More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0634 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0634  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  100 
 
 		 499 aa  961    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2446  cobyric acid synthase CobQ  61.3 
 
 		 509 aa  521  1e-146  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.117915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7399  adenosylcobyric acid synthase (glutamine- hydrolyzing)  59.36 
 
 		 509 aa  518  1e-146  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6023  cobyric acid synthase CobQ  57.34 
 
 		 529 aa  518  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.945282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0558  cobyric acid synthase CobQ  60.94 
 
 		 511 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5883  cobyric acid synthase CobQ  59.07 
 
 		 509 aa  491  1e-137  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1288  cobyric acid synthase CobQ  58.13 
 
 		 501 aa  484  1e-135  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00711481  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2603  cobyric acid synthase  57.43 
 
 		 520 aa  474  1e-132  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.478422  normal  0.158438 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2744  cobyric acid synthase CobQ  54.44 
 
 		 512 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0267335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4863  cobyric acid synthase  60 
 
 		 508 aa  467  9.999999999999999e-131  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00498054  normal  0.404957 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17700  cobyric acid synthase  54.62 
 
 		 498 aa  457  1e-127  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0379411  normal  0.993656 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3928  cobyric acid synthase CobQ  54.31 
 
 		 575 aa  452  1.0000000000000001e-126  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.111937  normal  0.0307354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3554  cobyric acid synthase CobQ  53.49 
 
 		 521 aa  451  1e-125  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0360  cobyric acid synthase  53.96 
 
 		 491 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0971172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2509  cobyric acid synthase  55.44 
 
 		 495 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.15189  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10258  cobyric acid synthase  54.66 
 
 		 494 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0479101 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1613  cobyric acid synthase CobQ  53.92 
 
 		 527 aa  433  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0377  cobyric acid synthase  51.81 
 
 		 490 aa  430  1e-119  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0138  cobyric acid synthase  51.86 
 
 		 486 aa  427  1e-118  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2128  cobyric acid synthase CobQ  49.7 
 
 		 517 aa  421  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.347874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2880  cobyric acid synthase  52.93 
 
 		 476 aa  415  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2034  cobyric acid synthase  52.03 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0326425 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2051  cobyric acid synthase  52.03 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.831815  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1693  cobyric acid synthase CobQ  49 
 
 		 507 aa  406  1.0000000000000001e-112  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0137801  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2097  cobyric acid synthase  52.03 
 
 		 495 aa  408  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0722506  normal  0.329562 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000116  cobyric acid synthase  44.01 
 
 		 485 aa  397  1e-109  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4113  cobyric acid synthase  49.18 
 
 		 490 aa  397  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0309  cobyric acid synthase  50.7 
 
 		 501 aa  392  1e-108  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05724  cobyric acid synthase  44.19 
 
 		 475 aa  394  1e-108  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3127  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  46.17 
 
 		 500 aa  393  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2606  cobyric acid synthase  44.18 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0717  cobyric acid synthase  44.11 
 
 		 534 aa  389  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2157  cobyric acid synthase  46.45 
 
 		 485 aa  389  1e-107  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.711251  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0820  adenosylcobyric acid synthase (glutamine-hydrolysing)  42.86 
 
 		 503 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2354  cobyric acid synthase  42.23 
 
 		 506 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.066722 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1560  cobyric acid synthase  43.54 
 
 		 503 aa  391  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47690  cobyric acid synthase  48.56 
 
 		 490 aa  391  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00733771  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1848  cobyric acid synthase CobQ  50.1 
 
 		 496 aa  387  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1456  cobyric acid synthase CobQ  48.47 
 
 		 495 aa  388  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.727464  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1018  cobyric acid synthase CobQ  39.6 
 
 		 494 aa  388  1e-106  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2241  cobyric acid synthase  42.43 
 
 		 506 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.386357  normal  0.07507 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1098  cobyric acid synthase  44.84 
 
 		 517 aa  387  1e-106  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2195  cobyric acid synthase  42.03 
 
 		 513 aa  387  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0300  cobyric acid synthase  42.01 
 
 		 507 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0936  cobyric acid synthase CobQ  43.56 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.164528  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_807  cobyric acid synthase  42.86 
 
 		 503 aa  384  1e-105  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2141  cobyric acid synthase  42.23 
 
 		 506 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0783  cobyric acid synthase  43.44 
 
 		 495 aa  382  1e-105  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2188  cobyric acid synthase  41.19 
 
