269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0138 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0138  hypothetical protein  100 
 
 
292 aa  553  1e-156  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0024  protein of unknown function DUF6 transmembrane  49.63 
 
 
297 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2142  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.93 
 
 
308 aa  145  8.000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5197  hypothetical protein  38.43 
 
 
288 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5662  hypothetical protein  38.43 
 
 
288 aa  145  9e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.318352 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0201  protein of unknown function DUF6 transmembrane  36.15 
 
 
283 aa  140  3e-32  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000909393  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1320  hypothetical protein  32.53 
 
 
301 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00383072  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3407  hypothetical protein  34.57 
 
 
292 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.263015  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0128  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.34 
 
 
301 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1658  transporter, EamA family  32.65 
 
 
303 aa  133  3e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1510  hypothetical protein  32.99 
 
 
301 aa  132  6e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1763  transporter, EamA family  32.3 
 
 
303 aa  132  7.999999999999999e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1713  EamA family protein  32.3 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.461189  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1690  transporter, EamA family  32.65 
 
 
303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1506  EamA family protein  32.65 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116622  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1478  drug/metabolite exporter family protein  32.65 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.187087  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1468  drug/metabolite exporter family protein  32.65 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.855355  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1622  eama family protein  32.65 
 
 
303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6006  protein of unknown function DUF6 transmembrane  40.07 
 
 
315 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.509599  normal  0.86931 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3687  transporter, EamA family  32.62 
 
 
301 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0726  hypothetical protein  35.84 
 
 
298 aa  130  3e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00203734  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2288  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.76 
 
 
302 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000440436 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1134  hypothetical protein  37.46 
 
 
319 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.159672  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1125  hypothetical protein  36.8 
 
 
294 aa  123  3e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1260  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33.1 
 
 
312 aa  122  7e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000194009  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1311  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.69 
 
 
302 aa  122  8e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.0220544 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1436  DMT family permease  34.52 
 
 
301 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.529495 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2894  hypothetical protein  38.35 
 
 
288 aa  119  6e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.240372 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2297  hypothetical protein  32.51 
 
 
286 aa  118  9e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1605  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.36 
 
 
296 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.97109  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1656  permeases of the drug/metabolite transporter  30.98 
 
 
307 aa  112  6e-24  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0349  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.06 
 
 
294 aa  112  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.19753  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2039  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.54 
 
 
301 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000102698  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3208  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.44 
 
 
304 aa  110  3e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4151  hypothetical protein  31.93 
 
 
299 aa  110  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05950  permease of the drug/metabolite transporter (DMT) superfamily  34.44 
 
 
293 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0068  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.58 
 
 
304 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1481  hypothetical protein  30.29 
 
 
294 aa  109  6e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000470662  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0052  hypothetical protein  36.88 
 
 
304 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0960  drug/metabolite transporter family permease  31.79 
 
 
296 aa  108  1e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000594198  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1424  transporter, drug/metabolite exporter family  28.87 
 
 
305 aa  106  5e-22  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0056  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.83 
 
 
304 aa  106  5e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3690  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.29 
 
 
296 aa  105  6e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0058387  hitchhiker  0.0000000000902258 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0266  hypothetical protein  32.29 
 
 
310 aa  105  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000402657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17660  hypothetical protein  34.3 
 
 
308 aa  104  1e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0350  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.28 
 
 
290 aa  104  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1018  hypothetical protein  29.79 
 
 
288 aa  103  4e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.735408  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0073  hypothetical protein  29.45 
 
 
282 aa  102  7e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1112  hypothetical protein  28.82 
 
 
288 aa  101  1e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0643  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.71 
 
 
297 aa  101  1e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.598507  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0053  hypothetical protein  36.68 
 
 
300 aa  101  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.261978 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3221  hypothetical protein  32.12 
 
 
307 aa  101  1e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.575238  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0545  hypothetical protein  34.43 
 
