252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_1760 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_1760  AzlC family protein  100 
 
 		 230 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2694  AzlC family protein  92.17 
 
 		 255 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2528  AzlC family protein  90.87 
 
 		 255 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2595  AzlC family protein  91.3 
 
 		 231 aa  414  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1459  AzlC family protein  89.5 
 
 		 293 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.878975  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2782  AzlC family protein  87.34 
 
 		 285 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.568271  normal  0.166375 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1561  AzlC family protein  87.34 
 
 		 273 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1567  AzlC family protein  87.34 
 
 		 273 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1598  AzlC family protein  88.11 
 
 		 273 aa  396  1e-109  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.185514  normal  0.410872 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3237  AzlC family protein  75.42 
 
 		 286 aa  355  3.9999999999999996e-97  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000344272  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3139  AzlC family protein  75.59 
 
 		 238 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.707917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2538  AzlC family protein  75.94 
 
 		 245 aa  325  2.0000000000000001e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06280  hypothetical protein  58.45 
 
 		 247 aa  258  6e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001440  AzlC family protein  56.34 
 
 		 236 aa  252  4.0000000000000004e-66  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1188  putative branched-chain amino acid transport protein  59.02 
 
 		 237 aa  250  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0235  AzlC family protein  60.59 
 
 		 239 aa  248  4e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38160  hypothetical protein  55.66 
 
 		 252 aa  230  1e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0013657 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3248  hypothetical protein  55.19 
 
 		 247 aa  228  6e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.351031  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3299  AzlC-like  56.34 
 
 		 232 aa  215  5e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1991  AzlC family protein  53.81 
 
 		 230 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.823633  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2385  AzlC family protein  53.85 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3310  AzlC family protein  53.85 
 
 		 230 aa  195  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.294738  normal  0.172837 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2854  putative branched-chain amino acid transport protein AzlC  48.61 
 
 		 242 aa  191  6e-48  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.608526  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1897  AzlC family protein  54.76 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1356  AzlC family protein  45.79 
 
 		 246 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2443  branched-chain amino acid exporter, LIV- E family  42.72 
 
 		 246 aa  176  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.324306 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3800  AzlC family protein  43.72 
 
 		 244 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3612  AzlC family protein  42.79 
 
 		 244 aa  172  5e-42  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.271764  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3295  AzlC family protein  39.25 
 
 		 258 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2107  AzlC family protein  36.44 
 
 		 244 aa  142  3e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413868 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4209  branched chain amino acid efflux pump, AzlCD (extrudes azaleucine)  36.56 
 
 		 255 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000558659  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3606  AzlC family protein  34.62 
 
 		 228 aa  129  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.776584  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2936  AzlC family protein  36.84 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000187359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1691  AzlC family protein  40.36 
 
 		 249 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0039071  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0804  AzlC family protein  37.26 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0112465  normal  0.194655 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1048  branched chain amino acid efflux pump LivE  36.36 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0218893  normal  0.990506 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0972  AzlC family protein  42.94 
 
 		 257 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00116086  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0976  AzlC family protein  42.94 
 
 		 257 aa  125  5e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000153015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2539  branched-chain amino acid transport protein AzlC  31.33 
 
 		 250 aa  124  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0525733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0617  AzlC-like  36.12 
 
 		 280 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.152652  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1096  AzlC family protein  36.12 
 
 		 255 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000023066  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1055  AzlC family protein  37.95 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0170281  normal  0.980601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2207  AzlC family protein  36.56 
 
 		 292 aa  123  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0109045  normal  0.696476 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0495  AzlC-like  32.59 
 
 		 257 aa  116  3.9999999999999997e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.294752  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0434  AzlC-like protein  29.46 
 
 		 265 aa  115  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.72937  normal  0.152736 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0007  AzlC family protein  31.6 
 
 		 246 aa  112  4.0000000000000004e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0092  AzlC family protein  29.81 
 
 		 228 aa  107  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4125  AzlC-like  33.49 
 
 		 233 aa  107  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4071  AzlC family protein  33.19 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0922  AzlC-like protein  33.7 
 