 		 506 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1677  cobyric acid synthase  46.25 
 
 		 484 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1304  cobyric acid synthase CobQ  44.42 
 
 		 514 aa  380  1e-104  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0240  cobyric acid synthase  42.97 
 
 		 485 aa  379  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1276  cobyric acid synthase  46.97 
 
 		 484 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.651231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1705  cobyric acid synthase  39.6 
 
 		 501 aa  381  1e-104  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1236  cobyric acid synthase  46.68 
 
 		 484 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.170511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0845  cobyric acid synthase  43.39 
 
 		 541 aa  380  1e-104  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33080  cobyric acid synthase  49.48 
 
 		 485 aa  381  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0282392  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1112  cobyric acid synthase  40.39 
 
 		 513 aa  382  1e-104  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3275  cobyric acid synthase  43.19 
 
 		 541 aa  379  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21140  cobyric acid synthase  45.58 
 
 		 508 aa  377  1e-103  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0144  cobyric acid synthase  47.46 
 
 		 487 aa  375  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4042  cobyric acid synthase  45.83 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1002  cobyric acid synthase  43.21 
 
 		 556 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1030  cobyric acid synthase  45.54 
 
 		 518 aa  375  1e-103  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0980  cobyric acid synthase  43.65 
 
 		 526 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0666  cobyric acid synthase  43.42 
 
 		 484 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3361  cobyric acid synthase  43.05 
 
 		 560 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1755  cobyric acid synthase  48.03 
 
 		 483 aa  375  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.438055  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1713  cobyric acid synthase  46.46 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3676  cobyric acid synthase  46.68 
 
 		 486 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0301884  normal  0.0393979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0484  cobyric acid synthase  43.79 
 
 		 864 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1045  cobyric acid synthase  49.09 
 
 		 535 aa  373  1e-102  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0844  cobyric acid synthase  50.31 
 
 		 520 aa  374  1e-102  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3177  cobyric acid synthase  43 
 
 		 541 aa  374  1e-102  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0871  cobyric acid synthase CobQ  43.29 
 
 		 777 aa  373  1e-102  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.383971  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1014  cobyric acid synthase  43.65 
 
 		 565 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.727995 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0765  cobyric acid synthase  45.77 
 
 		 502 aa  372  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0697  cobyric acid synthase  48.89 
 
 		 512 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.342942  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1200  cobyric acid synthase  49.09 
 
 		 585 aa  371  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0181  cobyric acid synthase CobQ  46.89 
 
 		 494 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0190399  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1628  cobyric acid synthase  48.89 
 
 		 529 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.115512  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2778  cobyric acid synthase  48.36 
 
 		 505 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.475019  normal  0.720274 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0041  cobyric acid synthase CobQ  44.42 
 
 		 787 aa  371  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2971  cobyric acid synthase  48.89 
 
 		 523 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.106945  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1039  cobyric acid synthase  48.89 
 
 		 545 aa  372  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.999214  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2316  cobyric acid synthase  48.89 
 
 		 531 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  decreased coverage  0.0037254  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2390  cobyric acid synthase  47.94 
 
 		 495 aa  369  1e-100  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0066766 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1038  cobyric acid synthase  42.72 
 
 		 510 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0665  cobyric acid synthase  48.47 
 
 		 488 aa  368  1e-100  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2958  cobyric acid synthase  41.81 
 
 		 534 aa  367  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2198  cobyric acid synthase  47.14 
 
 		 481 aa  367  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.170201 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3093  cobyric acid synthase  41.19 
 
 		 515 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.546568  normal  0.0117123 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0848  cobyric acid synthase  47.57 
 
 		 501 aa  363  3e-99  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1683  cobyric acid synthase CobQ  44.81 
 
 		 858 aa  363  3e-99  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3539  cobyric acid synthase CobQ  44.2 
 
 		 776 aa  363  4e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.714834  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0103  cobyric acid synthase  43.89 
 
 		 483 aa  363  5.0000000000000005e-99  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0279  cobyric acid synthase  44.42 
 
 		 489 aa  362  8e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2705  cobyric acid synthase CobQ  42.77 
 
 		 512 aa  362  9e-99  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554279  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1999  cobyric acid synthase  47.36 
 
 		 492 aa  361  1e-98  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2203  cobyric acid synthase  46.38 
 
 		 484 aa  361  1e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0873321  normal  0.914907 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>