  cytochrome c family protein  32.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.042023  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3816  cytochrome c family protein  32.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.338903  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0559  cytochrome c551/c552  30 
 
 
121 aa  44.3  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.536891 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3179  cytochrome c family protein  32.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1745  cytochrome c family protein  32.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3897  cytochrome c family protein  32.5 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4892  sulfite:cytochrome c oxidoreductase subunit B  27.16 
 
 
218 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0474093 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1025  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.502837  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1650  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.503452  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0293  cytochrome c, class I  31.25 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2336  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.1845  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0675  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.414538  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2813  cytochrome c, class I  31.25 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.250545  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0274  cytochrome c class I  31.25 
 
 
117 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00544484 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2798  cytochrome c family protein  32.5 
 
 
111 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.023573  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2950  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.25349  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0826  cytochrome c subfamily protein  31.25 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0629  putative oxidoreductase cytochrome C552 precursor signal peptide protein  26.32 
 
 
104 aa  43.9  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1018  cytochrome c family protein  31.25 
 
 
107 aa  43.9  0.0008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0243798  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0205  cytochrome c, class I  31.25 
 
 
119 aa  43.5  0.0009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0038  cytochrome c family protein  32.5 
 
 
228 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3346  cytochrome c, class I  30.67 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.817826  normal  0.315535 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7662  cytochrome c, class I  24.55 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.555716  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0219  cytochrome c class I  31.25 
 
 
119 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00518209 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4672  PKD domain containing protein  28.42 
 
 
941 aa  42.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.612479  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4030  PKD domain containing protein  23.16 
 
 
1182 aa  42.7  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.775047 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0344  cytochrome c, class I  31.76 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0270928  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1386  cytochrome c551/c552-like protein  26.21 
 
 
118 aa  42.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.660069  normal  0.798955 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0200  cytochrome c class I  31.25 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.566136  unclonable  5.21394e-12 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1179  cytochrome C552 precursor  31.25 
 
 
171 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3728  cytochrome c class I  28.89 
 
 
102 aa  41.6  0.003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2493  cytochrome c class I  30 
 
 
110 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.291916  normal  0.0913133 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2630  cytochrome c, class I  27.63 
 
 
404 aa  41.6  0.004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.820751  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1986  cytochrome c, class I  28.97 
 
 
101 aa  41.6  0.004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0022172  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3783  cytochrome c class I  25.97 
 
 
355 aa  41.2  0.004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3888  cytochrome c class I  30.86 
 
 
95 aa  41.2  0.005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.148772  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0600  nitric-oxide reductase, C subunit  30.85 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2197  cytochrome c, class I  29.31 
 
 
106 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.353162  hitchhiker  0.00157135 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1484  PKD domain containing protein  25 
 
 
918 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.287223 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2222  cytochrome c class I  28.75 
 
 
108 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.385833  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2088  nitric-oxide reductase subunit C  28.4 
 
 
150 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.601343  normal  0.740001 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1565  cytochrome c class I  30.38 
 
 
179 aa  40.8  0.007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.593251 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>