More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1726 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1726  30S ribosomal protein S18  100 
 
 		 79 aa  161  3e-39  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.146764  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1712  30S ribosomal protein S18  98.73 
 
 		 79 aa  159  2e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000256542  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2501  30S ribosomal protein S18  87.34 
 
 		 81 aa  143  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.171733  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1968  30S ribosomal protein S18  83.33 
 
 		 94 aa  120  5e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.906239  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0009  30S ribosomal protein S18  78.48 
 
 		 78 aa  114  3e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000183869  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0009  ribosomal protein S18  77.27 
 
 		 77 aa  112  2.0000000000000002e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000069363  hitchhiker  0.000000000101757 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4012  30S ribosomal protein S18  68.92 
 
 		 77 aa  105  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.211645  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0012  30S ribosomal protein S18  73.77 
 
 		 106 aa  105  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0166504  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0046  30S ribosomal protein S18  74.63 
 
 		 80 aa  104  4e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3415  30S ribosomal protein S18  65.33 
 
 		 78 aa  103  7e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000533335  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5336  30S ribosomal protein S18  68.92 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000178788  hitchhiker  0.000000190479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5623  30S ribosomal protein S18  68.92 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00085236  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0426  30S ribosomal protein S18  73.13 
 
 		 80 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.0000000528471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5660  30S ribosomal protein S18  68.92 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000002548  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5599  30S ribosomal protein S18  68.92 
 
 		 77 aa  103  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00341857  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0415  30S ribosomal protein S18  73.13 
 
 		 80 aa  103  1e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000675119  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5265  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0224612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5325  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0312656  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5153  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000135632  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5169  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00278275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5721  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000587708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5582  30S ribosomal protein S18  67.57 
 
 		 77 aa  102  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.46232e-17 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3544  30S ribosomal protein S18  69.84 
 
 		 78 aa  95.9  2e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl082  30S ribosomal protein S18  63.93 
 
 		 76 aa  89.7  1e-17  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000103271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1361  ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 84 aa  87  7e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000000314469  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0026  30S ribosomal protein S18  60.32 
 
 		 75 aa  87  8e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1934  ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.250727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2538  ribosomal protein S18  61.67 
 
 		 74 aa  85.5  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000029732  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1669  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1687  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 71 aa  85.1  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2976  30S ribosomal protein S18  51.25 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.00000357277  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2654  30S ribosomal protein S18  51.25 
 
 		 80 aa  84.3  5e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000144955  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1667  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088074  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2928  ribosomal protein S18  61.67 
 
 		 76 aa  84  6e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.296568  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1113  ribosomal protein S18  56.72 
 
 		 83 aa  84  7e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.321408  normal  0.83859 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0601  ribosomal protein S18  64.29 
 
 		 65 aa  83.6  8e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2136  ribosomal protein S18  60 
 
 		 76 aa  83.6  8e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00000146821  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0485  ribosomal protein S18  59.7 
 
 		 75 aa  83.6  8e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000213822  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0902  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 71 aa  83.6  9e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.568033 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0340  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.042391  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10131  30S ribosomal protein S18  60.71 
 
 		 73 aa  83.2  0.000000000000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.249582  hitchhiker  0.00103726 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1641  30S ribosomal protein S18  53.62 
 
 		 75 aa  82.8  0.000000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0283547  normal  0.0346788 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3481  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 98 aa  83.2  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.26859  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0638  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 75 aa  82.4  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000348226  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1338  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0621321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1218  SSU ribosomal protein S18P  52.05 
 
 		 91 aa  82.4  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.386116 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3096  30S ribosomal protein S18  51.47 
 
 		 71 aa  82  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1031  30S ribosomal protein S18  52.17 
 
 		 76 aa  82.4  0.000000000000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4934  30S ribosomal protein S18  56.67 
 
 		 76 aa  82  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000030625  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1528  30S ribosomal protein S18  58.82 
 
 		 90 aa  82  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.602669  normal  0.0304472 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3039  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.230428 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3667  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 91 aa  81.6  0.000000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0312817  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0331  30S ribosomal protein S18  59.32 
 
 		 75 aa  81.6  0.000000000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000798674  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1044  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00000893397  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0130  30S ribosomal protein S18  60 
 
 		 75 aa  81.3  0.000000000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00643171  normal  0.424629 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3488  30S ribosomal protein S18  54.67 
 
 		 79 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.329035  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09911  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1137  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0842555  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1337  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.156602 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0932  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0943286  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0927  30S ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 147 aa  80.9  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000227736  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0021  ribosomal protein S18  50 
 
 		 90 aa  80.9  0.000000000000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00224831  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09931  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09501  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 73 aa  80.9  0.000000000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_915  ribosomal protein S18  50.68 
 
 		 147 aa  80.5  0.000000000000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000043534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23340  ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 70 aa  80.5  0.000000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000096386  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9355  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 78 aa  80.5  0.000000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.792157 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0643  30S ribosomal protein S18  56.52 
 
 		 79 aa  80.5  0.000000000000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0004  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0418254  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2250  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.231321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1402  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.27665  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1893  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.910904  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2103  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 95 aa  80.5  0.000000000000008  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.499514  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1321  30S ribosomal protein S18  58.93 
 
 		 71 aa  80.5  0.000000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000000749157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2414  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.398519  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5172  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1166  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.329961  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2289  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.189033  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2181  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1895  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00156223  hitchhiker  0.0000000574659 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1402  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.494221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6207  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1872  30S ribosomal protein S18  53.95 
 
 		 91 aa  80.5  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.582114  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2460  SSU ribosomal protein S18P  47.37 
 
 		 106 aa  80.1  0.000000000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168294 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1692  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 79 aa  80.1  0.000000000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.240883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2185  30S ribosomal protein S18  54.69 
 
 		 94 aa  80.1  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000547556  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2592  30S ribosomal protein S18  55.88 
 
 		 83 aa  80.1  0.000000000000009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1511  30S ribosomal protein S18  55.56 
 
 		 95 aa  80.1  0.000000000000009  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0596  30S ribosomal protein S18  62.5 
 
 		 90 aa  79.7  0.00000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5173  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 71 aa  79.7  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1328  30S ribosomal protein S18  53.42 
 
 		 75 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.52927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0024  ribosomal protein S18  52.31 
 
 		 86 aa  79.3  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000175752  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2356  30S ribosomal protein S18  52 
 
 		 79 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.160998  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0924  ribosomal protein S18  49.28 
 
 		 74 aa  79.7  0.00000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.373301  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0652  ribosomal protein S18  54.84 
 
 		 81 aa  79.7  0.00000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.144122  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3559  30S ribosomal protein S18  57.35 
 
 		 78 aa  79.3  0.00000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.842484 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14781  30S ribosomal protein S18  55.36 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.120716 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08951  30S ribosomal protein S18  57.14 
 
 		 73 aa  79  0.00000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.519961  decreased coverage  0.000000161977 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11540  SSU ribosomal protein S18P  53.12 
 
 		 87 aa  79  0.00000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0244306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2986  30S ribosomal protein S18  53.33 
 
 		 79 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.574471 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>