43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_1941 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2582  hypothetical protein  88.32 
 
 		 369 aa  648    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1941  hypothetical protein  100 
 
 		 393 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.86402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1240  hypothetical protein  87.28 
 
 		 394 aa  687    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.314539  normal  0.831655 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0026  hypothetical protein  66.75 
 
 		 395 aa  534  1e-150  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3938  hypothetical protein  57.49 
 
 		 429 aa  446  1.0000000000000001e-124  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.350729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0483  hypothetical protein  58.15 
 
 		 395 aa  423  1e-117  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5945  hypothetical protein  50.77 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0007  hypothetical protein  49.33 
 
 		 410 aa  369  1e-101  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2664  hypothetical protein  45.7 
 
 		 386 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.164078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0028  hypothetical protein  44.92 
 
 		 420 aa  293  3e-78  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1278  hypothetical protein  45.35 
 
 		 367 aa  293  5e-78  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1797  putative exported protein of unknown function  45.58 
 
 		 427 aa  291  2e-77  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.227031  normal  0.544981 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1846  hypothetical protein  45.14 
 
 		 429 aa  290  3e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2181  hypothetical protein  45.14 
 
 		 422 aa  290  4e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.376116 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5317  hypothetical protein  44.38 
 
 		 424 aa  287  2e-76  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0865725  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5013  hypothetical protein  43.27 
 
 		 423 aa  286  4e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.333808  normal  0.0166676 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3146  hypothetical protein  41.67 
 
 		 412 aa  285  8e-76  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2721  hypothetical protein  41.55 
 
 		 423 aa  281  2e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1948  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  39.78 
 
 		 391 aa  272  6e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.105929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4870  hypothetical protein  42.74 
 
 		 408 aa  266  4e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.128964 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1537  hypothetical protein  41.73 
 
 		 408 aa  265  7e-70  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.505562  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2412  hypothetical protein  43.53 
 
 		 411 aa  265  8e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3621  hypothetical protein  43.99 
 
 		 402 aa  262  8e-69  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0789115 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1336  hypothetical protein  41.47 
 
 		 408 aa  261  1e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616275 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2258  hypothetical protein  37.84 
 
 		 400 aa  261  2e-68  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2612  hypothetical protein  41.18 
 
 		 416 aa  256  4e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0743279  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1891  hypothetical protein  36.19 
 
 		 408 aa  255  8e-67  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.999876  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3093  ABC-type branched-chain amino acid transport systems periplasmic component-like protein  40.22 
 
 		 397 aa  254  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.239597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1858  hypothetical protein  39.09 
 
 		 405 aa  251  1e-65  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3133  hypothetical protein  40.11 
 
 		 392 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.637765 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0722  hypothetical protein  36.81 
 
 		 402 aa  200  3.9999999999999996e-50  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.126756 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2846  hypothetical protein  37.83 
 
 		 394 aa  195  1e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.194777  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4978  hypothetical protein  35.61 
 
 		 406 aa  178  2e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.638405  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1795  hypothetical protein  36.43 
 
 		 391 aa  171  3e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000175604 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3037  hypothetical protein  36.75 
 
 		 393 aa  169  1e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.245994  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2901  extracellular ligand-binding receptor  23.42 
 
 		 419 aa  63.5  0.000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0430  extracellular ligand-binding receptor  23.2 
 
 		 445 aa  58.2  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.249043 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3698  Extracellular ligand-binding receptor  25.6 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4699  extracellular ligand-binding receptor  22.02 
 
 		 432 aa  54.3  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.525381 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3574  hypothetical protein  22.39 
 
 		 413 aa  53.9  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3901  inner-membrane translocator  23.85 
 
 		 413 aa  51.6  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.295568 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4645  extracellular ligand-binding receptor  24.69 
 
 		 415 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.142564 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5162  putative substrate-binding periplasmic (pbp) ABC transporter protein  23.4 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.15516  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>