More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A3771 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007643  Rru_A3771  PhoH-like protein  100 
 
 
322 aa  645    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3618  PhoH family protein  59.56 
 
 
342 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1354  PhoH family protein  60.39 
 
 
333 aa  363  2e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0963523  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0069  PhoH family protein  55.22 
 
 
363 aa  352  4e-96  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0287585 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0047  putative phosphate starvation-inducible protein, PhoH-like protein  54.6 
 
 
345 aa  333  2e-90  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.959569 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0981  PhoH-like protein  54.17 
 
 
348 aa  333  3e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0241  PhoH-like protein  53.02 
 
 
351 aa  331  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0022  PhoH-like protein  53.97 
 
 
349 aa  330  1e-89  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.232507  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0451  PhoH family protein  52.81 
 
 
351 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0015  PhoH-like protein  53.97 
 
 
349 aa  330  2e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.945712  normal  0.0639944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0591  PhoH-like protein, phosphate starvation inducible  53.02 
 
 
344 aa  330  2e-89  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0041  PhoH family protein  53.54 
 
 
351 aa  328  6e-89  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000833124 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0469  PhoH-like protein  53.02 
 
 
352 aa  327  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.803585 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0438  phosphate starvation inducible protein  55.31 
 
 
357 aa  327  2.0000000000000001e-88  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.695996  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2388  PhoH family protein  54.98 
 
 
360 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.156507  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3920  PhoH-like protein  54.63 
 
 
348 aa  326  4.0000000000000003e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0030  PhoH family protein  52.63 
 
 
349 aa  325  5e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.04719 
 
 
-
 
NC_004310  BR2155  PhoH family protein  55.45 
 
 
327 aa  324  1e-87  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0868609  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0757  PhoH family protein  54.46 
 
 
353 aa  323  2e-87  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.899998  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0018  PhoH family protein  53.7 
 
 
350 aa  323  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.28473 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1016  PhoH family protein  54.11 
 
 
337 aa  322  4e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0442383  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2067  PhoH family protein  55.13 
 
 
327 aa  322  6e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0286047  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0638  PhoH family protein  54.6 
 
 
338 aa  319  3.9999999999999996e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.622943 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0188  PhoH-like protein  53.16 
 
 
338 aa  315  5e-85  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2063  PhoH-like protein  52.85 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.590057 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0700  PhoH-like protein  52.34 
 
 
373 aa  312  3.9999999999999997e-84  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.233967 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1811  PhoH family protein  52.19 
 
 
379 aa  311  9e-84  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.147763  normal  0.55964 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1244  PhoH family protein  51.38 
 
 
370 aa  311  9e-84  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3599  hypothetical protein  50.77 
 
 
346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3284  PhoH family protein  50.77 
 
 
346 aa  307  1.0000000000000001e-82  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3692  PhoH family protein  51.62 
 
 
375 aa  304  1.0000000000000001e-81  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.316664  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3873  hypothetical protein  50.46 
 
 
339 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.504084  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3400  PhoH family protein  53.18 
 
 
368 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0161796  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3181  PhoH family protein  52.7 
 
 
365 aa  303  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0246823  normal  0.0183443 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1056  PhoH family protein  53.53 
 
 
341 aa  303  3.0000000000000004e-81  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.563658  normal  0.821458 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3529  PhoH family protein  52.85 
 
 
368 aa  302  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.556211  normal  0.320113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3205  PhoH family protein  52.85 
 
 
368 aa  301  7.000000000000001e-81  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0234  PhoH family protein  52.7 
 
 
369 aa  300  2e-80  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.253584  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3701  PhoH family protein  51.95 
 
 
335 aa  300  2e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.933672  normal  0.818626 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0492  PhoH family protein  51.62 
 
 
335 aa  299  4e-80  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.307318  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2896  PhoH family protein  50.16 
 
 
355 aa  299  5e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.434704 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0574  PhoH family protein  45.48 
 
 
322 aa  297  1e-79  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.184118  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2747  PhoH family protein  50.3 
 
 
348 aa  297  2e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0636869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4241  PhoH family protein  51.59 
 
 
316 aa  296  3e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.220372 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0604  PhoH family protein  49.7 
 
 
348 aa  296  4e-79  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2722  PhoH family protein  49.7 
 
 
348 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.72441  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2082  PhoH-like protein  49.7 
 
 
348 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2694  PhoH family protein  49.7 
 
 
348 aa  296  5e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0530  PHOH-like protein  52.6 
 