 
308 aa  100  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0094  membrane protein  29.69 
 
 
322 aa  101  2e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2881  hypothetical protein  31.37 
 
 
336 aa  100  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0923868  hitchhiker  0.00000000000229015 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1536  hypothetical protein  32.87 
 
 
297 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1728  permeases of the drug/metabolite transporter  27.5 
 
 
302 aa  99.8  4e-20  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1290  hypothetical protein  35.02 
 
 
323 aa  100  4e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0457  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.33 
 
 
313 aa  99.4  6e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1507  hypothetical protein  30.07 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1457  hypothetical protein  30.07 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.550804  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0720  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.62 
 
 
289 aa  96.7  4e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000349572  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0163  hypothetical protein  26.52 
 
 
288 aa  96.7  4e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.532161  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3750  hypothetical protein  29.8 
 
 
307 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0979614  normal  0.188727 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1518  hypothetical protein  35.09 
 
 
307 aa  96.7  4e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.372898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3187  hypothetical protein  32.51 
 
 
300 aa  96.3  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.589109 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3091  hypothetical protein  31.9 
 
 
294 aa  96.3  6e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2141  hypothetical protein  33.77 
 
 
320 aa  95.9  7e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.648455  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2231  hypothetical protein  34.01 
 
 
358 aa  95.9  8e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4892  hypothetical protein  32.4 
 
 
307 aa  95.5  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.131621  hitchhiker  0.000211269 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  35.42 
 
 
252 aa  95.5  1e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00124524  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3442  hypothetical protein  32.99 
 
 
314 aa  94.7  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.996427  normal  0.320096 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1939  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.79 
 
 
343 aa  94.7  2e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0893718  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3509  hypothetical protein  34.01 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0160994 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2742  protein of unknown function DUF6 transmembrane  32.39 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.651085  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1480  permeases of the drug/metabolite transporter  28.14 
 
 
306 aa  94.7  2e-18  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000101724  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1682  hypothetical protein  29.73 
 
 
299 aa  94  3e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2977  hypothetical protein  34.43 
 
 
309 aa  91.7  1e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3251  hypothetical protein  32.73 
 
 
311 aa  90.9  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0184302  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3447  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.03 
 
 
308 aa  90.5  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000182923 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0849  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.25 
 
 
290 aa  90.5  3e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.266368  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0944  hypothetical protein  28.73 
 
 
279 aa  89.7  5e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1854  hypothetical protein  34.33 
 
 
316 aa  89.7  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.135486 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1658  hypothetical protein  30.43 
 
 
300 aa  89.7  5e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2237  hypothetical protein  31.58 
 
 
300 aa  89.4  7e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.274588  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1817  hypothetical protein  34.4 
 
 
305 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0149863  hitchhiker  0.000661803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0146  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.8 
 
 
293 aa  88.6  1e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.373624  normal  0.289625 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3674  hypothetical protein  31.46 
 
 
307 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.393093 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3470  hypothetical protein  33.69 
 
 
312 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.461647  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1360  hypothetical protein  31.6 
 
 
296 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.170247  hitchhiker  0.00808749 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4511  hypothetical protein  31.46 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.2378  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0401  protein of unknown function DUF6 transmembrane  28.68 
 
 
300 aa  87.4  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.217733  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3853  hypothetical protein  31.46 
 
 
309 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2736  hypothetical protein  29.26 
 
 
295 aa  87  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3544  protein of unknown function DUF6 transmembrane  29.65 
 
 
293 aa  87  3e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340303  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0814  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.39 
 
 
308 aa  87  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24860  DMT(drug/metabolite transporter) superfamily permease  31.23 
 
 
290 aa  86.7  4e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0835  hypothetical protein  26.6 
 
 
295 aa  86.7  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2556  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.32 
 
 
302 aa  86.3  6e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0782604  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1796  permeases of the drug/metabolite transporter  29.26 
 
 
292 aa  86.3  6e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.463066  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>