 		 229 aa  99.8  3e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.376984  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2851  AzlC-like protein  36.19 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.537039  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0739  branched chain amino acid efflux pump, large (AzlC) subunit  28.89 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2393  AzlC family protein  28.89 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3971  AzlC family protein  31.72 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.312774  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0404  AzlC family protein  31.02 
 
 		 242 aa  93.6  3e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.54377 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0389  AzlC family protein  30.56 
 
 		 242 aa  92  7e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2457  AzlC family protein  28.57 
 
 		 235 aa  92  8e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.201604  normal  0.404255 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3483  AzlC family protein  30.91 
 
 		 243 aa  90.5  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1756  AzlC family protein  35.48 
 
 		 240 aa  90.5  2e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1996  AzlC-like  32.44 
 
 		 241 aa  89.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3327  AzlC family protein  30.91 
 
 		 246 aa  89.4  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1381  AzlC family protein  32.23 
 
 		 234 aa  89.4  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.690005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2568  AzlC family protein  34.13 
 
 		 233 aa  88.2  1e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1772  AzlC family protein  32.73 
 
 		 241 aa  87.4  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3739  AzlC family protein  33.18 
 
 		 248 aa  87  2e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.301924 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0661  AzlC family protein  29.49 
 
 		 239 aa  85.9  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0710886  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3053  AzlC family protein  30.69 
 
 		 240 aa  85.9  5e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1599  AzlC family protein  32.73 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.732241  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1562  branched-chain amino acid transport protein  32.73 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1722  AzlC family protein  32.73 
 
 		 241 aa  85.5  6e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1795  AzlC family protein  31.48 
 
 		 241 aa  85.5  7e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1598  AzlC family protein  31.34 
 
 		 242 aa  85.1  8e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.829588  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1603  AzlC family protein  30.6 
 
 		 238 aa  85.1  9e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315939  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0513  hypothetical protein  28.24 
 
 		 242 aa  84.7  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0568797 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3602  AzlC family protein  31.02 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1850  AzlC family protein  31.48 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1551  branched-chain amino acid transport protein  32.27 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1741  AzlC family protein  31.02 
 
 		 241 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1470  AzlC family protein  34.3 
 
 		 247 aa  84  0.000000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.555433  normal  0.0212209 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0768  AzlC family protein  29.17 
 
 		 234 aa  83.6  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.390341  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1241  AzlC-like  29.81 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0311  AzlC family protein  29.51 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3198  putative azaleucine resistance protein AzlC  30.6 
 
 		 257 aa  83.6  0.000000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1025  AzlC family protein  28.57 
 
 		 238 aa  83.2  0.000000000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0979622  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3335  AzlC family protein  30.6 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2569  AzlC family protein  31.89 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2174  AzlC family protein  29.48 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3456  putative azaleucine resistance protein AzlC  30.6 
 
 		 257 aa  82.8  0.000000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0497  AzlC-like protein  27.78 
 
 		 266 aa  82.4  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.896063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1955  AzlC-like protein  34.64 
 
 		 242 aa  82.4  0.000000000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.552602  normal  0.748996 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1415  AzlC family protein  28.64 
 
 		 240 aa  82  0.000000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.430613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1048  AzlC family protein  34.12 
 
 		 239 aa  81.6  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.635435 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0158  AzlC family protein  32.79 
 
 		 307 aa  81.3  0.00000000000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00265817  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0732  AzlC family protein  38.65 
 
 		 217 aa  81.6  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.100734  normal  0.28736 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0893  AzlC family protein  28.77 
 
 		 250 aa  81.6  0.00000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.188368  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3535  AzlC family protein  26.89 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.485711  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0861  AzlC family protein  31.86 
 
 		 237 aa  80.9  0.00000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3757  AzlC-like  25.68 
 
 		 242 aa  79.7  0.00000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0350  AzlC family protein  33.95 
 
 		 238 aa  79.7  0.00000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.303967  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3194  transporter, branched chain amino acid exporter (LIV-E) family  30.84 
 
 		 245 aa  79.3  0.00000000000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>