 
325 aa  295  7e-79  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.159561  normal  0.089115 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2611  PhoH family protein  49.7 
 
 
348 aa  294  1e-78  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.126253  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12330  hypothetical protein  48.4 
 
 
340 aa  292  5e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0225  PhoH family protein  49.4 
 
 
352 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2437  PhoH family protein  49.4 
 
 
352 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2357  PhoH family protein  49.4 
 
 
352 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2721  PhoH family protein  49.4 
 
 
352 aa  291  9e-78  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0709  PhoH family protein  49.11 
 
 
354 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.95861  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1127  hypothetical protein  47.76 
 
 
340 aa  291  1e-77  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0650  PhoH-like protein  49.52 
 
 
328 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1340  PhoH family protein  48.34 
 
 
328 aa  291  1e-77  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0134835  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0723  PhoH family protein  49.11 
 
 
354 aa  291  1e-77  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0888  PhoH family protein  49.11 
 
 
354 aa  290  2e-77  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.437404  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6022  PhoH-like protein  49.39 
 
 
348 aa  290  2e-77  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.611976  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0474  PhoH-like protein  50.33 
 
 
322 aa  290  2e-77  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0422  PhoH family protein  50.79 
 
 
330 aa  290  2e-77  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0590  PhoH family protein  48.83 
 
 
358 aa  290  2e-77  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.178371  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0866  PhoH family protein  50.82 
 
 
339 aa  290  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1071  PhoH-like protein  48.83 
 
 
333 aa  289  4e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1436  PhoH family protein  49.36 
 
 
326 aa  289  4e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.384314 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2705  PhoH-like protein  51.83 
 
 
319 aa  288  7e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.595006 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1353  PhoH family protein  51.13 
 
 
328 aa  288  1e-76  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000248045  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1815  PhoH family protein  48.49 
 
 
323 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.294918  normal  0.443651 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0452  PhoH-like protein  50.96 
 
 
331 aa  287  2e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010717  normal  0.615683 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2721  PhoH-like protein  49.18 
 
 
354 aa  286  4e-76  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.602788  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2739  PhoH family protein  49.37 
 
 
328 aa  286  5e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2713  PhoH family protein  48.85 
 
 
356 aa  285  5.999999999999999e-76  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.787993  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1231  putative ATP-binding protein in pho regulon  49.37 
 
 
339 aa  285  7e-76  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000466652  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0411  PhoH family protein  47.18 
 
 
362 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.234067 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2230  PhoH family protein  48.03 
 
 
329 aa  285  1.0000000000000001e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.148579  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4067  PhoH family protein  49.67 
 
 
316 aa  284  2.0000000000000002e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.579724 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3950  PhoH family protein  49.37 
 
 
374 aa  283  3.0000000000000004e-75  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.493956 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1225  PhoH family protein  49.52 
 
 
323 aa  283  4.0000000000000003e-75  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0407  PhoH family protein  50.47 
 
 
330 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0842646 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1558  PhoH family protein  47.87 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.400448  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0629  putative PhoH-family protein  46.75 
 
 
359 aa  281  7.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.518903 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0513  PhoH-like protein  49.84 
 
 
341 aa  281  8.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2813  PhoH family protein  47.02 
 
 
359 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2905  PhoH family protein  47.02 
 
 
359 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.21329  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2696  PhoH-like protein  49.51 
 
 
346 aa  281  1e-74  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2303  PhoH family protein  48.24 
 
 
361 aa  281  1e-74  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.76142  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3538  PhoH-like protein  49.16 
 
 
359 aa  281  1e-74  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3528  PhoH-like protein  50 
 
 
340 aa  280  2e-74  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.959961  normal  0.0258567 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1733  PhoH family protein  49.21 
 
 
326 aa  280  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2426  PhoH family protein  47.47 
 
 
320 aa  280  2e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000154292  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2910  PhoH family protein  49.04 
 
 
348 aa  279  4e-74  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3247  PhoH family protein  48.99 
 
 
348 aa  279  4e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00788722  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3330  PhoH family protein  47.62 
 
 
357 aa  279  5e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.128023 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00447  ATP-binding protein  50.49 
 
 
328 aa  279  6e-74  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  decreased coverage  0.000644199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0483  phoH family protein  50.32 
 
 
367 aa  278  9e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000530716  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0779  PhoH family protein  49.33 
 
 
331 aa  277  1e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2295  PhoH family protein  47.78 
 
 
354 aa  277  1e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>