67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0042 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0042  glucan binding protein  100 
 
 		 455 aa  884    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.634979  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0017  PcsB protein  52.92 
 
 		 447 aa  409  1e-113  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.228  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0478  surface antigen  76.53 
 
 		 499 aa  280  3e-74  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1762  hypothetical protein  57.66 
 
 		 169 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2534  surface antigen  40.37 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C65  surface antigen  27.1 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4873  cell wall endopeptidase  24.8 
 
 		 440 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4888  cell wall endopeptidase  24.8 
 
 		 440 aa  68.9  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0796  CHAP domain-containing protein  32.39 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0779  CHAP domain-containing protein  32.39 
 
 		 279 aa  68.6  0.0000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.635904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5359  cell wall endopeptidase and peptidase, C40, NLP/P60 family fusion protein  25.78 
 
 		 485 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3731  NLP/P60 protein  28.64 
 
 		 409 aa  67.4  0.0000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00000196287  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5427  endopeptidase lytE  24.48 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.101585  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5043  endopeptidase lytE  24.48 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1430  cell wall hydrolase  44.44 
 
 		 397 aa  67  0.0000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5301  endopeptidase lytE, putative  25.78 
 
 		 513 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5283  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  24.48 
 
 		 436 aa  67  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000121595 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1884  secretory antigen precursor SsaA, putative  43.62 
 
 		 157 aa  65.1  0.000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5314  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  24.3 
 
 		 473 aa  64.3  0.000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00085857  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5644  putative cell wall endopeptidase, NlpC/P60 family  24.3 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000146181  decreased coverage  1.76624e-19 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3187  Peptidase M23  24.05 
 
 		 432 aa  62  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0422  LysM domain-containing protein  26.49 
 
 		 266 aa  62.4  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1286  Tn5252, Orf28  31.01 
 
 		 933 aa  61.2  0.00000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0191  M24/M37 family peptidase  27.81 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0318  LysM domain-containing protein  42.11 
 
 		 266 aa  59.7  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.460625  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4988  NLP/P60 protein  25.6 
 
 		 448 aa  58.9  0.0000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0704  CHAP domain-containing protein  40 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000444371  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0189  M24/M37 family peptidase  27.81 
 
 		 399 aa  58.5  0.0000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2567  CHAP domain-containing protein  41.24 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2620  CHAP domain-containing protein  41.24 
 
 		 143 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0761  LysM domain-containing protein  40 
 
 		 156 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0689  CHAP domain-containing protein  40 
 
 		 265 aa  58.2  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00699042  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0272  CHAP domain-containing protein  38.04 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0265  CHAP domain-containing protein  38.04 
 
 		 300 aa  57.8  0.0000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0100  LysM domain-containing protein  38.78 
 
 		 324 aa  56.2  0.000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.54299  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2120  secretory antigen precursor SsaA-related protein  38.54 
 
 		 143 aa  55.8  0.000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1437  3D domain-containing protein  26.18 
 
 		 410 aa  55.8  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00168198  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0574  3D domain-containing protein  24.55 
 
 		 416 aa  54.7  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2724  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.96 
 
 		 619 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1799  Peptidase M23  22.86 
 
 		 379 aa  54.7  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.935113  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2668  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  35.96 
 
 		 619 aa  54.7  0.000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0599  3D domain-containing protein  23.08 
 
 		 431 aa  53.1  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2263  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  34.69 
 
 		 655 aa  52.8  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1243  hypothetical protein  26.83 
 
 		 410 aa  51.6  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.015154  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2199  aspartate protease family protein  29.41 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.312004  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0812  hypothetical protein  22.73 
 
 		 427 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.791616  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0740  hypothetical protein  22.27 
 
 		 424 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000128558 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0752  hypothetical protein  22.17 
 
 		 427 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.861863  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2167  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.37 
 
 		 574 aa  48.5  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00273194  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0685  hypothetical protein  22.27 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00231685  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0595  hypothetical protein  22.27 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0651  hypothetical protein  22.27 
 
 		 420 aa  48.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0716  hypothetical protein  21.72 
 
 		 423 aa  47  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.663265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4620  hypothetical protein  21.72 
 
 		 424 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00944224 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2323  CHAP domain-containing protein  42 
 
 		 267 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.404818  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0596  hypothetical protein  22.27 
 
 		 419 aa  47  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2366  CHAP domain-containing protein  42 
 
 		 267 aa  47  0.0007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.38467  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00310  CHAP domain-containing protein  45.16 
 
 		 302 aa  46.6  0.0009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1784  surface antigen protein  35.14 
 
 		 318 aa  46.2  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1683  immunogenic secreted protein, putative  34.78 
 
 		 512 aa  46.2  0.001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00328189  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1033  surface antigen  36.25 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3071  peptidase M23B  24.12 
 
 		 374 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000167566  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2905  Peptidase M23  28.51 
 
 		 375 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0202823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3964  Peptidase M23  20.75 
 
 		 376 aa  43.9  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000173675  hitchhiker  0.00000000427958 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4930  peptidase M23B  29.57 
 
 		 438 aa  43.5  0.008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3002  Peptidase M23  21.4 
 
 		 448 aa  43.5  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00185035  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5057  M24/M37 family peptidase  29.57 
 
 		 438 aa  43.5  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>